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J-GLOBAL ID：200903029787163380

プロファイルデータベース及びプロファイル作成方法

Inventor： 八塚 茂 ,  武藤 勇 ,  山下 巌 ,  田村 卓郎
Applicant, Patent owner： 日立ソフトウエアエンジニアリング株式会社
Agent (1)： 平木 祐輔 (外1名)
Gazette classification：公開公報
Application number (International application number)：2001168230
Publication number (International publication number)：2002358309
Application date： Jun. 04, 2001
Publication date： Dec. 13, 2002
Summary：

【要約】【課題】 大規模な生体高分子の配列間の相関解析を高速に実行でき、任意の解析済プロファイルを再利用できる手段を提供する。【解決手段】 大規模なプロファイルデータベース103を提供し、そのデータベースを使って高速に生体高分子の配列間の相関解析を行えるようにし、プロファイルデータベースから任意のプロファイルを取り出せるようにした。

Claim (excerpt)：

複数の生体高分子の配列をマルチプルアライメント及び/又は進化系統解析した結果のプロファイルを、各プロファイルのIDと名称とプロファイルデータとを対応付けて格納したプロファイルテーブルと、各プロファイルのIDとプロファイル解析条件とを対応付けて格納したプロファイル解析条件テーブルと、プロファイルのIDと配列IDとを対応付けて格納した配列メンバテーブルと、各配列の配列IDと配列名と配列とを対応付けて格納した配列テーブルとによって蓄積したことを特徴とするプロファイルデータベース。

IPC (3)：

G06F 17/30 170 ,  C12N 15/09 ZNA ,  C12Q 1/68

FI (3)：

G06F 17/30 170 F ,  C12Q 1/68 Z ,  C12N 15/00 ZNA A

F-Term (13)：

4B024AA11 ,  4B024CA01 ,  4B024CA11 ,  4B024HA19 ,  4B063QA01 ,  4B063QA18 ,  4B063QQ42 ,  4B063QQ52 ,  4B063QR90 ,  4B063QS39 ,  5B075ND20 ,  5B075ND34 ,  5B075UU18

Article cited by the Patent：

Cited by examiner (1)

• CLUSTAL V: improved software for multiple sequence alignment