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J-GLOBAL ID:200901091918231548
Update date: Sep. 19, 2024
Okubo Kousaku
オオクボ コウサク | Okubo Kousaku
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Affiliation and department:
国立遺伝学研究所 生命情報・DDBJ研究センター・遺伝子発現解析研究室
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Job title:
教授
Homepage URL (1):
http://bodymap.ims.u-tokyo.ac.jp
Research field (1):
Molecular biology
Research keywords (9):
ゲノム医科学
, 分子生物学
, 情報検索
, データベース
, 自然言語処理
, 知的情報処理
, プロテオーム
, トランスクリプトーム
, ゲノム
Research theme for competitive and other funds (1):
2000 - 2004 分子生物学の定式化
Papers (16):
Osamu Ogasawara, Jun Mashima, Yuichi Kodama, Eli Kaminuma, Yasukazu Nakamura, Kousaku Okubo, Toshihisa Takagi. DDBJ new system and service refactoring. Nucleic acids research. 2013. 41. Database issue. D25-9-29
Osamu Ogasawara, Kousaku Okubo. On Theoretical Models of Gene Expression Evolution with Random Genetic Drift and Natural Selection. PLOS ONE. 2009. 4. 11
H. Sugawara, O. Ogasawara, K. Okubo, T. Gojobori, Y. Tateno. DDBJ with new system and face. NUCLEIC ACIDS RESEARCH. 2008. 36. D22-D24
Ogasawara O, Otsuji M, Watanabe K, Iizuka T, Tamura T, Hishiki T, Kawamoto S, Okubo K. BodyMap-Xs: anatomical breakdown of 17 million animal ESTs for cross-species comparison of gene expression. Nucleic Acids Res. 2006. 34. 628-631
Okubo K, Sugawara H, Gojobori T, Tateno Y. DDBJ in preparation for overview of research activities behind data submissions. Nucleic Acids Res. 2006. 34. 1. 6-9
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MISC (2):
Hideharu Hoshino, Tsukasa Uchida, Toshiaki Otsuki, Shoko Kawamoto, Kousaku Okubo, Masatoshi Takeichi, Osamu Chisaka. Cornichon-like protein facilitates secretion of HB-EGF and regulates proper development of cranial nerves. MOLECULAR BIOLOGY OF THE CELL. 2007. 18. 4. 1143-1152
大久保公策, 日紫喜光良. 「ポストゲノム時代に高まるバイオ自然言語処理への期待:バイオ自然言語処理最新事情 5.ゲノムデータの機械解釈 」. 情報処理. 2005. 46. 2480. 137-142
Books (6):
「蛋白質核酸酵素」 「生命科学データベース統合化の背景」【シリーズ「ライフサイエンス分野の統合データベース」第1回】
2007
雑誌『科学』 「生命科学データベースの現状と課題」
2007
科学 Vol.77 No.4 生命科学データベースの現状と課題ーパラダイム転換の最後のバリアー
(株)岩波書店 東京都千代田区一ツ橋2-5-5 2007
「蛋白質核酸酵素」編集部 vol.50 No.16 「文献知識の計算機による利用がなぜ必要か」
共立出版株式会社 2005
科学 Vol.74 No.10 ゲノム語とオントロジーという名の形而上学ー進化と医学
岩波書店 2004
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Lectures and oral presentations (42):
「デジタル時代のジレンマ」フォーラム
(第32回日本分子生物学会 2009)
「デジタル科学における独占と共有の賢いバランス」
(【CBRC】2009シンポジウム 2009)
「科学データは誰のものか」
(統合データベース講習会 AJACSりんくう 2009)
デジタル科学への最後のステップ
(ライフサイエンス統合データベースセンター 2009シンポジウム「科学における情報の上手な権利化と共有化」 2009)
先端技術と知財問題
(日本知財学会 第7回年次学術研究発表会 2009)
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Works (2):
文部科学省データベース統合プロジェクト ヒト統合ボディーマップ
Ogasawara O, Arikawa K, Watanabe K, Iizuka T, Okubo K 2007 -
BodyMap-Xs
Okubo, K, Ogasawara, O 2006 -
Education (3):
- 1990 Osaka University
- 1986 Osaka University Faculty of Medicine
- 1982 The University of Tokyo The Faculty of Engineering
Professional career (1):
医学博士 (大阪大学)
Association Membership(s) (2):
日本バイオインフォーマティクス学会
, 分子生物学会
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