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J-GLOBAL ID：200901095300537722
Update date: Nov. 15, 2024
Namba Keiichi
ナンバ ケイイチ | Namba Keiichi
Affiliation and department：
Job title：
Specially Appointed Professor
Homepage URL (1)：
http://www.fbs.osaka-u.ac.jp/jpn/general/lab/02/
Research field (5)：
Molecular biology
, Structural biochemistry
, Biophysics
, Nanostructure physics
, Nanostructure chemistry
Research keywords (4)：
構造生物学
, 生物物理学
, Structure Biology
, Biophysics
Research theme for competitive and other funds (25)：
- 2017 - 現在 クライオ電子顕微鏡法による生体分子構造解析の高分解能化と効率化を目指した研究
- 2023 - 2026 ABCA1による高密度リポ蛋白質(HDL)産生メカニズムの可視化
- 2018 - 2022 自動選別ソフトウェアの開発
- 2017 - 2020 Artificial synthesis of the type III secretion system translocon. A new approach to vaccine design
- 2013 - 2018 クライオ電子顕微鏡による生体分子モーターの立体構造と機能の解明
- 2013 - 2017 The molecular basis of circadian clock in plants: The origin, evolution, diversity
- 2012 - 2017 Generalization of harmonized supramolecular motility machinery and its diversity
- 2013 - 2016 Development of a new drug for heart failure targeting phospholamban
- 2012 - 2014 X線回折・電子顕微鏡融合超分子複合体イメージング
- 2012 - 2013 グラフェンを用いた革新的超高分解能低温電子顕微鏡法の開発
- 2009 - 2013 Architecture and response to magnetic stimulus of the flagellum for magnetotaxis of marine bacteria
- 2009 - 2013 極低温電子顕微鏡による細菌べん毛モーターと蛋白質輸送装置の像構造解析
- 2009 - 2011 電子顕微鏡による細菌べん毛など生体超分子の構造解析
- 2009 - 2011 細菌べん毛モーターのトルク発生と回転方向スイッチのメカニズム
- 2009 - 2010 XFEL生体単粒子解析実験技術の整備と高度化
- 2004 - 2010 超分子疑似原子分解能電子線・X線構造解析法
- 2008 - 2010 Molecular mechanism of the construction of the bacterial flagellar rod.
- 2008 - 2009 生体単粒子解析用クライオ試料固定照射装置の開発
- 2004 - 2009 Functional Mechanism and Structural Organization of Biological Macromolecular Assemblies
- 2004 - 2008 DNAナノストラクチャ
- 2002 - 2008 超分子ナノマシンプロジェクト
- 2005 - 2007 Molecular mechanism of the clock molecular machinery
- 2004 - 2006 Molecular mechanism of the bacterial flagellar axial coupling joint
- 2003 - 2004 Molecular mechanism for circadian clock molecular machinery at the stomic level
- Structural and functional analysis of the bacterial flagellum to understand the mechanisms of self-assembly, structural swiching, and mechanical energy transduction
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Papers (426)：
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Kazuki Kasai, Kayo Imamura, Masatoshi Uno, Naotaka Sekiyama, Tomoko Miyata, Fumiaki Makino, Ryusei Yamada, Yoshiki Takahashi, Noriyuki Kodera, Keiichi Namba, et al. From Monomers to Oligomers: Structural Mechanism of Receptor-Triggered MyD88 Assembly in Innate Immune Signaling. 2024
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Norihiro Takekawa, Tatsuro Nishikino, Jun-ichi Kishikawa, Mika Hirose, Miki Kinoshita, Seiji Kojima, Tohru Minamino, Takayuki Uchihashi, Takayuki Kato, Katsumi Imada, et al. Structural analysis of S-ring composed of FliFG fusion proteins in marine Vibrio polar flagellar motor. mBio. 2024
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Soichiro Seki, Tomoko Miyata, Naoko Norioka, Hideaki Tanaka, Genji Kurisu, Keiichi Namba, Ritsuko Fujii. Structure-based validation of recombinant light-harvesting complex II. PNAS Nexus. 2024. 3. 9
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Tsuyoshi Miki, Takeshi Uemura, Miki Kinoshita, Yuta Ami, Masahiro Ito, Nobuhiko Okada, Takemitsu Furuchi, Shin Kurihara, Takeshi Haneda, Tohru Minamino, et al. Salmonella Typhimurium exploits host polyamines for assembly of the type 3 secretion machinery. PLOS Biology. 2024. 22. 8. e3002731-e3002731
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Petra Štěrbová, Chun-Hsiung Wang, Kathleen J. D. Carillo, Yuan-Chao Lou, Takayuki Kato, Keiichi Namba, Der-Lii M. Tzou, Wei-Hau Chang. Molecular Mechanism of pH-Induced Protrusion Configuration Switching in Piscine Betanodavirus Implies a Novel Antiviral Strategy. ACS Infectious Diseases. 2024. 10. 9. 3304-3319
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MISC (288)：
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藤田純三, 牧野文信, 安齋樹, 山口圭史, 淺原時泰, 森口舞子, 永田佳代子, 前田亮太, 白川康太朗, 佐藤桂, et al. SARS-CoV2のSタンパク質とVHH抗体複合体の構造解析. 日本結晶学会年会講演要旨集. 2023. 2023
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三宅智哉, 西村和樹, 松田佳央理, 藤田純三, 藤田純三, 藤田純三, 難波啓一, 難波啓一, 徳山健斗, 戸谷吉博, et al. Structural and functional analysis of E. coli phosphoenolpyruvate carboxylase mutant. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2023. 46th
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南野 徹, 木下 実紀, 森本 雄祐, 難波 啓一. 細菌べん毛輸送装置の膜電位に依存した活性化機構-Membrane Voltage-dependent Activation of the Transmembrane Export Gate Complex in the Bacterial Flagellar Type III Secretion System. 生物物理 / 日本生物物理学会 編. 2022. 62. 3. 表紙,165-169
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南野徹, 木下実紀, 森本雄祐, 森本雄祐, 難波啓一, 難波啓一, 難波啓一, 難波啓一. Membrane Voltage-dependent Activation of the Transmembrane Export Gate Complex in the Bacterial Flagellar Type III Secretion System. 生物物理(Web). 2022. 62. 3
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PAN Dongqing, 筒井隼一, 宮田知子, 牧野文信, 牧野文信, 難波啓一, 小川治夫, 加藤博章, 加藤博章. Cryo-EM single particle analysis of Candida albicans Cdr1p multi-drug ABC transporter. 日本薬学会年会要旨集(Web). 2022. 142nd
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Patents (1)：
Books (23)：
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実験医学増刊「あなたのラボから薬を生み出す アカデミア創薬の実践」
羊土社 2024 ISBN:9784758104166
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Bacterial and Archaeal Motility - Methods and Protocols
Springer Nature 2023
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構造生命科学を支えるクライオ電子顕微鏡法の進歩と将来展望
日本顕微鏡学会 2022
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クライオ電子顕微鏡が拓く生命科学の未来
日本顕微鏡学会 2022
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細菌べん毛輸送装置の膜電位に依存した活性化機構
生物物理 Vol. 62, 3 2022
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Lectures and oral presentations (318)：
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Recent progress in electron cryomicroscopy for structural life sciences
(UK-Japan Symposium on Frontiers of Structural Biology 2024)
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生命科学・創薬を支えるクライオ電子顕微鏡構造解析の高速化
(日本農芸化学会2024年度東京大会 2024)
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Recent progress and future perspective of electron cryomicroscopy for structural life sciences.
(I2CANPRoTech II 2024)
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Structure of cyanobacterial photosystem I complexed with ferredoxin and cytochrome c6 at 1.97 Å resolution.
(2023)
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Proton-protein antiporter mechanism in the type III secretion system of the bacterial flagellum
(2023)
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Works (2)：
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A high-resolution mass spectrometry and electron microscopy approach to understanding the function o
2010 -
-
Dynamic NanoMachine Project, ICORP
2002 - 2007
Education (4)：
- 1976 - 1980 Osaka University Graduate School of Engineering Science
- - 1980 Osaka University Graduate School, Division of Engineering Science Biological Technology
- 1970 - 1974 Osaka University Department of Biophysical Engineering
- - 1974 Osaka University Faculty of Engineering Science Biological Technology
Professional career (1)：
- Ph.D(biophysics) (Osaka University)
Work history (29)：
- 2023/04 - 現在 Osaka University Graduate School of Frontier Biosciences Specially Appointed Professor (Full time)
- 2017/04 - 現在 Osaka University Professor Emeritus
- 2018/04 - 2023/03 RIKEN RIKEN-JEOL Collaboration Center Director
- 2018/04 - 2023/03 RIKEN SPring-8 Center Vice Director
- 2018/04 - 2022/03 RIKEN Laboratory for Supramolecular System Dynamics Research, BDR Team Leader
- 2017/04 - 2022/03 Osaka University Graduate School of Frontier Biosciences Specially Appointed Professor
- 2017/05 - 2018/03 RIKEN QBiC Vice Director
- 2017/04 - 2018/03 Osaka University Honorary Professor
- 2012/04 - 2018/03 RIKEN Office for Supramolecular System Dynamics Research Collaboration, QBiC Head
- 2012/07 - 2017/03 Osaka University Distinguished Professor
- 2002/04 - 2017/03 Osaka University Graduate School of Frontier Biosciences Professor
- 2012/04 - 2014/03 Osaka University Member of University Council
- 2012/01 - 2013/12 Biophysical Society of Japan President
- 2012/04 - 2013/03 Tohoku University Institute of Multidisciplinary Research for Advanced Materials Visiting Professor
- 2006/04 - 2013/03 RIKEN Harima Institute Visiting Chief Researcher
- 2004/04 - 2013/03 Nagoya University Center for Gene Research Visiting Professor
- 2010/04 - 2012/03 Osaka University Graduate School of Frontier Biosciences Dean
- 2010 - 2012 Dean, Graduate School of Frontier Biosciences, Osaka University
- 2006/10 - 2008/03 OIST Research Advisor
- 2002/12 - 2008/03 JST Dynamic NanoMachine Project, ICORP Project Director
- 2002/10 - 2006/03 Japan Synchrotron Radiation Research Institute (SPring-8) Visiting Chief Researcher
- 1997/10 - 2003/03 JST Protonic NanoMachine Project, ERATO Project Director
- 2001/04 - 2002/09 Japan Synchrotron Radiation Research Institute (SPring-8) Structural Biology Group Group Leader
- 1999/04 - 2002/03 Matsushita Electric Industrial Co., Ltd. Advanced Technology Research Laboratories Research Director
- 1992/01 - 1999/03 Matsushita Electric Industrial Co., Ltd. International Institute for Advanced Research Research Director
- 1991/04 - 1992/01 JRDC Molecular Dynamic Assembly Project, ERATO Research Manager
- 1986/11 - 1991/09 JRDC Molecular Dynamic Assembly Project, ERATO Group Leader
- 1981/04 - 1981/09 Osaka University Dept. of Biophysical Engineering Postdoctral Fellow
- 1980/04 - 1981/03 (Japan Society for the Promotion of Science Osaka University Postdoctral Fellow
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Committee career (35)：
- 2009 - 現在 日本学術会議 連携会員(生物物理分科会副委員長IUPAB分科会委員)
- 2004 - 現在 BIOPHYSICS Associate Editor
- 2000 - 現在 日本学術振興会 産学協力研究委員会「回折構造生物第169委員会」委員
- 2012/01 - 2013/12 日本生物物理学会 会長
- 2010 - 2011 日本生物物理学会 運営委員会委員
- 2010 - 2011 高輝度光科学研究所(SPring-8) 利用研究課題選定委員会委員
- 2005 - 2011 科学技術振興機構 さきがけ「生命現象と計測分析」領域アドバイザー
- 2004 - 2011 科学技術振興機構 REST「生命現象の解明と応用に資する新しい計測・分析基盤技術」領域アドバイザー
- 2006 - 2010 (独)情報通信機構 外部評価委員
- 2000 - 2010 Journal of Structural Biology Editorial Board Member
- 2009 - 2009 RIKEN SPring-8 Center Advisory Council 2009 Council Member
- 2007 - 2008 日本学術会議 連携会員(生物物理分科会委員IUPAB分科会委員)
- 2003 - 2008 ナノテクノロジー総合シンポジウム(JAPAN NANO) プログラム委員会委員
- 2005 - 2007 (独)産業技術総合研究所 研究評価委員
- 2002 - 2007 文部科学省 「知的クラスター創成事業」(選考評価委員会)専門委員
- 1999 - 2006 Member of the CCP13 Steering Committee
- 2003 - 2005 日本生物物理学会 副会長
- 2003 - 2005 (独)産業技術総合研究所 研究評価委員
- 2003 - 2005 (独)通信総合研究所 研究評価委員
- 2002 - 2004 The 8th International Conference on Biology and Synchrotron Radiation Member of International Advisory Committee Member
- 2002 - 2003 内閣府沖縄振興局 新大学院大学Member of International Advisory Committee Member
- 2001 - 2003 高輝度光科学研究所(SPring-8) 利用研究課題選定委員会委員
- 2002 - 2002 文部科学省 「科学技術・学術審議会」(研究計画・評価分科会)専門委員
- 2001 - 2001 文部科学省 「科学技術振興調整費研究評価部会」細胞・生体システム研究評価WG委員
- 2001 - 2001 新エネルギー・産業技術総合開発機構 「生体高分子情報利用技術開発」技術審査委員
- 2001 - 2001 日本生物物理学会 「生物物理」編集実行委員会委員
- 2000 - 2001 日本学術会議 第4部・第7部付置「タンパク質の構造・機能研究の総合戦略」小委員会幹事委員
- 1999 - 2001 日本生物物理学会 運営委員会委員
- 2000 - 2000 新エネルギー・産業技術総合開発機構 「生体高分子情報利用技術開発」技術評価委員
- 1999 - 2000 日本学術会議 第4部付置「分子レベルの構造生物学振興」小委員会幹事委員
- 1998 - 1999 科学技術庁 「若手研究者・研究技術者の確保、活用等に関する懇談会」委員
- 1994 - 1997 高輝度光科学研究所(SPring-8) 利用研究課題選定委員会委員
- 1995 - 1996 日本学術会議 第4部付置「分子レベルの構造生物学振興」小委員会委員
- 1990 - 1992 日本生物物理学会 「生物物理」編集実行委員会委員
- 日本生物物理学会 委員会委員
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Awards (21)：
- 2024/06 - Best poster award of the 80th annual meeting of Japanese Society of Microscopy Sheet-like structure of bacterial actin MreBs driving helicity-switching swimming of Spiroplasma.
- 2023/01 - 日本放射光学会 第36回日本放射光学会年会・放射光科学合同シンポジウム(JSR2023)学生発表賞 人工結合タンパク質を用いた糖鎖切断酵素の立体構造解析.
- 2022/05 - 日本顕微鏡学会 日本顕微鏡学会第67回学会賞(瀬藤賞) クライオ電子顕微鏡による生体分子ナノマシンの構造解析
- 2021/11 - Student Presentation Award of BSJ2021 Structural and functional analysis of the molecular bushing of the bacterial flagellar motor and the interactions with the rod
- 2021/05 - 第67回日本生化学会近畿支部例会 優秀発表賞 構造から紐解くバクテリアべん毛モーターの軸-軸受相互作用.
- 2021/04 - Biomolecules 10th Anniversary Best Cover Awards, Third Place Structural and functional comparison of Salmonella flagellar filaments composed of FljB and FliC.
- 2019/09 - 第8回Biophysics and Physicobiology論文賞 Stator assembly and activation mechanism of the bacterial flagellar motor.
- 2012/06 - 恩賜賞、日本学士院賞
- 2010/02 - Fellow, American Academy of Microbiology
- 2009/10 - EMBO Associate member 2009
- 2009/03 - The 2009 Biophysical Society Founders Award
- 2008 - 8 speakers to be selected from poster presenters
- 2008 - Best Poster from Students at the XXI Congress of the International Union of Crystallography
- 2008 - NIPS SYMPOSIUM 2008 Poster Award
- 2004/11 - 日本遺伝学会第76回大会Best Paper賞
- 2003/04 - TEPIAハイテク・ビデオ・コンクール最優秀作品賞・TEPIAグランプリ
- 2003 - TEPIA High-Tech Video Concours TEPIA Grand Prix
- 2002/10 - 日経ビジュアルサイエンスフェスタ2002優秀賞
- 2002 - Nikkei Computer Visualization symposium'2002, Excellent Award
- 2001/11 - 第19回大阪科学賞
- 2001 - Osaka Science Prize
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Association Membership(s) (9)：
American Association for the Advancement of Science
, THE JAPANESE SOCIETY OF MICROSCOPY
, 生物物理学会
, 日本蛋白質科学会
, 日本生物物理学会
, Biophysical Society
, Japan Protein Science Society
, THE MOLECULAR BIOLOGY SOCIETY OF JAPAN
, Biopysial Society of Japan
