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J-GLOBAL ID：200901078895380536 Update date: Oct. 15, 2024

Yura Kei

ユラケイ | Yura Kei

Affiliation and department：
Job title： Professor
Other affiliations (7)：

Ochanomizu University Graduate School of Humanities and Sciences, Education Organization, Doctral Program Life Sciences Professor
Ochanomizu University Graduate School of Humanities and Sciences, Education Organization, Master's Program Life Sciences Professor
Ochanomizu University Faculty of Science Biology Professor
Ochanomizu University Headquarters for International Affairs Global Collaboration Center Professor
Ochanomizu University Transdisciplinary Human-Centered Engineering Professor

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Homepage URL (1)： http://www-p.sci.ocha.ac.jp/yuralab/

Research field (4)： Biophysics , Systems genomics , Genomics , Biological, health, and medical informatics

Research keywords (2)： Biophysics , Computational biology

Research theme for competitive and other funds (37)：

2021 - 2024 Elucidation of the egg diapause mechanism of the Teleogryllus emma based on comparative transcriptome analysis
2019 - 2024 Building Inventory of Evolution and Luminescent Mechanisms of Bioluminescent Proteins
2018 - 2023 A novel functional antigen receptor TMD module identified as an SLE-associating SNP-related structure
2017 - 2020 Quantitative evaluation of disinfection mechanism using techniques of cell biology and computational biology
2015 - 2018 The roles of the G-quadruplex-binding activity of human ORC in replication origin establishment

2013 - 2016 Comprehensive prediction of RNA-protein interactinos

2008 - 2010 Identification of novel DOPA ligands and electrophysiological analysis of DOPA-induced response

2007 - 2009 Elucidation of the binding mode of DNA repair promoting protein to strand breaks

2006 - 2009 Studying Function of Alternative Splicing Products Based on Protein Structure Modeling

2007 - 2008 Development of a method to obtain information for prediction of interacting structres of biomolecules

2005 - 2007 低分解能生体分子像からの原子構造構築技法

2004 - 2006 Function annotation of DNA repair related proteins using molecular evolution information and computer simulation of protein dynamics

2004 - 2004 タンパク質の多様性獲得戦略の解明に基づいたゲノム情報の解読

2004 - 2004 遺伝子同時転写単位同定にもとづく新規DNA修復関連タンパク質の予測

2000 - 2004 Decoding of genome function and evolution based on the 3D structures of proteins

2003 - 2003 進化情報を用いたDNA修復酵素複合体の相互作用部位予測

2002 - 2002 全ゲノム配列比較にもとづくDNA修復酵素の比較と分類

2001 - 2002 モジュール3Dキーノートを用いたゲノム機能予測法の開発

1999 - 2002 Protein function and module shuffling

1999 - 2002 Development of a method to predict protein function based on module classification

2002 - DNA損傷修復関連タンパク質の構造と機能

2001 - ゲノムからの蛋白質構造機能予測

1999 - 2000 金属イオン結合モジュールの金属配位様式の共通性・多様性

1995 - 1999 Protein structure, comparison, prediction, and design

1997 - 1998 リン酸基結合モジュールにもとづくDNA結合部位の推定

1996 - 1998 タンパク質モジュールとエクソンとの対応の普遍性

1997 - 1997 転写因子のモジュール・ドメイン構成とシグナル認識

1996 - 1997 Development of design method to get soluble protein

1996 - 1996 DNAリン酸基に結合するモジュールは共通か

1996 - 1996 転写因子のモジュール・ドメイン構成とシグナル認識

1995 - 1995 リン酸を結合する複数のタンパク質に存在する共通のモジュール

1995 - 1995 転写因子のモジュール・ドメイン構成とシグナル認識

1994 - 1995 Classification of Protein Modules

1994 - 1994 シトクロムP-450camとCamリプレッサーとの共通構造

1994 - 1994 転写因子のモジュール・ドメイン構成とシグナル認識

1990 - 蛋白質分子の構造, 機能及び進化

Structure, function and evolution of protein

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Papers (141)：

Natalia Rzepecka, Yoko Ito, Kei Yura, Emi Ito, Tomohiro Uemura. Identification of a novel Golgi-localized putative glycosyltransferase protein in <i>Arabidopsis thaliana</i>. Plant Biotechnology. 2024. 41. 1. 35-44
Mayu Shibata, Xingcheng Lin, José N. Onuchic, Kei Yura, Ryan R. Cheng. Residue coevolution and mutational landscape for OmpR and NarL response regulator subfamilies. Biophysical Journal. 2024. 123. 6. 681-692
由良敬, 松永浩子, 細川正人, 和泉自泰, 村松知成, 福永津嵩, 浜田道昭, 馬場健史, 竹山春子. 【あなたのラボから薬を生み出すアカデミア創薬の実践 All JAPAN体制の先端技術支援を利用した創薬の最前線】(第1章)最新の疾患標的分子の探索・評価技術シングルセル/微小組織マルチオミクス解析. 実験医学. 2024. 42. 2. 199-204
Kohyoh Murata, Kosuke Kataoka, Ryuto Sanno, Kazuhiro Satomura, Atsushi Ogura, Toru Asahi, Kei Yura, Takeshi Suzuki. Complete mitochondrial genome sequences of two ground crickets, Dianemobius fascipes nigrofasciatus and Polionemobius taprobanensis (Orthoptera: Grylloidea: trigonidiidae). Mitochondrial DNA Part B. 2023. 8. 12. 1311-1315
Atsushi Hijikata, Tairo Oshima, Kei Yura, Yoshitaka Bessho. ThermusQ: Toward the cell simulation platform for Thermus thermophilus. The Journal of general and applied microbiology. 2023

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MISC (125)：

武田直樹, 新井優香, 鈴木伽奈, 片岡孝介, 由良敬, 由良敬, 白藤(梅宮)梨可, GHAZY N.A., 森光太郎, 刑部正博, et al. Whole genome sequencing and multi-omics analysis of starvation response in Neoseiulus californicus. 日本ダニ学会誌. 2023. 32. 1
鈴木愛菜, 伊倉貞吉, 三野流斗, 片岡孝介, 朝日透, 鈴木丈詞, 森光康次郎, 由良敬, 由良敬, 由良敬, et al. Exploration of the taurine biosynthetic pathway in the cricket superfamily. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2023. 46th
佐々木元子, 川目裕, 松尾真理, 小杉眞司, 櫻井晃洋, 由良敬, 高島響子, 李怡然, 松川愛未, 大住理沙, et al. 難病医療における遺伝カウンセリングに関する動画教材の作成. 日本遺伝カウンセリング学会誌. 2022. 43. 2. 144-144
早川翔大, 片岡孝介, 阿左美優花, 由良敬, 由良敬, 鈴木丈詞, 朝日透, 朝日透. コオロギの社会実装に向けた学際的研究. 日本応用動物昆虫学会大会講演要旨. 2022. 66th
三宅秀彦, 小杉眞司, 櫻井晃洋, 松尾真理, 川目裕, 佐々木元子, 由良敬, 高島響子, 李怡然, 神原容子, et al. 難病ゲノム医療に対応した遺伝カウンセリングの実態調査と教育システムの構築に資する研究難病を対象とした遺伝カウンセリングの現状調査とゲノム医療における方法論の検討. 難病ゲノム医療に対応した遺伝カウンセリングの実態調査と教育システムの構築に資する研究令和3年度総括研究報告書(Web). 2022

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Books (5)：

実験医学別冊創薬研究のための相互作用解析パーフェクト
YODOSHA 2021
ニューバイオフィジックス 2 遺伝子の構造生物学(共著)
共立出版 1998
Helix-turn-helix module distribution and module shuffling.(共著)
Tracing Biological Evolution in Protein and Gene Structures 1995
Module Structure and Function of Glutamyl-tRNA Synthetase.(共著)
Tracing Biological Evolution in Protein and Gene Structures 1995
Some remark on protein folding(共著)
Protein Structural Analysis, Folding and Design 1990

Lectures and oral presentations (11)：

Dark Enzymes Dark Proteinsに光を当てるために
(第23回名古屋大学遺伝子実験施設公開セミナー 2023)
大脳皮質第5層錐体細胞におけるシナプス入力の時空間的クラスタリングと入力同時性検出機能の関係解析
(第46回日本分子生物学会年会 2023)
コオロギ科の染色体レベル全ゲノム塩基配列に基づく性分化機構の解明
(第46回日本分子生物学会年会 2023)
コオロギ上科におけるタウリン生合成経路の探索
(第46回日本分子生物学会年会 2023)
Data integration platform for extracting new knowledge from Thermus thermophilus
(第96回日本生化学会大会 2023)

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Education (7)：

- 1999 Nagoya University
1990 - 1993 Nagoya University Graduate School Faculty of Science Department of Biology
- 1993 Nagoya University Graduate School, Division of Natural Science
1988 - 1990 Waseda University Graduate School School of Science and Engineering Physics and Applied Physics
1984 - 1988 Waseda University Department of Science and Engineering Applied Physics

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Professional career (2)：

(BLANK) (Waseda University)
(BLANK) (Nagoya University)

Work history (5)：

2019/05/01 - 現在 Ochanomizu University Headquarters for Research and Innovation, Research Advancement Division, Education and Research Department Center for Interdisciplinary AI and Data Science Vice Director
2017/04/01 - 現在 Waseda University School of Advanced Science and Engineering Professor
2016/04/01 - 2019/03/31 Ochanomizu University President
Waseda University Faculty of Science and Engineering
Ochanomizu University Graduate School of Humanities and Sciences Professor

Committee career (3)：

2019/10/01 - 2020/10/01 日本生物物理学会 2020年会実行委員会副委員長
2011/01 - 2012/12 The Biophysical Society of Japan vice president
2007 - 日本生物物理学会運営委員

Association Membership(s) (4)：

米国生物物理学会 , 日本蛋白質科学会 , 日本分子生物学会 , 日本生物物理学会

※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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