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J-GLOBAL ID：200903055908705208

植物のsd-1遺伝子周辺領域の遺伝子型判定方法、および該方法を用いた植物の半わい性形質の検査方法

Inventor： 美濃部 侑三 ,  門奈 理佐 ,  北澤 則之 ,  吉野 理香 ,  鈴木 淳子
Applicant, Patent owner： 株式会社植物ゲノムセンター
Agent (2)： 清水 初志 ,  橋本 一憲
Gazette classification：再公表公報
Application number (International application number)：JP2003001317
Publication number (International publication number)：WO2003070934
Application date： Feb. 07, 2003
Publication date： Aug. 28, 2003
Summary：

ササニシキ・ハバタキの交配後代集団を用いたポジショナルクローニングにより、イネの半わい性遺伝子sd-1を単離・同定した。その過程で、イネ第1染色体上のsd-1周辺部分に、ササニシキ・ハバタキ間での一塩基置換多型を含む多型を多数見出した。得られた多型のいくつかについて、CAPSまたはdCAPS法でジェノタイピングが可能となるようマーカー化を行った結果、該マーカーを用いることで、イネの半わい性形質の検査が可能となった。

Claim (excerpt)：

植物のsd-1遺伝子周辺領域に存在する多型であって、以下の(A)〜(V)のいずれかに記載の部位、または該部位における塩基と塩基対をなす相補鎖における部位の多型を検出する工程を含む、植物のsd-1遺伝子周辺領域の遺伝子型判定方法。 (A)配列番号:1に記載の塩基配列の103位、144位、199位、203位、204位、または、347位。 (B)配列番号:2に記載の塩基配列の2位、59位、105/106位、110位、151位、304位、375位、439位、568/569位、577位、604位、614位、616位、1562位、1675〜1676位、1732位、1852位、1878位、1935位、2121位、2125/2126位、2503〜2885位、または、3104位。 (C)配列番号:3に記載の塩基配列の58位。 (D)配列番号:4に記載の塩基配列の86位、または、277〜306位。 (E)配列番号:5に記載の塩基配列の78位、331位、337位、364位、373位、405位、423位、481位、539〜551位、583位、593位、661位、685位、または、701位。 (F)配列番号:6に記載の塩基配列の201〜213位、351位、547位、または、840位。 (G)配列番号:7に記載の塩基配列の103位、221位、または、264位。 (H)配列番号:8に記載の塩基配列の59位。 (I)配列番号:9に記載の塩基配列の288位、301位、または、525〜560位。 (J)配列番号:10に記載の塩基配列の124〜342位。 (K)配列番号:11に記載の塩基配列の223位、または、224/225位。 (L)配列番号:12に記載の塩基配列の314位。 (M)配列番号:13に記載の塩基配列の320位。 (N)配列番号:14に記載の塩基配列の70位、137位、170位、または、691位。 (O)配列番号:15に記載の塩基配列の210位。 (P)配列番号:16に記載の塩基配列の380位、または、405位。 (Q)配列番号:17に記載の塩基配列の43位、84位、139位、143位、144位、または、287位。 (R)配列番号:18に記載の塩基配列の101位、161位、196位、または、653位。 (S)配列番号:19に記載の塩基配列の319/320位。 (T)配列番号:20に記載の塩基配列の214位、670位、または、926位。 (U)配列番号:21に記載の塩基配列の194位。 (V)配列番号:22に記載の塩基配列の170位。

IPC (2)：

C12N15/09 ,  C12Q1/68

FI (2)：

C12N15/00 A ,  C12Q1/68 A