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J-GLOBAL ID:200903065403152900
遺伝子発現データの処理方法および処理プログラム
Inventor:
Applicant, Patent owner:
Agent (2):
窪田 英一郎
, 吉田 聡
Gazette classification:再公表公報
Application number (International application number):JP2001004697
Publication number (International publication number):WO2002001477
Application date: Jun. 04, 2001
Publication date: Jan. 03, 2002
Summary:
解析装置10のバックグラウンド算出部32は、DNAチップ上に配置されたスポットのシグナル強度を示す値の各々をバックグラウンド値で減じることで得られる減算値の累積度数比に基づく正規確率グラフが、所定の直線性を備えるようなバックグラウンド値を算出する。シグナル強度を示す値から上記バックグラウンド値が減じられた値である補正シグナル強度値の対数変換値は、正規分布となる。したがって、これを標準化することにより、同種のDNAチップ或いは異種のDNAチップから測定されたデータの比較をなすことが可能となる。
Claim (excerpt):
DNAチップのハイブリダイゼーションにより、DNAチップ上に配置された各スポットのシグナル強度を示す値から構成されるアレイデータを処理して、解析可能なデータを取得するデータ処理方法であって、
前記アレイデータを取得するステップと、
当該アレイデータを構成する各スポットのシグナル強度を示す値を対数変換するステップと、
対数変換された値を、前記DNAチップのスポットに対応するように配置した変換データを生成するステップとを備えたことを特徴とするデータ処理方法。
IPC (4):
G01N37/00
, G01N33/53
, G06F17/15
, G06F17/18
FI (5):
G01N37/00 102
, G01N33/53 M
, G06F17/15
, G06F17/18 D
, C12N15/00 F
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