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J-GLOBAL ID：200903049613534983

複合遺伝子学的分類子の遺伝子特徴を識別する方法

Inventor： フルダキス,トニー・ニック
Applicant, Patent owner： ディーエヌエー・プリント・ジェノミックス・インコーポレイテッド
Agent (6)： 深見 久郎 ,  森田 俊雄 ,  仲村 義平 ,  堀井 豊 ,  野田 久登 ,  酒井 將行
Gazette classification：公表公報
Application number (International application number)：2003549497
Publication number (International publication number)：2005512175
Application date： Dec. 02, 2002
Publication date： Apr. 28, 2005
Summary：

遺伝子情報と特定の遺伝形質との間の関連性を識別するためのソフトウェア方法を記載する。候補単一ヌクレオチド多形(SNP)の組合せを遺伝形質に関連する(または関連することが疑われる)遺伝子に関する複数の候補SNPの組合せから選択する。この候補SNPの組合せに関連するハプロタイプデータを複数の個人に関して読み取り、そして、個人に関する所定の形質基準に合致しているかどうかに基づいて、陽性応答グループおよび陰性応答グループにグループ分けする。候補SNPの組合せに関連する統計学的尺度を得るためにグループ分けされたハプロタイプデータについて統計学的分析を実施する。(存在する場合は)最適統計学的尺度を有する候補SNPの組合せを識別するために必要に応じて、選択、読み取り、グループ分けおよび実施の作業を反復する。1つの取り組み方においては、全ての可能なSNPの組合せを選択し、統計学的に分析する。別の取り組み方においては、SNPの組合せの前回の統計学的分析の結果に基づいて指示される検索を最適統計学的尺度が得られるまで実施する。更に、選択され分析されたSNPの組合せの数は、同時試験手順にもとづいて低減してよい。

Claim (excerpt)：

遺伝子情報と特定の遺伝形質との関連性を識別するための方法であって、 試料集団に関して、遺伝形質と、該遺伝形質に関連する遺伝子の複数の単一ヌクレオチド多形(SNP)の組合せの各々1つとの関係を統計学的に分析する作業と、 統計学的分析に基づいて、遺伝形質に関して統計学的に有意な少なくとも1つのSNPの組合せを識別する作業とを包含する、方法。

IPC (2)：

G06F19/00 ,  G06F17/30

FI (3)：

G06F19/00 600 ,  G06F17/30 170F ,  C12N15/00 A

F-Term (6)：

4B024AA20 ,  4B024CA01 ,  4B024CA11 ,  4B024HA11 ,  5B075NR12 ,  5B075UU19

Article cited by the Patent：

Cited by examiner (2)

• Selecting SNPs in two-stage analysis of disease association data: a model-free approach
• Haplotypes at ATM identify coding-sequence variation and indicate a region of extensive linkage dise