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J-GLOBAL ID:200903013013875952

質量分析法によるタンパク質相互作用物質のスクリーニング方法

Inventor:
Applicant, Patent owner:
Agent (1): 加藤 朝道
Gazette classification:公開公報
Application number (International application number):2003332756
Publication number (International publication number):2005098830
Application date: Sep. 25, 2003
Publication date: Apr. 14, 2005
Summary:
【課題】 タンパク質の機能解析を始める最初の段階として、アフィニティービーズを用いたプルダウンアッセイ法と質量分析法を組み合わせて、タンパク質と相互作用する物質を効率的にスクリーニングする手法を提供すること。【解決手段】 (a)2種以上の候補化合物の質量分析を行い、各候補化合物のイオン化効率を測定する工程、(b)前記2種以上の候補化合物を含む混合物と目的タンパク質とを接触させる工程、(c)前記目的タンパク質と結合しない(非結合)候補化合物を除去する工程、(d)前記目的タンパク質と候補化合物との複合体を回収する工程、(e)前記複合体の質量分析を行い、前記複合体に含まれる目的タンパク質、及び各候補化合物のイオン化量を測定する工程、そして(f)工程(a)及び(e)の結果に基づいて前記複合体に含まれる各候補化合物量又はそれらの比率を計算する工程、を含み、前記目的タンパク質と結合するリガンド化合物を同定する。【選択図】 図4
Claim (excerpt):
目的タンパク質と結合するリガンド化合物を同定するための、化合物のスクリーニング方法であって、 (a)2種以上の候補化合物の質量分析を行い、各候補化合物のイオン化効率を測定する工程、 (b)前記2種以上の候補化合物を含む混合物と目的タンパク質とを接触させる工程、 (c)前記目的タンパク質と結合しない候補化合物を除去する工程、 (d)前記目的タンパク質と候補化合物との複合体を回収する工程、 (e)前記複合体の質量分析を行い、前記複合体に含まれる目的タンパク質、及び各候補化合物のイオン化量を測定する工程、そして (f)工程(a)及び(e)の結果に基づいて前記複合体に含まれる各候補化合物量又はそれらの比率を計算する工程、 を含み、前記目的タンパク質と結合するリガンド化合物を同定することを特徴とするスクリーニング方法。
IPC (5):
G01N33/50 ,  G01N27/62 ,  G01N33/15 ,  G01N33/53 ,  G01N33/566
FI (8):
G01N33/50 Z ,  G01N27/62 D ,  G01N27/62 V ,  G01N27/62 X ,  G01N33/15 Z ,  G01N33/53 D ,  G01N33/566 ,  C12N15/00 A
F-Term (12):
2G045DA30 ,  2G045DA36 ,  2G045DA60 ,  2G045FB06 ,  2G045JA01 ,  4B024AA11 ,  4B024CA04 ,  4B024DA05 ,  4B024DA11 ,  4B024EA04 ,  4B024GA11 ,  4B024HA11
Patent cited by the Patent:
Cited by applicant (1)
  • 米国特許出願公開第2003/0166007号明細書

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