シグナルストレッチングおよびデータ集積による核酸配列決定

Inventor：
Applicant, Patent owner：
Agent (1)：龍華明裕
Gazette classification：公表公報
Application number (International application number)：2004513433
Publication number (International publication number)：2005524413
Application date： May. 15, 2003
Publication date： Aug. 18, 2005
Summary：

本願明細書に開示される方法および装置100はDNA配列決定に関する。本発明の幾つかの実施形態において、前記方法は、バルキーな基で標識したヌクレオチドなど、標識化ヌクレオチド220間の距離を測定することを含む。この方法はさらに、同一鋳型DNA200を4つの反応チェンバ110,120,130,140内に入れ、各チェンバは異なる標識化ヌクレオチド前駆体を含み、相補的鎖230,240,250を合成し、標識化ヌクレオチド220を検出することを含む事が出来る。標識化ヌクレオチド220間の距離を使用して、各種類の標識化ヌクレオチド220の距離マップ310,320,330,340を作る事が出来る(450)。距離マップ310,320,330,340を整列させ(520)、核酸配列210を得る。オーバーラッピングデータ分析および頻度分析を行って距離マップ310,320,330,340を作成し(450)、ノンーオーバーラッピングデータ分析を行って、距離マップを配列210に整列させる事が出来る。

Claim (excerpt)：

(a)異なる種類の標識化ヌクレオチドをそれぞれ含む4つのサンプルに鋳型核酸を分ける段階と、 (b)前記鋳型核酸に配列が相補的である標識化核酸鎖を合成する段階と、 (c)前記標識化ヌクレオチド間の距離を測定する段階と、 (d)各サンプルにおいて前記標識化核酸鎖の距離マップを作成する段階と、 (e)前記距離マップを前記相補的鎖の核酸配列に組み立てる段階とを備える、方法。

IPC (3)：

C12N15/09 , C12M1/00 , C12Q1/68

FI (3)：

C12N15/00 A , C12M1/00 A , C12Q1/68 A

F-Term (18)：

4B024AA20 , 4B024CA01 , 4B024CA11 , 4B024CA20 , 4B024HA19 , 4B029AA07 , 4B029AA23 , 4B029BB20 , 4B029CC01 , 4B029FA12 , 4B029FA15 , 4B063QA13 , 4B063QQ42 , 4B063QQ52 , 4B063QR31 , 4B063QR62 , 4B063QS03 , 4B063QX02

Patent cited by the Patent：

Cited by examiner (1)

ポリマー分析のための方法および製品
Gazette classification：公表公報 Application number：特願平10-535104 Applicant：チャン,ユージーンワイ.

Article cited by the Patent：

Cited by examiner (3)

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