Pat
J-GLOBAL ID：200903055690315739
酵母代謝をモデリングするための組成物および方法
Inventor：
,
,
,
,
Applicant, Patent owner：
Agent (3)：
清水 初志
, 橋本 一憲
, 新見 浩一
Gazette classification：公表公報
Application number (International application number)：2003538742
Publication number (International publication number)：2005507108
Application date： Oct. 24, 2002
Publication date： Mar. 10, 2005
Summary：
本発明は、酵母生理機能を決定するためのインシリコモデルを提供する。本モデルは、複数の酵母反応物を複数の酵母反応と関係づけるデータ構造、複数の酵母反応のための制約セット、および酵母生理機能を予測する反応を介してフラックス分布を決定するためのコマンドを含む。本発明のモデルは、関連した遺伝子または遺伝子群を特徴づける情報を含む遺伝子データベースをさらに含むことができる。本発明は、インシリコにおける酵母モデルを作成する方法および本発明のモデルを使用して酵母生理機能を決定するための方法をさらに提供する。
Claim (excerpt)：
以下を含む、コンピュータ読み取り可能な媒体または媒体類:
(a)複数の酵母反応物を複数の酵母反応と関係づけるデータ構造であって、該酵母反応のそれぞれは、反応の基質として同定される反応物、反応の産物として同定される反応物、並びに該基質および該産物を関係づける化学量論係数を含み、少なくとも1つの該酵母反応は、関連した遺伝子を示すために注釈がついている、データ構造;
(b)該関連した遺伝子を特徴づける情報を含む遺伝子データベース;
(c)該複数の酵母反応のための制約セット;ならびに
(d)該制約セットが該データ構造に適用されるときに、目的関数を最小または最大にする少なくとも1つのフラックス分布を決定するためのコマンドとを含み、該少なくとも1つのフラックス分布は、酵母生理機能を予測するコマンド。
IPC (2)：
FI (2)：
G06F19/00 600
, G06F17/30 170F
