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J-GLOBAL ID:200903069343734110

ミスマッチ検出分子及びそれを用いたミスマッチの検出方法

Inventor:
Applicant, Patent owner:
Agent (1): 佐伯 憲生
Gazette classification:公開公報
Application number (International application number):2003115609
Publication number (International publication number):2004325074
Application date: Apr. 21, 2003
Publication date: Nov. 18, 2004
Summary:
【課題】本発明は、ハイブリダイゼーションにより、特定の塩基に対する塩基対のミスマッチをより簡便でしかも高感度で検出しうる方法、とりわけ、A-Aミスマッチを簡便でしかも高感度で検出しうる方法を提供するものである。【解決手段】本発明は、次の一般式(II)、【化1】(式中、R1は、水素原子又はアルキル基などであって、当該アルキル基中の炭素原子は酸素原子又は窒素原子で置換されてもよい、R2、R3はそれぞれ独立して2価のアルキル基であって、当該アルキル基中の炭素原子は酸素原子、窒素原子又はカルボニル基で置換されてもよい。)で表される化合物からなるミスマッチの塩基対、特にAAミスマッチを検出、同定するための試薬、及びそれを用いたミスマッチ塩基対の検出、同定方法に関する。【選択図】 なし
Claim (excerpt):
検体となる1本鎖のDNA又はRNAと、それに対応する正常な塩基配列を有するDNA又はRNAとをハイブリダイズさせ、次いで当該ハイブリダイズしたDNA又はRNAにおける正常な塩基対を形成することができない塩基の対を、次の一般式(I)、 A-L-X (I) (式中、Aは正常な塩基対を形成することができない塩基の対の片方の塩基と対を形成し得る化学構造部分、Xは前記Aの構造部分と対を形成する塩基と正常な塩基対を形成すべき塩基とは異なる塩基と対を形成し得る化学構造部分、Lは化学構造部分A及びXを結合するリンカー構造を示す。) で表される塩基対のミスマッチ認識分子であって、特定の塩基と対を形成し得る化学構造部分A及び前記Aの構造部分と対を形成する塩基と正常な塩基対を形成すべき塩基とは異なる塩基と対を形成し得る化学構造部分X、並びに当該化学構造部分A及びXを結合するリンカー部分Lを有することを特徴とする化合物を用いて、当該正常な塩基対を形成することができない塩基の対に擬似的に塩基対を形成させ、当該擬似的な塩基対の状態を測定することからなる正常な塩基対を形成することができない塩基の対を検出、同定することからなるDNA又はRNAにおける塩基配列の異常を検出する方法。
IPC (4):
G01N33/53 ,  C07D519/00 ,  C12Q1/68 ,  G01N33/566
FI (5):
G01N33/53 M ,  C07D519/00 311 ,  C12Q1/68 A ,  G01N33/566 ,  C12N15/00 A
F-Term (9):
4B024AA11 ,  4B024CA01 ,  4B024HA14 ,  4B063QA18 ,  4B063QQ42 ,  4B063QR55 ,  4B063QR90 ,  4B063QS34 ,  4C072MM02
Patent cited by the Patent:
Cited by examiner (4)
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