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J-GLOBAL ID:200903023198576552

ジャイレース遺伝子を指標とした微生物の同定・検出法

Inventor:
Applicant, Patent owner:
Agent (1): 平木 祐輔 (外2名)
Gazette classification:公開公報
Application number (International application number):1997343316
Publication number (International publication number):1999169175
Application date: Dec. 12, 1997
Publication date: Jun. 29, 1999
Summary:
【要約】【解決手段】 ジャイレースのβサブユニットをコードする遺伝子の一部をPCRによって増幅し、その増幅断片の塩基配列を指標として微生物の同定及び検出を行う方法。【効果】 未同定微生物株の分類あるいは同定を迅速・高精度に行うことを可能にする。
Claim (excerpt):
以下の(ア)〜(シ)のアミノ酸配列の一部又は全部をコードし、実質的なプライマーとしての機能を有するオリゴヌクレオチドを、少なくとも一方のPCRプライマーとして微生物のDNAを増幅し、その塩基配列に基づき微生物の同定を行うことを特徴とする微生物の同定法。(ア)(ProまたはSer)-(AlaまたはThr)-(Ala、ValまたはLeu)-(GluまたはAsp)-(ValまたはThr)-(IleまたはVal)-(Met、LeuまたはPhe)-Thr-(Val、GlnまたはIle)-Leu-His-Ala-Gly-Gly-Lys-Phe-(AspまたはGly)-(Asp、Gly、AsnまたはSer)-(Ser、Lys、Gly、AspまたはAsn)(イ)Gly-Gly-Thr-His(ウ)(IleまたはLeu)-Met-Thr-Asp-Ala-Asp-Val-Asp-Gly-(AlaまたはSer)-His-Ile-Arg-Thr-Leu(エ)Arg-Lys-Arg-Pro-(GlyまたはAla)-Met-Tyr-Ile-Gly-(SerまたはAsp)-Thr(オ)Gln-(ThrまたはPro)-(LysまたはAsn)-(Thr、Asp、Gly、Lys、Ser、PheまたはTyr)-Lys-Leu(カ)(TyrまたはPhe)-Lys-Gly-Leu-Gly-Glu-Met-Asn-(AlaまたはPro)(キ)Val-Glu-Gly-Asp-Ser-Ala-Gly-Gly-Ser(ク)Lys-(HisまたはVal)-Pro-Asp-Pro-(GlnまたはLys)-Phe(ケ)Leu-Pro-Gly-Lys-Leu-Ala-Asp-Cys-(SerまたはGln)-(SerまたはGlu)または(LysまたはArg)-Asp-Pro-(AlaまたはSer)(コ)Gln-Leu-(TrpまたはArg)-(GluまたはAsp)-Thr-Thr-(MetまたはLeu)-(AspまたはAsn)-Pro(サ)Ala-(LysまたはArg)-(LysまたはArg)-Ala-Arg-Glu(シ)Phe-Thr-Asn-Asn-Ile-(ProまたはAsn)-(ThrまたはGln)
IPC (6):
C12N 15/09 ZNA ,  C12Q 1/68 ,  C12R 1:01 ,  C12R 1:32 ,  C12R 1:20 ,  C12R 1:40
FI (2):
C12N 15/00 ZNA A ,  C12Q 1/68 A

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