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J-GLOBAL ID：200903072865767877

遺伝子実験データ表示方法

Inventor： 中重 亮 ,  野崎 康行 ,  渡辺 恒彦 ,  田村 卓郎
Applicant, Patent owner： 日立ソフトウエアエンジニアリング株式会社
Agent (1)： 平木 祐輔 (外1名)
Gazette classification：公開公報
Application number (International application number)：2000280052
Publication number (International publication number)：2001340079
Application date： Sep. 14, 2000
Publication date： Dec. 11, 2001
Summary：

【要約】 (修正有)【課題】 1種類の遺伝子発現データをもとにして、2つの実験結果から他の複数遺伝子発現データを比較し、分類状況および変化の状況を把握するために有効なビジュアル表示を提供する。【解決手段】 試料Aと試料Bの発現量データと試料Aと試料Cの発現量データを、2つの実験で共通に用いられた試料Aに対する遺伝子発現強度データを媒介として結合して一つの3次元データに変換し、球体内の点として表示し、あるいは、試料Aと試料Bの比と試料Aと試料Cの比に着目して球面上へマッピングすることで、各遺伝子の試料A,B,Cにおける発現状況を球面上の分布として表示する。これら球体内の点の分布や球面上の点の分布をもとにクラスタ分析することで、3種類の試料における遺伝子発現状況をビジュアルに把握する。

Claim (excerpt)：

試料Aと試料Bを用いた実験で得られた試料Aと試料Bに対する複数の遺伝子の発現強度データと、試料Aと試料Cを用いた実験で得られた試料Aと試料Cに対する前記複数の遺伝子の発現強度データを、2つの実験で共通に用いられた試料Aに対する遺伝子発現強度データを媒介として結合し、前記結合によって得られた結果を表示することを特徴とする遺伝子実験データ表示方法。

IPC (5)：

C12N 15/09 ,  C12Q 1/68 ,  G01N 33/53 ,  G01N 33/566 ,  G01N 37/00 102

FI (6)：

C12Q 1/68 A ,  G01N 33/53 M ,  G01N 33/53 Z ,  G01N 33/566 ,  G01N 37/00 102 ,  C12N 15/00 A

F-Term (12)：

4B024AA19 ,  4B024AA20 ,  4B024CA12 ,  4B024HA11 ,  4B063QA01 ,  4B063QA11 ,  4B063QA18 ,  4B063QQ42 ,  4B063QR32 ,  4B063QS34 ,  4B063QS39 ,  4B063QX01

Patent cited by the Patent：

Cited by examiner (1)

• 発現比較のコンピュ-タ支援による視覚化
  Gazette classification：公開公報   Application number：特願平11-030642   Applicant：アフィメトリックス・インコーポレーテッド

Article cited by the Patent：

Cited by examiner (1)

• Gene expression profiling of alveolar rhabdomyosarcoma with cDNA microarrays