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J-GLOBAL ID：200903030425770111

配列変化検出及び発見用の断片化をベースとする方法及びシステム

Inventor： ファン デン ブーム, ディルク ,  ボーカー,セバスチャン
Applicant, Patent owner： セクエノム,インコーポレイティド
Agent (6)： 青木 篤 ,  石田 敬 ,  福本 積 ,  古賀 哲次 ,  渡辺 陽一 ,  西山 雅也
Gazette classification：公表公報
Application number (International application number)：2004557369
Publication number (International publication number)：2006515987
Application date： Nov. 26, 2003
Publication date： Jun. 15, 2006
Summary：

配列変化分析用の断片化をベースとした方法及びシステム、特に質量分析方法及びシステムを提供する。

Claim (excerpt)：

標的分子中の配列変化を決定する方法であって: a)標的生物分子を1又は複数以上の特異的開裂試薬と接触させることによって当該標的生物分子をフラグメントに開裂する工程; b)同じ開裂試薬により参照生物分子をフラグメントにする開裂を行うかシミュレーションする工程; c)前記a)及びb)で生成したフラグメントの質量シグナルを決定する工程; d)前記a)で生成したフラグメントと前記b)で生成したフラグメントとの間で質量シグナルの違いを決定する工程;及び e)前記質量シグナルの違いから配列変化候補の減少した組を決定し、それによって前記参照生物分子と比較した前記標的中の配列変化を決定する工程、 を含む、標的生物分子中の配列変化を決定する方法。

IPC (5)：

C12Q 1/68 ,  C12Q 1/34 ,  G01N 27/62 ,  G01N 37/00 ,  C12N 15/09

FI (5)：

C12Q1/68 Z ,  C12Q1/34 ,  G01N27/62 V ,  G01N37/00 103 ,  C12N15/00 A

F-Term (26)：

2G041CA01 ,  2G041DA04 ,  2G041EA01 ,  2G041FA11 ,  2G041FA12 ,  2G041GA06 ,  2G041JA07 ,  2G041LA07 ,  4B024AA11 ,  4B024CA01 ,  4B024CA04 ,  4B024HA11 ,  4B063QA11 ,  4B063QA12 ,  4B063QQ05 ,  4B063QQ06 ,  4B063QQ34 ,  4B063QQ35 ,  4B063QQ42 ,  4B063QR14 ,  4B063QR15 ,  4B063QR32 ,  4B063QR62 ,  4B063QR74 ,  4B063QR75 ,  4B063QS25

Patent cited by the Patent：

Cited by applicant (2)

• 特表平7-507394
  
• グリコシラーゼによる候補座位のヌクレオチド配列の検出
  Gazette classification：公表公報   Application number：特願平9-505644   Applicant：フォーファス, ユニバーシティ・カレッジ・コーク

Cited by examiner (3)

• 特表平7-507394
  
• グリコシラーゼによる候補座位のヌクレオチド配列の検出
  Gazette classification：公表公報   Application number：特願平9-505644   Applicant：フォーファス, ユニバーシティ・カレッジ・コーク
• 特表平7-507394
  

Article cited by the Patent：

Cited by applicant (5)

• "Sequence dependent fragmentation of peptides generated by MALDI quadrupole time-of-flight (MALDI Q-
• "Separate analysis of complementary strands of restriction enzyme-digested DNA. An application of re
• "Differential sequencing with mass spectrometry."
• "Retention of imprinting of the human apoptosis-related gene TSSC3 in human brain tumors."
• "Comparative sequencing of nucleic acids by liquid chromatography-tandem mass spectrometry."

Cited by examiner (7)

• "Retention of imprinting of the human apoptosis-related gene TSSC3 in human brain tumors."
• "Comparative sequencing of nucleic acids by liquid chromatography-tandem mass spectrometry."
• "Sequence dependent fragmentation of peptides generated by MALDI quadrupole time-of-flight (MALDI Q-
• "Separate analysis of complementary strands of restriction enzyme-digested DNA. An application of re
• "Differential sequencing with mass spectrometry."
• "Differential sequencing with mass spectrometry."
• "Retention of imprinting of the human apoptosis-related gene TSSC3 in human brain tumors."