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J-GLOBAL ID：200903017272836340

蛋白質結合性ペプチドの設計・選出方法

Inventor：
小林 柾樹

About 小林 柾樹


Applicant, Patent owner：
株式会社遠隔医療研究所

About 株式会社遠隔医療研究所


Agent (1)： 鎌田 文二 (外2名)
Gazette classification：公開公報
Application number (International application number)：2002062348
Publication number (International publication number)：2003263465
Application date： Mar. 07, 2002
Publication date： Sep. 19, 2003
Summary：
【要約】【課題】 特定蛋白質に対して特異的かつ高親和的に結合するペプチドをコンピュータの支援によって可及的に簡便かつ合理的に設計しかつ選出することである。【解決手段】 標的蛋白質のアミノ酸配列およびその立体分子構造をコンピュータに入力し、前記立体分子構造の溶媒接触表面上に均等に配置した表面点の疎水性ポテンシャル(MHP)を算出すると共に、これを自己組織化特徴地図法によって2次元に展開し、さらにフーリエ変換によって高周波領域を除去することにより疎水性アミノ酸の集合領域を特定し、この領域に対応する立体分子構造上のアミノ酸配列に対して結合性を有するペプチドを、コンピュータの定量的構造活性相関プログラムで設計および選出することからなる蛋白質結合性ペプチドの設計・選出方法とする。定量的構造活性相関プログラムとしては、疎水性アミノ酸の集合領域に対応する立体分子構造上のアミノ酸配列の各アミノ酸残基の疎水度を定量化してフーリエ変換し、表示される周期に対して相補的な疎水度の周期を示すアミノ酸配列を選出する工程を含むプログラムを採用できる。
Claim (excerpt)：
蛋白質のアミノ酸配列およびその立体分子構造をコンピュータに入力し、前記立体分子構造の溶媒接触表面上に均等に配置した表面点の疎水性ポテンシャル(MHP)を算出すると共に、これを自己組織化特徴地図法によって2次元に展開し、さらにフーリエ変換によって高周波領域を除去することにより疎水性アミノ酸の集合領域を特定し、この領域に対応する前記立体分子構造上のアミノ酸配列に対して結合性を有するペプチドを、コンピュータの定量的構造活性相関プログラムで設計および選出することからなる蛋白質結合性ペプチドの設計・選出方法。
IPC (5)：
G06F 17/50 638 ,  G01N 33/48 ,  G06F 17/14 ,  G06F 17/30 170 ,  G06N 3/00 550
FI (5)：
G06F 17/50 638 ,  G01N 33/48 Z ,  G06F 17/14 A ,  G06F 17/30 170 F ,  G06N 3/00 550 Z
F-Term (9)：
2G045AA40 ,  2G045DA36 ,  2G045JA01 ,  5B046AA00 ,  5B046JA04 ,  5B056BB12 ,  5B056BB72 ,  5B075ND20 ,  5B075UU18
Patent cited by the Patent：
Cited by examiner (4)
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