Rchr
J-GLOBAL ID:200901077148297194
Update date: Nov. 16, 2024
Matsumoto Masaki
Matsumoto Masaki
Affiliation and department:
Job title:
Professor
Homepage URL (1):
https://omics.med.niigata-u.ac.jp/index.html
Research field (1):
Cell biology
Research keywords (5):
システム生物学
, 質量分析
, バイオインフォマティクス
, プロテオミクス
, Proteomics
Research theme for competitive and other funds (50):
- 2024 - 2029 A Study on Elucidating Obesity and Lifestyle Diseases through the Epigenome-RNA Modification Axis
- 2024 - 2027 Extracellular matrix controlled stem cell differentiation and its application toward the regeneration of periodontal ligament
- 2022 - 2026 Cancer cell fate control by long-chain ncRNAs that regulate the gene specificity of epigenome factors
- 2023 - 2026 次世代バイオものづくりを駆動する高度オミクス計測・解析基盤の開発
- 2022 - 2025 高密度かつ機能的な定量プロテオミクスによる細胞老化の分子基盤の解明
- 2020 - 2025 未開拓プロテオームの同定・定量技術の開発
- 2022 - 2024 in-situビオチン化プロテオミクスによるタンパク質状態の定量化技術の開発
- 2021 - 2024 Proteome analysis of periodontal ligament matrix and development of regenerative material
- 2019 - 2024 癌転移形質に寄与する核内非翻訳RNAの探索と抗体分子架橋による次世代核酸薬の創出
- 2018 - 2023 プロテオームデータベースの機能深化と連携基盤強化
- 2020 - 2022 情報/仮説駆動型プロテオゲノミクス戦略の構築
- 2020 - 2022 1細胞定量分子フェノタイプ解析に向けた微量試料自動前処理装置の開発
- 2019 - 2021 高出力絶対定量法の開発によるシグナル伝達経路定量マップの構築
- 2019 - 2021 1配偶子定量プロテオミクスによる配偶子インテグリティ評価マーカー探索
- 2015 - 2020 細胞チップMSシステムを用いた1細胞マルチ分子フェノタイピング
- 2017 - 2020 The build-up study on the functionality of medicinal mushroom Ganoderma lingzhi based on Japanese genomic editing technology
- 2016 - 2019 Analysis of the mechanism of HSF1 transcription complex by evolutional approach
- 2017 - 2019 次世代定量プロテオミクスによるがん悪性進展機構の解明
- 2017 - 2019 精密定量プロテオミクスを用いたシグナル伝達の包括的解析
- 2017 - 2019 トランスオミクス解析による低酸素応答のシステム的理解
- 2016 - 2019 シングルセル・プロテオミクスによるがん幹細胞特性解明
- 2015 - 2018 Elucidation of insulin signal transduction mechanism with mathematical analysis of network dynamics
- 2015 - 2018 Screening of essential ICB associate factors for spermatogenesis to understand male infertility
- 2015 - 2018 プロテオーム統合データベースの構築
- 2016 - 2017 Elucidating the metabolic enzymes network in hypoxic cells using next-generation proteomics
- 2013 - 2017 Molecular mechanisms of crosstalk between DNA-damage response and signal transduction
- 2015 - 2017 水酸化プロテオーム解析を基軸とした酸素応答システムの統合的理解
- 2014 - 2016 多階層オミクス動態解析に基づく代謝制御システム解明
- 2013 - 2016 多次元プロテオミクスによる細胞内パスウェイ構造決定法の確立
- 2013 - 2015 次世代定量プロテオミクスによる発癌ネットワーク同定
- 2012 - 2014 トランスオミクス解析によるシグナル伝達ー代謝ー転写制御間の接点解明
- 2011 - 2013 Quantitative phosphoproteomics analysis of the TORC1 signaling
- 2010 - 2012 情報基盤定量プロテオミクスによるヒトプロテオームの絶対定量
- 2010 - 2012 Novel functions and regulatory mechanisms of tumor suppressor Mig-6
- 2009 - 2011 高感度定量プロテオミクスを用いたユビキチンリガーゼ基質探索
- 2008 - 2010 大規模リン酸化プロテオーム解析による細胞周期制御機構の解明
- 2007 - 2009 ユビキチン化関連酵素E4Bによる神経変性防御機構の解明
- 2008 - 2009 Network analysis of signal transduction by quantitative phosphoproteomics
- 2008 - 2009 Duplin/CHD8によるp53の機能抑制と発がんに関する研究
- 2006 - 2008 リン酸化ペプチドの網羅的解析のための新技術開発
- 2006 - 2008 異常タンパク質蓄積による神経変性疾患発症の分子機構の解明
- 2007 - 2008 神経変性疾患における膜輸送システムの関与の解析
- 2006 - 2007 ProtrudinによるRabおよび膜輸送の制御機構の解析
- 2006 - 2007 神経管形成における多機能シャペロンFKBP38の機能解析
- 2006 - 2007 ユビキチンリガーゼCdc4/Fbw7変異にともなう組織特異的細胞増殖機構の解明
- 2006 - 2007 p53シグナルを抑制する新規がん遺伝子Duplinの発見と機能解析
- 2006 - タンパク質翻訳後修飾の網羅的解析に関する研究
- 2001 - 2003 発癌に関与するユビキチンリガーゼBRCA1の機能解析
- ユビキチン-プロテアソーム系によるタンパク質分解に関する研究
- Study on Ubiquitin-proteasome dependent proteolotic system
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Papers (155):
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Shujiro Okuda, Akiyasu C Yoshizawa, Daiki Kobayashi, Yushi Takahashi, Yu Watanabe, Yuki Moriya, Atsushi Hatano, Tomoyo Takami, Masaki Matsumoto, Norie Araki, et al. jPOST environment accelerates the reuse and reanalysis of public proteome mass spectrometry data. Nucleic Acids Research. 2024
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Ko Igami, Hiroki Kittaka, Mikako Yagi, Kazuhito Gotoh, Yuichi Matsushima, Tomomi Ide, Masataka Ikeda, Saori Ueda, Shin-Ichiro Nitta, Manami Hayakawa, et al. iMPAQT reveals that adequate mitohormesis from TFAM overexpression leads to life extension in mice. Life science alliance. 2024. 7. 7
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Yunfan Bai, Keigo Morita, Toshiya Kokaji, Atsushi Hatano, Satoshi Ohno, Riku Egami, Yifei Pan, Dongzi Li, Katsuyuki Yugi, Saori Uematsu, et al. Trans-omic analysis reveals opposite metabolic dysregulation between feeding and fasting in liver associated with obesity. iScience. 2024. 27. 3. 109121-109121
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Takehiro Yamamoto, Tetsu Hayashida, Yohei Masugi, Kiyotaka Oshikawa, Noriyo Hayakawa, Mai Itoh, Chiyoko Nishime, Masami Suzuki, Aiko Nagayama, Yuko Kawai, et al. PRMT1 sustains de novo fatty acid synthesis by methylating PHGDH to drive chemoresistance in triple-negative breast cancer. Cancer research. 2024
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Godfried Dougnon, Takayoshi Otsuka, Yuka Nakamura, Akiko Sakai, Tomoyuki Yamanaka, Noriko Matsui, Asa Nakahara, Ai Ito, Atsushi Hatano, Masaki Matsumoto, et al. Extracellular disposal of nuclear waste by APP: a protective mechanism impaired in Alzheimer’s disease. 2024
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MISC (72):
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高橋悠志, 吉沢明康, 小林大樹, 守屋勇樹, 幡野敦, 高見知代, 松本雅記, 荒木令江, 田畑剛, 田畑剛, et al. Accelerating data re-analysis in jPOST using metadata from JPDM data papers. 日本プロテオーム学会大会プログラム・抄録集. 2024. 2024 (Web)
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滝田 紗恵, 梅林 修平, 佐藤 友紀, 妹尾 奈波, 赤堀 拓, 三好 規之, 杉浦 悠毅, 井上 菜穂子, 川名 裕己, 幡野 敦, et al. LPGAT1/LPLAT7による骨格筋中リン脂質のアシル基リモデリング機構の解明とLPGAT1/LPLAT7欠損が骨格筋機能に及ぼす影響. 脂質生化学研究. 2023. 65. 46-49
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金光祥臣, 小林大樹, 中谷航太, 和泉自泰, 馬場健史, 松本雅記. Development of a method for absolute quantification of the major metabolomes of cancer cells using LC-MS/MS and its application to metabolic analysis. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2023. 46th
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市原知哉, 松本有樹修, 幡野敦, 松本雅記, 茶谷悠平, 田口英樹, 中山敬一. eIF2D counteracts intrinsic ribosome destabilization (IRD) during translation elongation. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2022. 45th
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和泉自泰, 秦康祐, 中谷航太, 山村昌平, 松本雅記, 馬場健史. ナノ液体クロマトグラフィー質量分析を基盤としたシングルセル分子フェノタイプ解析法の開発. 日本生化学会大会(Web). 2021. 94th
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Patents (2):
Lectures and oral presentations (21):
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タンパク質の精密定量による生命システムの定量的描出
(生体コモンスペース研究会 2021)
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ペプチド先導型プロテオミクス〜精密で信頼性の高いタンパク質定量技術〜
(CBI Annual Meeting 2020 2020)
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多重ターゲットプロテオミクスを用いたタンパク質動態解析
(第93回日本生化学会大会 2020)
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iMPAQT ver.2: New platform for protein absolute quantification of proteins of interest. 29th Hot Spring Harbor Symposium 2020年2月6-7, Fukuoka
(29th Hot Spring Harbor Symposium 2020)
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定量プロテオーム解析のための内部標準ペプチド作成の標準化や共有化について
(日本プロテオーム学会 2019)
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Education (4):
- - 1998 Fukuoka University
- - 1998 Fukuoka University Graduate School, Division of Natural Science
- - 1993 Fukuoka University Faculty of Science
- - 1993 Fukuoka University Faculty of Science
Professional career (1):
Work history (8):
- 2019/08 - 現在 Niigata University Department of Omics and Systems Biology, Professor
- 2020/04 - 2023/03 九州大学 生体防御医学研究所 客員教授
- 2009/01 - 2020/03 Kyushu University Medical Institute of Bioregulation
- 2007/04 - 2008/12 Kyushu University Medical Institute of Bioregulation
- 2004/04 - 2007/03 Kyushu University Medical Institute of Bioregulation
- 2001/04 - 2004/03 Kyushu University Medical Institute of Bioregulation
- 1999 - 2001 Kyushu University Medical Institute of Bioregulation
- 1998 - 1999 科学技術振興事業団 派遣職員(技術員)
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Committee career (2):
- 2024/01 - 2025/12 日本プロテオーム学会 理事・会長
- 2015/01 - 2020/12 Japanese Proteomics Society General Council Member
Awards (1):
- 2017/07 - 日本プロテオーム学会 日本プロテオーム学会賞
Association Membership(s) (2):
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