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J-GLOBAL ID：200903010719551930

定量的構造活性相関におけるファーマコフォア・フィンガープリント並びにプライマリ・ライブラリの構築

Inventor： マクレガー・マルコム・ジェイ. ,  ムスカル・スティーブン・エム.
Applicant, Patent owner： グラクソ グループ リミテッド
Agent (1)： 特許業務法人 明成国際特許事務所
Gazette classification：公表公報
Application number (International application number)：2000578631
Publication number (International publication number)：2002530727
Application date： Oct. 27, 1999
Publication date： Sep. 17, 2002
Summary：

【要約】【課題】 本発明は、改良されたファーマコフォア・フィンガープリントと、フィンガープリントを形成してこれを利用する改良された方法とを提供する。また、本発明の一態様として、ファーマコフォア・フィンガープリントを利用した構造活性相関解析を行う。【解決手段】 所定の化合物に関するファーマコフォア・フィンガープリントにより、その化合物の構造にマッチングするファーマコフォア群を特定することができる。フィンガープリントが、エネルギ的に望ましい種々のコンホメーションにマッチングする様々なファーマコフォアを含むと考えられる。第一のコンホメーションにマッチングし、第二のコンホメーションにはマッチングしないファーマコフォアが存在する一方で、第二のコンホメーションにマッチングし、第一のコンホメーションにはマッチングしないファーマコフォアが存在する。この場合、2つのコンホメーションは、それぞれ、化合物の活性に大きく寄与する。すなわち、フィンガープリントは、任意の適当なコンホメーションにマッチングするファーマコフォアを特定する。本発明は、さらに、ケミカルスペースの高活性領域を特定し、表現し、生産的に利用する装置並びに方法を提供する。ケミカルスペースを表すものとしては、様々な表現が用いられており、さらに別のものを想定することも可能である。本発明の好適な態様では、少なくとも二種類の表現で、有用な情報が得られる。第一の表現は、ファーマコフォアの基本セットにより定義される多数の次元と、さらに、(薬理活性等の)所定の化学活性を表す1つあるいは複数の追加次元を用いるものである。第二の表現は、次元数を削減したものであり、適当な数学的手法を用いて、第一の表現から第二の表現の座標値を誘導する。第二の表現の例としては、例えば、化合物群に関するファーマコフォア・フィンガープリント/活性データを用いて、主要コンポーネント解析により得られる主要コンポーネントが挙げられる。

Claim (excerpt)：

機械読み取り可能な形式で与えられるファーマコフォアの基本セットで、各ファーマコフォアは、少なくとも3つの空間的に離れたファーマコフォア中心を含み、各ファーマコフォア中心は、 (i)空間位置と、 (ii)ある化学特性を特定する所定のファーマコフォア型と、を含み、基本セットのファーマコフォア型には、少なくとも、水素結合受容体、水素結合供与体、マイナス電荷中心、プラス電荷中心、疎水性中心、芳香族中心、ならびに、他のいずれのファーマコフォアの型にも入らないデフォルトカテゴリが含まれるファーマコフォアの基本セット。

IPC (4)：

G06F 17/30 170 ,  G01N 33/15 ,  G01N 33/50 ,  G06F 17/50 638

FI (4)：

G06F 17/30 170 F ,  G01N 33/15 Z ,  G01N 33/50 Z ,  G06F 17/50 638

F-Term (8)：

2G045AA40 ,  2G045DA77 ,  2G045JA01 ,  2G045JA04 ,  5B046AA00 ,  5B046KA06 ,  5B075ND02 ,  5B075UU18