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J-GLOBAL ID：200903077150316861
配列情報抽出装置、配列情報抽出方法および配列情報抽出プログラム
Inventor：
,
Applicant, Patent owner：
Agent (1)：
溝井 章司
Gazette classification：公開公報
Application number (International application number)：2004299926
Publication number (International publication number)：2006113786
Application date： Oct. 14, 2004
Publication date： Apr. 27, 2006
Summary：
【課題】 任意のテキストデータに含まれる核酸配列およびアミノ酸配列を抽出し、抽出した配列の配列情報を取得し、取得した配列情報を配列文字列にリンクしたリンクファイルを作成できるようにする。【解決手段】 配列情報抽出装置100において、テキスト入力部110は任意のテキストデータを入力する。候補文字列抽出部130はテキストデータに含まれる文字列から、核酸配列の候補文字列とアミノ酸配列の候補文字列との少なくともいずれかの候補文字列を抽出する。配列情報取得部150は、抽出した候補文字列に対して、候補文字列に相同する配列の配列情報をデータベースから取得する。情報リンクファイル生成部170は、抽出した候補文字列と、取得した配列情報とをリンクさせた情報リンクファイルを生成する。【選択図】 図6
Claim (excerpt)：
核酸配列とアミノ酸配列との少なくともいずれかの配列情報を記憶するデータベースに接続する配列情報抽出装置において、
テキストデータを入力するテキスト入力部と、
テキスト入力部が入力したテキストデータに含まれる文字列から、核酸配列の候補文字列とアミノ酸配列の候補文字列との少なくともいずれかの候補文字列を抽出する候補文字列抽出部と、
候補文字列抽出部が抽出した候補文字列に対して、候補文字列に相同する配列の配列情報をデータベースから取得する配列情報取得部と
を備えたことを特徴とする配列情報抽出装置。
IPC (1)：
FI (1)：
Patent cited by the Patent：
Cited by applicant (2)
Cited by examiner (3)
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