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J-GLOBAL ID：200903047411118721

遺伝子のモチーフ抽出処理装置及び処理方法

Inventor： 五條堀 孝 ,  舘野 義男 ,  池尾 一穂 ,  川西 祐一 ,  河合 正人
Applicant, Patent owner： 国立遺伝学研究所長 ,  富士通株式会社
Agent (1)： 伊東 忠彦
Gazette classification：公開公報
Application number (International application number)：1994275336
Publication number (International publication number)：1995274965
Application date： Nov. 09, 1994
Publication date： Oct. 24, 1995
Summary：

【要約】【目的】 遺伝子配列情報から遺伝子機能を特定する、配列に特徴的な規則性を抽出する遺伝子のモチーフ抽出処理装置および処理方法に関し、遺伝子配列情報をもとに機械的に(自動的に)モチーフを抽出することを目的とする。【構成】 入力した複数の遺伝子配列のアライメントデータから、進化系統樹に基づく各配列への重み付けを行い、各配列の重みとアミノ酸の類似性とから各部位のスコアを計算し、スコアが大きい部分を配列に特徴的な規則性であるモチーフとして自動抽出する。

Claim (excerpt)：

遺伝子配列情報から遺伝子機能を特定する特徴的な規則性を抽出する処理装置であって、複数の遺伝子配列に関する進化系統樹(13)の枝の長さから各配列の重みを計算する配列の重み計算手段(14)と、配列の各部位毎に、その部位において出現する配列要素の類似性の度合を示すスコアを前記重みを用いて計算するスコア計算手段(15)と、計算されたスコアに基づいて遺伝子配列における特徴的な規則性を有する部分をモチーフとして抽出する特徴情報抽出手段(17)とを備えた、遺伝子のモチーフ抽出処理装置。

IPC (3)：

C12N 15/00 ,  G01N 33/50 ,  G06F 12/00 510