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J-GLOBAL ID:200903035085891042

遺伝子発現データ解析方法

Inventor:
Applicant, Patent owner:
Agent (1): 作田 康夫
Gazette classification:公開公報
Application number (International application number):2002183810
Publication number (International publication number):2004030093
Application date: Jun. 25, 2002
Publication date: Jan. 29, 2004
Summary:
【課題】本発明の目的は、DNAマイクロアレイ等を用いた遺伝子発現データ(遺伝子発現プロファイルとも言う)に基づく、知識探索の方法および装置を提供することにある。【解決手段】遺伝子発現データを受け取る工程、クラス情報を受け取る工程、データマイニング手法を用いてクラス分類に関連する遺伝子群を抽出する工程、前記遺伝子群にアノテーションを行う工程、遺伝子アノテーションに基づき前記クラス分類に関連する遺伝子群の共通規則を抽出する工程、前記共通規則に基づく拘束条件をもちいたデータマイニングを行う工程を行うことで知識探索を行う。【効果】遺伝子発現データからメタ知識を得ることができる。【選択図】 図1
Claim (excerpt):
遺伝子発現データを受け取る工程と、クラス情報を受け取る工程と、データマイニング手法を用いてクラス分類に関連する遺伝子群を抽出する工程と、前記遺伝子群に注釈付け(アノテーション)を行う工程と、前記遺伝子アノテーションに基づき前記クラス分類に関連する遺伝子群の共通規則を抽出する工程と、前記共通規則に基づく拘束条件をもちいたデータマイニングを行う工程を有することを特徴とする遺伝子発現データ解析方法。
IPC (2):
G06F17/30 ,  C12N15/00
FI (3):
G06F17/30 170F ,  G06F17/30 220Z ,  C12N15/00 Z
F-Term (3):
5B075ND20 ,  5B075NS10 ,  5B075UU19

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