化学療法剤に対する応答を予測するための遺伝子発現マーカー

Inventor： , ,
Applicant, Patent owner： ,
Agent (3)：山本秀策 , 安村高明 , 森下夏樹
Gazette classification：公表公報
Application number (International application number)：2007507495
Publication number (International publication number)：2007532113
Application date： Apr. 07, 2005
Publication date： Nov. 15, 2007
Summary：

本発明は、癌の予後予測においてその発現が重要である遺伝子のセットを提供する。特に、本発明は、癌患者が化学療法に対して有益な処置応答を有する可能性が高いか否かを予測するために有用な遺伝子発現情報を提供する。本発明は、複数遺伝子RNA分析を用いる、化学療法に対する患者の応答を予測する、臨床的に検証された癌、例えば乳癌の試験を提供する。本発明は、関連の遺伝子セットにおける全てのマーカーのアッセイのための、保管されたパラフィン包埋生検材料の使用に適合し、従って、最も広く利用可能なタイプの生検材料と適合性である。

Claim (excerpt)：

癌と診断された被験体の化学療法に対する応答を予測するための方法であって、該被験体から得られた癌細胞を含む生物学的サンプル中における1つ以上の予後予測的なRNA転写物またはそれらの発現産物の発現レベルを決定する工程を包含し、該予測的なRNA転写物は、TBP;ILT.2;ABCC5;CD18;GATA3;DICER1;MSH3;GBP1;IRS1;CD3z;fas1;TUBB;BAD;ERCC1;MCM6;PR;APC;GGPS1;KRT18;ESRRG;E2F1;AKT2;A.カテニン;CEGP1;NPD009;MAPK14;RUNX1;ID2;G.カテニン;FBXO5;FHIT;MTA1;ERBB4;FUS;BBC3;IGF1R;CD9;TP53BP1;MUC1;IGFBP5;rhoC;RALBP1;CDC20;STAT3;ERK1;HLA.DPB1;SGCB;CGA;DHPS;MGMT;CRIP2;MMP12;ErbB3;RAP1GDS1;CDC25B;IL6;CCND1;CYBA;PRKCD;DR4;ヘプシン;CRABP1;AK055699;コンティグ.51037;VCAM1;FYN;GRB7;AKAP.2;RASSF1;MCP1;ZNF38;MCM2;GBP2;SEMA3F;CD31;COL1A1;ER2;BAG1;AKT1;COL1A2;STAT1;Wnt.5a;PTPD1;RAB6C;TK1、ErbB2、CCNB1、BIRC5、STK6、MKI67、MYBL2、MMP11、CTSL2、CD68、GSTM1、BCL2、ESR1からなる群より選択された1つ以上の遺伝子の転写物であり、 (a)ILT.2;CD18;GBP1;CD3z;fas1;MCM6;E2F1;ID2;FBXO5;CDC20;HLA.DPB1;CGA;MMP12;CDC25B;IL6;CYBA;DR4;CRABP1;コンティグ.51037;VCAM1;FYN;GRB7;AKAP.2;RASSF1;MCP1;MCM2;GBP2;CD31;ER2;STAT1;TK1;ERBB2、CCNB1、BIRC5、STK6、MKI67、MYBL2、MMP11、CTSL2およびCD68のうちの1つ以上;または対応する発現産物の発現増大のあらゆる単位について、該被験体は、化学療法に対する応答の可能性が増大していると予測され;かつ (b)TBP;ABCC5;GATA3;DICER1;MSH3;IRS1;TUBB;BAD;ERCC1;PR;APC;GGPS1;KRT18;ESRRG;AKT2;A.カテニン;CEGP1;NPD009;MAPK14;RUNX1;G.カテニン;FHIT;MTA1;ErbB4;FUS;BBC3;IGF1R;CD9;TP53BP1;MUC1;IGFBP5;rhoC;RALBP1;STAT3;ERK1;SGCB;DHPS;MGMT;CRIP2;ErbB3;RAP1GDS1;CCND1;PRKCD;ヘプシン;AK055699;ZNF38;SEMA3F;COL1A1;BAG1;AKT1;COL1A2;Wnt.5a;PTPD1;RAB6C;GSTM1、BCL2、ESR1の1つ以上;または対応する発現産物の発現の増大のあらゆる単位について、該被験体は、化学療法に対する応答の可能性が減少していると予測される、方法。

IPC (10)：

C12Q 1/68 , C12N 15/09 , C12M 1/00 , A61K 31/337 , A61K 31/704 , A61K 45/00 , A61P 35/00 , A61P 43/00 , G01N 37/00 , G01N 33/53

FI (11)：

C12Q1/68 A , C12N15/00 A , C12M1/00 A , C12N15/00 F , A61K31/337 , A61K31/704 , A61K45/00 , A61P35/00 , A61P43/00 121 , G01N37/00 102 , G01N33/53 M

F-Term (41)：

4B024AA01 , 4B024AA12 , 4B024CA11 , 4B024HA14 , 4B029AA07 , 4B029AA21 , 4B029AA23 , 4B029BB20 , 4B029CC03 , 4B029CC08 , 4B029FA15 , 4B063QA05 , 4B063QA18 , 4B063QA19 , 4B063QQ08 , 4B063QQ52 , 4B063QR08 , 4B063QR32 , 4B063QR56 , 4B063QR62 , 4B063QR84 , 4B063QS25 , 4B063QS34 , 4B063QX02 , 4C084AA19 , 4C084NA05 , 4C084NA14 , 4C084ZB262 , 4C084ZC202 , 4C084ZC752 , 4C086AA01 , 4C086BA02 , 4C086EA10 , 4C086MA01 , 4C086MA02 , 4C086MA04 , 4C086NA05 , 4C086NA14 , 4C086ZB26 , 4C086ZC20 , 4C086ZC75

Article cited by the Patent：

Cited by examiner (19)

Human Molecular Genetics, 2002, Vol.11, No.8, p.863-872
Human Molecular Genetics, 2002, Vol.11, No.8, p.863-872
NATURE, 20020131, V415 N6871, P530-536

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