核酸をベースとする検出

Inventor： , ,
Applicant, Patent owner：
Agent (1)：社本一夫 (外5名)
Gazette classification：公表公報
Application number (International application number)：2000618716
Publication number (International publication number)：2003508729
Application date： May. 12, 2000
Publication date： Mar. 04, 2003
Summary：

【要約】本発明は、アプタマー・ビーコンを使用して、サンプル中の1又はそれを越える異なる化合物の存在及び量を同時に検出するための組成物、システム及び方法に関する。アプタマー・ビーコンは、タンパク質、ステロイド、又は無機分子のような非核酸標的分子に結合できる結合領域を有するオリゴヌクレオチドである。異なる標的分子に結合するように配置された結合領域を有するこれら新規なアプタマー・ビーコンは、溶液、固体、アレイをベースとする系で使用されることができる。これらアプタマー・ビーコンは、固体支持体、例えば、2次元アレイの予め決められた異なる諸点に付けられることができる。本発明は、この方法を実施するための装置、手段、及びコンピューターソフトウェアを包含する。

Claim (excerpt)：

非核酸標的分子に結合するアプタマー・ビーコンであって: ループ部分、第1セグメント、及び該第1セグメントに相補的な第2セグメントを含んでなるオリゴヌクレオチドであって、該第1及び第2セグメントが一緒にハイブリダイズしたときにステム部分を形成するオリゴヌクレオチド; 該オリゴヌクレオチドによって形成され、かつ該非核酸標的分子に結合するように配置された結合領域; 該第1セグメントに付いている第1リポーター基;及び該第2セグメントに付いている第2リポーター基であって、それらの間の距離が変化したときに相互作用して検出可能な信号を発する第1及び第2リポーター基を含んでなるアプタマー・ビーコンであり; 該結合領域への該標的分子の結合が、該ステム部分内の塩基対結合を破壊することで、該第1及び第2セグメントを離れさせるところの該アプタマー・ビーコンのコンフォメーションの変化を生じさせることにより、該第1及び第2リポーター基の間の距離を変化させて、検出可能な信号を発するアプタマー・ビーコン。

IPC (12)：

G01N 33/58 , C12N 15/09 ZNA , C12Q 1/68 , G01N 21/27 , G01N 21/64 , G01N 21/65 , G01N 21/78 , G01N 33/53 , G01N 33/533 , G01N 33/543 595 , G01N 33/566 , G01N 33/569

FI (13)：

G01N 33/58 A , C12Q 1/68 A , G01N 21/27 C , G01N 21/64 F , G01N 21/64 G , G01N 21/65 , G01N 21/78 C , G01N 33/53 L , G01N 33/533 , G01N 33/543 595 , G01N 33/566 , G01N 33/569 B , C12N 15/00 ZNA A

F-Term (55)：

2G043AA03 , 2G043BA16 , 2G043CA03 , 2G043DA02 , 2G043DA06 , 2G043EA01 , 2G043EA03 , 2G043HA05 , 2G043JA01 , 2G043JA02 , 2G043JA03 , 2G043KA02 , 2G043KA09 , 2G043LA01 , 2G043LA03 , 2G045AA13 , 2G045CA25 , 2G045CA26 , 2G045DA36 , 2G045DA41 , 2G045FA11 , 2G045FA12 , 2G045FB02 , 2G045FB07 , 2G045FB12 , 2G045GC15 , 2G054AA07 , 2G054CA21 , 2G054CA23 , 2G054CE02 , 2G054EA03 , 2G054EA07 , 2G054GA05 , 2G054JA01 , 2G059AA01 , 2G059AA05 , 2G059BB04 , 2G059CC12 , 2G059CC16 , 2G059DD03 , 2G059DD13 , 2G059EE02 , 2G059EE04 , 2G059EE09 , 2G059JJ12 , 2G059KK04 , 4B024AA11 , 4B024AA20 , 4B024CA01 , 4B024CA11 , 4B024HA20 , 4B063QA01 , 4B063QA11 , 4B063QR32 , 4B063QR35

Patent cited by the Patent：

Cited by examiner (1)

試料中の核酸被検物質を検出するための装置および方法
Gazette classification：公開公報 Application number：特願平9-346496 Applicant：ヴァイシス・インコーポレーテッド

Article cited by the Patent：

Cited by examiner (5)

Molecular beacons: a new approach for semiautomated mutation analysis
Determination of interactions between structured nucleic acids by fluorescence resonance energy tran
In vitro selection of RNA molecules that bind specific ligands

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