転写配列を取得する方法

Inventor： , , ,
Applicant, Patent owner： ,
Agent (1)：鈴江武彦 (外5名)
Gazette classification：公開公報
Application number (International application number)：2000377888
Publication number (International publication number)：2002176980
Application date： Dec. 12, 2000
Publication date： Jun. 25, 2002
Summary：

【要約】【課題】既知の遺伝子配列データ、ESTデータ、ゲノムデータを利用して未知の遺伝子配列を暫定的に決定すること。【解決手段】既知遺伝子配列のデータベース、既知EST配列のデータベース、およびゲノム配列のデータベースに含まれる既知の遺伝子配列および既知のEST配列から相同検索することにより第一のコンセンサス配列を得、該第一のコンセンサス配列のデータベース(A)を構築する。一方、前記データベースの既知のゲノム配列からmRNAに転写される領域を予測して予測遺伝子配列を抽出し、該予測遺伝子配列のデータベース(B)を構築する。前記データベース(B)に含まれる特定の予測遺伝子配列について、前記データベース(A)に含まれるコンセンサス配列と相同検索することにより、未知遺伝子の配列データとしての第二のコンセンサス配列を得る。

Claim (excerpt)：

既知遺伝子配列のデータベース、既知EST配列のデータベース、およびゲノム配列のデータベースから未知遺伝子の暫定配列を決定するための方法であって:前記データベースに含まれる既知の遺伝子配列および既知のEST配列から相同検索することにより第一のコンセンサス配列を得、該第一のコンセンサス配列のデータベース(A)を構築するステップと;前記データベースの既知のゲノム配列からmRNAに転写される領域を予測して予測遺伝子配列を抽出し、該予測遺伝子配列のデータベース(B)を構築するステップと;前記データベース(B)に含まれる特定の予測遺伝子配列について、前記データベース(A)に含まれるコンセンサス配列と相同検索することにより、未知遺伝子の配列データとしての第二のコンセンサス配列を得るステップとを具備したことを特徴とする方法。

IPC (3)：

C12N 15/09 ZNA , C12Q 1/68 , G06F 17/30 170

FI (3)：

C12Q 1/68 Z , G06F 17/30 170 F , C12N 15/00 ZNA A

F-Term (17)：

4B024AA11 , 4B024AA20 , 4B024CA20 , 4B024HA19 , 4B063QA13 , 4B063QQ43 , 4B063QQ53 , 4B063QR08 , 4B063QR32 , 4B063QR38 , 4B063QR42 , 4B063QR62 , 4B063QS25 , 4B063QS39 , 4B063QX10 , 5B075ND20 , 5B075UU19

Article cited by the Patent：

Cited by examiner (2)

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