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J-GLOBAL ID：200903041484567895
糖-タンパク質相互作用の評価方法
Inventor：
,
Applicant, Patent owner：
Agent (3)：
山本 秀策
, 安村 高明
, 森下 夏樹
Gazette classification：公開公報
Application number (International application number)：2004108251
Publication number (International publication number)：2005293296
Application date： Mar. 31, 2004
Publication date： Oct. 20, 2005
Summary：
【課題】 本発明は、効率よく、データベースから糖に関する情報を抽出するための技術、不斉性に関する経験的ポテンシャルを提供すること、およびこれらの技術を利用して、新たなタンパク質をモデリングするための技術を開発することを課題とする。【解決手段】本発明は、データベースから糖に関する情報を抽出する際に、イス型コンフォメーションおよび特定の糖結合条件を満たすかどうかを判定することで、簡便に糖を含む分子種に関する情報を抽出することができることを見出したことによって上記課題を解決した。本発明はまた、分子に関して、アキシャルおよびエクアトリアルの2つの状態のポテンシャルに関して、エピマープロペンシティインデックス(EPI)を生成し、その差分であるΔEPI求めることによって、分子の不斉性を判定できることを見出したことによって、上記課題を解決した。【選択図】 なし
Claim (excerpt)：
以下の工程:
a)分子構造データベース中に含まれる分子の原子種および該原子種の座標情報を取得する工程;
b)該原子種および該座標情報を用いて原子間の距離および角度を算出して、該原子間に結合が存在するかどうか判定する工程;
c)該原子間の結合に関する情報を用いて、該分子の分子内トポロジーを算出する工程;
d)CnO1なる構造の環を含む原子種を糖候補として抽出する工程であって、ここで、nは、4以上の整数である、工程;
e)該糖候補がイス型コンフォメーションをとっているかどうかを判定する工程;
f)糖に特有な結合条件を該各原子種が満たすかどうかを判定する工程:
g)該工程e)および該工程f)の結果、イス型コンフォメーションをとり、かつ、該結合条件を満たす場合、該分子を糖であると判定する工程、
を包含する、分子構造データベースから糖の構造を抽出するための方法。
IPC (1)：
FI (1)：
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