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J-GLOBAL ID：200901079684463091
Update date: Apr. 11, 2024
Honda Yoichi
ホンダ ヨイチ | Honda Yoichi
Affiliation and department：
Job title：
Associate Professor,Associate Professor
Homepage URL (1)：
http://www.biomass.kais.kyoto-u.ac.jp/
Research field (5)：
Applied microbiology
, Landscape science
, Environmental agriculture
, Wood science
, Molecular biology
Research keywords (9)：
transformation
, genetic engineering
, basidomycetes
, 環境農学
, 分子遺伝学
, 応用微生物学
, バイオマス変換学
, 分子生物学
, Molecular Biology
Research theme for competitive and other funds (31)：
- 2022 - 2028 Genetic pollution caused by edible mushrooms cultivation in east Asia and its technical solution
- 2022 - 2026 Isolation of a safe and eco-friendly cultivar in Lentinula edodes by developing new genome editing technologies
- 2021 - 2026 Mycelial factory for production of biopharmaceuticals using synthetic biology
- 2020 - 2023 Bilateral approach using post-genomics and genome editing to elucidate wood decomposition system
- 2018 - 2022 Surveys and mechanism elucidation of genetic pollution caused by edible mushrooms cultivation in east Asia
- 2018 - 2022 Modification of the protein secretory system in wood rot fungi
- 2019 - 2021 Biopharmaceuticals production by combining wood-rot fungi and enzymatic transglycosylation
- 2019 - 2021 Phase specific omics on wood wafers and genome editing elucidate mechanism for white rot
- 2015 - 2018 Platform formation for pharmaceutical glycoprotein production system in wood rot fungus
- 2013 - 2015 Challenge for production of therapic glyco-peptides using gene expression system in wood rot fungi
- 2009 - 2012 Characterization of unique properties in expression of ligninolytic enzymes by white-rot fungi
- 2008 - 2010 Evaluation of diversity of wood-deteriorating organisms in tropical plantation forests in search for sustainable management
- 2007 - 2009 Analytical studies on functions and biosynthesis of metabolism-controlling hydrophobic factors produced by white rot fungus
- 2004 - 2007 Bio-processing of preservative-treated timbers with biodegrading agents and new energy oplions
- 2004 - 2007 Molecular breeding of white rot basidiomycete for efficient saccharification in biomass conversion process
- 2004 - 2005 Treatment of the fermentation inhibitors from wood by Trametes versicolor RC3 Laccase
- 2002 - 2003 遺伝子組換え担子菌を用いた内分泌攪乱物質分解システムの構築
- 2001 - 2002 染色体工学を用いた選択的リグニン分解菌の分子育種
- 2001 - 2001 リグニン分解系を強化した組換え担子菌による内分泌撹乱物質の分解
- 2000 - 2001 Analysis op-oxidation mchanism of white rot fungi that promate lignin degradation by addition of polyisoprene rubber ; Application to resurce conversion and bioremediation
- 1999 - 2000 選択的リグニン分解菌の遺伝子工学的解析
- 1996 - 1997 Studies on ligninolytic activities of ruminant microbes
- 1996 - 1996 人工的にデザインされたDNA複製オリジンを用いた糸状菌レプリコンの設計
- 1995 - 1995 担子菌のリグニン分解酵素系の分子生物学的解析と自律複製型ベクターの開発
- 1994 - 1994 担子菌類における自律複製型ベクター系の開発-広宿主域プラスミドの宿主非依有性ブライミングシステムの応用
- 森林生物の遺伝的多樣性の解析
- 木材腐朽菌における遺伝子発現系の開発
- 担子菌のリグニン分解系の分子生物学的解析
- Molecules genetical analysis of biodiversity in forestry organisms
- Development of host-vector systems in wood-rot fungi
- Molecular biological analysis of lignin bio-degradation by basidiomycetes
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Papers (190)：
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Takeshi Kobukata, Takehito Nakazawa, Fuga Yamasaki, Junko Sugano, Minji Oh, Moriyuki Kawauchi, Masahiro Sakamoto, Yoichi Honda. Identification of two genes essential for basidiospore formation during the postmeiotic stages in Pleurotus ostreatus. Fungal genetics and biology : FG & B. 2024. 103890-103890
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Takehito Nakazawa, Moriyuki Kawauchi, Yuitsu Otsuka, Junxian Han, Daishiro Koshi, Kim Schiphof, Lucía Ramírez, Antonio G Pisabarro, Yoichi Honda. Pleurotus ostreatus as a model mushroom in genetics, cell biology, and material sciences. Applied microbiology and biotechnology. 2024. 108. 1. 217-217
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Kazuhiro Kurebayashi, Takehito Nakazawa, Shivani, Yuta Higashitarumizu, Moriyuki Kawauchi, Masahiro Sakamoto, Yoichi Honda. Visualizing organelles with recombinant fluorescent proteins in the white-rot fungus Pleurotus ostreatus. Fungal Biology. 2023. 127. 10-11. 1336-1344
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Hyerang Eom, Yeon-Jae Choi, Rutuja Nandre, Hui-Gang Han, Sinil Kim, Minseek Kim, Youn-Lee Oh, Takehito Nakazawa, Yoichi Honda, Hyeon-Su Ro. The Cas9-gRNA ribonucleoprotein complex-mediated editing of pyrG in Ganoderma lucidum and unexpected insertion of contaminated DNA fragments. Scientific reports. 2023. 13. 1. 11133-11133
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Takehito Nakazawa, Iori Yamaguchi, Yufan Zhang, Chinami Saka, Hongli Wu, Keita Kayama, Moriyuki Kawauchi, Masahiro Sakamoto, Yoichi Honda. Experimental evidence that lignin-modifying enzymes are essential for degrading plant cell wall lignin by Pleurotus ostreatus using CRISPR/Cas9. Environmental microbiology. 2023. 25. 10. 1909-1924
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MISC (424)：
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小島隼星, 亀井志乃, 名和義順, 大塚唯, 河内護之, 寺内裕貴, 吉見啓, 田中千尋, 矢野成和, 中沢威人, et al. Characterization of cell wall synthesis regulatory transcription factors Mbp1 and Rlm1 in basidiomycete Pleurotus ostreatus. 日本木材学会大会研究発表要旨集(完全版)(CD-ROM). 2023. 73rd
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坂本正弘, 長谷川智彦, 河内護之, 中沢威人, 本田与一. Analysis of xylan synthase genes in grasses. 日本木材学会大会研究発表要旨集(完全版)(CD-ROM). 2023. 73rd
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大塚唯, 河内護之, 辻健也, 吉見啓, 田中千尋, 中沢威人, 矢野成和, 本田与一. 細胞壁多糖三重染色法の開発により見えてきた木材腐朽菌にユニークな細胞壁構造. 応用糖質科学. 2023. 13. 3
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河内護之, 名和義順, 大塚唯, 寺内裕貴, 吉見啓, 田中千尋, 阿部啓悦, 代田修, 矢野成和, 中沢威人, et al. Unique cell wall structure of basidiomycete focused on α-1,3-glucan in Pleurotus ostreatus. 日本木材学会大会研究発表要旨集(完全版)(CD-ROM). 2023. 73rd
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河内護之, 名和義則, 大塚唯, 辻健也, 吉見啓, 田中千尋, 阿部啓悦, 矢野成和, 中沢威人, 本田与一. 木材腐朽菌の細胞壁合成機構の理解を目的としたグルカン合成酵素の解析. 応用糖質科学. 2023. 13. 3
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Patents (5)：
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真正担子菌のリグニン分解能を増加させる方法
-
薬剤耐性遺伝子の利用
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リグノセルロース分解作用を有する白色腐朽菌及びその利用
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新規薬剤耐性遺伝子
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特許 薬剤耐性遺伝子
Books (16)：
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Biological activities of mushrooms and their application development
CMC Publisher 2021
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機能性糖質素材の開発と食品への応用II (普及版)
2020
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きのこの生理機能と応用開発の展望
S&T出版 2017
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機能性糖質素材の開発と食品への応用II
シーエムシー出版 2014
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講座 生存基盤論6 持続型生存基盤論 ハンドブック
京都大学学術出版会 2012
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Lectures and oral presentations (77)：
-
Genome editing and post-genomics in mushrooms
(Seminar, University of Giessen, Germany 2023)
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Genome editing and post-genomics in mushrooms
(Seminar, Public Univeristy Navarra 2023)
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Development of safe genome editing techniques and sporeless cultivars in P. ostreatus
(Seminar, NIHHS, RDA, Korea 2023)
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CRISPR/Cas9 Technology in Mushrooms for Sustainable Future of the Planet and Human Health
(10th ICMBMP 2023)
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ゲノム工学を用いた 白色腐朽菌の科学と新たな可能性
(日本木材学会生物劣化研究会 2022)
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Works (3)：
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担子菌類における高効率な形質転換系の開発 ホクト
2000 -
-
ヒラタケ細胞を使った組換えマンガンペルオキシダーゼの大量生産に関する研究 豊田中央研究所
2000 -
-
担子菌類の形質転換に関する研究 タカラアグリ
2000 -
Education (2)：
- - 1992 Kyoto University
- - 1987 Kyoto University Faculty of Agriculture
Professional career (1)：
- Doctor of Agricultural Science (Kyoto University)
Work history (14)：
- 2022/04 - 現在 京都大学大学院 農学研究科 森林科学専攻 教授
- 2022/01 - 現在 OECD 経済開発協力機構 CRP fellow
- 2022/10 - 2023/03 The University of Shiga Prefecture
- 2019/08 - 2022/07 Jilin Agricultural University Guest Professor
- 2021/11 - 2022/01 Kitami Institute of Technology Guest Lecturer
- 2021/01 - 2021/01 Mae Far Luang University Guest Lecturer
- 2017/11 - 2020/11 上海市農業科学院 食用菌研究所 客員教授
- 2016/04/01 - Faculty of Agriculture, KIndai University Guest Lecturer
- 2012/04 - Grad. Sch. Agr., Kyoto Univ. Professor
- 2010/04/01 - Faculty of Engineering, Kitami Institute of Technology Guest Lecturer
- 2002/11 - Res. Inst. Sustainable Humanosphere, Kyoto Univ. Assoc. Prof.
- 1998 - 1999 日本学術振興会・王立協会交換研究員(オックスフォード大学客員研究員)
- 1993 - 京都大学木質科学研究所 助手
- 1992 - Div. Appl. Life Sci., Grad. Sch. Agr., Kyoto Univ JSPS fellow
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Committee career (31)：
- 2016/01/01 - 2019/05/25 Mycological Society Japan -
- 2019/04 - 日本木材学会 編集委員
- 2019/01 - Mycobiology editor
- 2019/01/01 - Korean Society of Mycology -
- 2019 - 日本学術振興会 科学研究費委員会委員
- 2018 - 日本学術振興会 科学研究費委員会専門委員
- 2017 - 日本学術振興会 科学研究費委員会専門委員
- 2015 - 2016/11/07 - -
- 2015 - 2016/09/11 - -
- 2016 - 日本学術振興会 科学研究費委員会専門委員
- 2016 - Mycoscience Editor
- 2014 - 2015/09/12 - -
- 2013/04/01 - 2015/03/31 - -
- 2013/04/01 - 2015/03/31 JSMSB -
- 2015 - 日本学術振興会 科学研究費委員会専門委員
- 2014 - 日本微生物学連盟 理事
- 2014 - 日本きのこ学会 理事
- 2013 - 日本学術振興会 科学研究費委員会専門委員
- 2013 - 日本学術振興会 特別研究員等審査会委員
- 2013 - 日本学術振興会 国際事業委員
- 2013 - 日本菌学会 評議員
- 2006/04/01 - 2011/03/31 - -
- 2010 - 日本学術振興会 科学研究費委員会専門委員
- 2005/04/01 - 2007/03/31 Mycological Society of Japan -
- 2006 - RITE 革新的バイオマス利用システムの実現可能性に関する調査委員
- 2005 - 日本菌学会 幹事
- 2003 - RITE プログラム方式二酸化炭素固定化・有効利用技術開発 基盤技術研究推進委員
- 2003 - 日本きのこ学会 評議員
- 2003 - 日本木材学会 J. Wood Sci. 編集委員 機関幹事
- 2002 - RITE 技術評価委員
- 2000/04/01 - JSMSB -
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Awards (17)：
- 2023/03 - poster prize Characterization of cell wall synthesis regulatory transcription factors Mbp1 and Rlm1 in basidiomycete Pleurotus ostreatus
- 2023/03 - Excellent student award Isolation of genes essential for basidiospore production in Pleurotus ostreatus using transcriptome analysis and CRISPR/Cas9
- 2023/03 - ECFG16 poster prize Experimental evidence that lignin-modifying enzymes are essential for degrading plant cell wall lignin by Pleurotus ostreatus using CRISPR/Cas9
- 2022/07 - 日本応用糖質科学会東北支部 奨励賞(指導学生の受賞)
- 2019/11 - 10th Meeting of Asia for Mushromm Scinece Best poster award CRISPR/Cas9-driven molecular breeding of sporeless strain in Pleurotus ostreatus
- 2019/10 - Asia Mycological Congress Best poster prize CRISPR/Cas9-driven simultaneous gene mutations in both nuclei of dikaryotic strain of Pleurotus ostreatus
- 2018/09 - 日本きのこ学会 学生優秀発表賞(指導教員、共著者として) ヒラタケ及びCeriporiopsis subvermisporaにおけるCRISPR/Cas9によるゲノム編集系の確立
- 2018/09 - 日本きのこ学会 ポスター賞 ヒラタケにおける分泌型レポーターアッセイシステムの構築
- 2018/02 - Best poster prize as the first author Functional analysis of gene expression signals in basidiomycetous fungi using transfection, and random or targeted integration on the chromosome.
- 2018/02 - Best poster prize Cellulolytic enzyme genes are significantly upregulated by most of the mutations that cause defects in the ligninolytic activity in the white-rot fungus Pleurotus ostreatus
- 2017/07 - 森喜作記念顕彰会 森喜作賞 食用きのこ類の遺伝子工学を駆使した分子生物学的な研究
- 2002 - 日本きのこ学会奨励賞 遺伝子組換えを用いたきのこの分子育種に関する研究
- 2002 - prize for encouragement of research from Inoue Foundation
- 2000 - ホクト研究奨励賞 担子菌類における高効率な形質転換系の開発
- 2000 - prize for encouragement of research from Hokuto foundation
- 1995 - 井上研究奨励賞 広宿主域プラスミドRSF1010のDNA複製開始機構
- 1995 - prize for encouragement of research from Japan Society of Mushroom Science and Biotechnology
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Association Membership(s) (6)：
日本きのこ学会
, 日本菌学会
, 日本生化学会
, 日本農芸化学会
, 日本木材学会
, 日本分子生物学会
