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J-GLOBAL ID：200901096723619667   Update date: Apr. 12, 2024

Asai Kiyoshi

アサイ キヨシ | Asai Kiyoshi
Affiliation and department：
東京大学 大学院新領域創成科学研究科

About 東京大学 大学院新領域創成科学研究科


Job title： 教授
Other affiliations (1)：
  • National Institute of Advanced Industrial Science and Technology  Computational Biology Research Center 
Homepage URL  (2)： http://asailab.cb.k.u-tokyo.ac.jp/ ,  http://www.ncrna.org
Research field  (2)： Systems genomics ,  Biological, health, and medical informatics
Research keywords  (4)： Bioinformatics ,  RNA Informatics ,  Biological Sequence Design ,  stochastic models
Research theme for competitive and other funds  (21)：
  • 2021 - 2024 修飾塩基を持つRNAの情報解析基盤技術の開発
  • 2018 - 2023 化学を基盤とするゲノムスケールDNA合成技術の開発
  • 2019 - 2022 プライバシー保護データ解析技術の社会実装
  • 2016 - 2022 先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム
  • 2018 - 2021 バイオ医薬品の高度製造技術の開発
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Papers (164)：
  • Kohei Nomura, Kaoru Onda, Hirotaka Murase, Fumitaka Hashiya, Yukiteru Ono, Goro Terai, Natsuhisa Oka, Kiyoshi Asai, Daisuke Suzuki, Naho Takahashi, et al. Development of PCR Primer Enabling the Design of Flexible Sticky Ends for Efficient Concatenation of Long DNA Fragments. RSC Chemical Biology. 2024
  • Fumitaka Hashiya, Hirotaka Murase, Akash Chandela, Haruka Hiraoka, Masahito Inagaki, Yuko Nakashima, Naoko Abe, Mayu Nakamura, Goro Terai, Yasuaki Kimura, et al. The Effect of γ Phosphate Modified Deoxynucleotide Substrates on PCR Activity and Fidelity. Chembiochem : a European journal of chemical biology. 2023. 24. 14. e202200572
  • Mathys Grapotte, Manu Saraswat, Chloé Bessière, Christophe Menichelli, Jordan A. Ramilowski, Jessica Severin, Yoshihide Hayashizaki, Masayoshi Itoh, Michihira Tagami, Mitsuyoshi Murata, et al. Author Correction: Discovery of widespread transcription initiation at microsatellites predictable by sequence-based deep neural network (Nature Communications, (2021), 12, 1, (3297), 10.1038/s41467-021-23143-7). Nature Communications. 2022. 13. 1
  • Yukiteru Ono, Michiaki Hamada, Kiyoshi Asai. PBSIM3: a simulator for all types of PacBio and ONT long reads. NAR genomics and bioinformatics. 2022. 4. 4. lqac092
  • Yoichiro Ito, Misa Ishigami, Goro Terai, Yasuyuki Nakamura, Noriko Hashiba, Teruyuki Nishi, Hikaru Nakazawa, Tomohisa Hasunuma, Kiyoshi Asai, Mitsuo Umetsu, et al. A streamlined strain engineering workflow with genome-wide screening detects enhanced protein secretion in Komagataella phaffii. Communications Biology. 2022. 5. 1
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MISC (75)：
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Patents (15)：
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Books (1)：
  • 生物配列の統計 統計科学のフロンティア9
    岩波書店 2003 ISBN:4000068490
Education (4)：
  • 1995 - The University of Tokyo
  • 1983 - 1985 The University of Tokyo
  • 1981 - 1983 The University of Tokyo The Faculty of Engineering Department of Mathematical Engineering and Information Physics
  • 1979 - 1981 The University of Tokyo College of Arts and Sciences
Professional career (1)：
  • 博士(工学) (東京大学)
Work history (9)：
  • 2015/04 - 現在 産業技術総合研究所 人工知能研究センター 招聘研究員
  • 2007/04 - 現在 The University of Tokyo Undergraduate Program for Bioinformatics and Systems Biology, Faculty of Science
  • 2003/04 - 現在 東京大学大学院 新領域創成科学研究科 教授
  • 2007/04 - 2014/03 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター 研究センター長
  • 2010/04 - 2011/03 Kyoto University Institute for Chemical Research
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Committee career (12)：
  • 2024/02 - 現在 AMED 脳神経科学統合プログラム PO
  • 2020/11 - 現在 JST CREST「異分野融合による新型コロナウイルスをはじめとした感染症との共生に資する技術基盤の創生」領域アドバイザー
  • 2012 - 2020/03 JST CREST「生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出」領域アドバイザー
  • 2019 - 2019 文部科学省 数学アドバンストイノベーションプラットフォーム 中間評価委員
  • 2017 - 2017 文部科学省 数学アドバンストイノベーションプラットフォーム 委託先選定委員
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Awards (1)：
  • 2021 - Japanese Society for Bioinformatics Japanese Society for Bioinformatics Prize
Association Membership(s) (5)：
日本RNA学会 ,  International Society for Computational Biology ,  情報処理学会 ,  日本バイオインフォマティクス学会 ,  日本分子生物学会
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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