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J-GLOBAL ID:200903035295409707

遺伝子データベース検索システム

Inventor:
Applicant, Patent owner:
Agent (1): 南野 貞男
Gazette classification:公開公報
Application number (International application number):1993260403
Publication number (International publication number):1995093370
Application date: Sep. 27, 1993
Publication date: Apr. 07, 1995
Summary:
【要約】【目的】 遺伝子データベースからその配列データの類似の配列を有する遺伝子配列を検索する遺伝子データベース検索システムを提供する。【構成】 遺伝子データベース検索システムは、構造が解析された遺伝子の配列データを蓄積する遺伝子データベースと、遺伝子データベースからの塩基配列データをターゲットデータとし、検索キーとなる塩基配列データをキーデータとして、ターゲットデータとキーデータとの類似度を求める動的計画法演算ユニットと、遺伝子データベースと動的計画法演算ユニットを制御し、遺伝子データベースに対するアクセス処理と、遺伝子データベースからの塩基配列データをターゲットデータとして動的計画法演算ユニットに順次に入力して類似度を求める演算処理とを並行して動作させる中央処理装置ユニットとを備える。
Claim (excerpt):
構造が解析された遺伝子の少なくとも核酸塩基配列および蛋白質のアミノ酸残基のいずれかの配列データを蓄積する遺伝子データベースと、遺伝子データベースからの塩基配列データをターゲットデータとし、検索キーとなる塩基配列データをキーデータとして、ターゲットデータとキーデータとの類似度を求める動的計画法演算ユニットと、遺伝子データベースと動的計画法演算ユニットを制御し、遺伝子データベースに対するアクセス処理と、遺伝子データベースからの塩基配列データをターゲットデータとして動的計画法演算ユニットに順次に入力して類似度を求める演算処理とを並行して動作させる中央処理装置ユニットとを備えることを特徴とする遺伝子データベース検索システム。
IPC (2):
G06F 17/30 ,  C12N 15/09
FI (2):
G06F 15/40 370 F ,  C12N 15/00 A
Patent cited by the Patent:
Cited by examiner (2)
  • 特開平4-190443
  • 特開昭61-062843

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