微生物菌種推定システム及び方法

Inventor： ,
Applicant, Patent owner： ,
Agent (1)：小林良平
Gazette classification：公開公報
Application number (International application number)：2005216546
Publication number (International publication number)：2006191922
Application date： Jul. 26, 2005
Publication date： Jul. 27, 2006
Summary：

【課題】高い精度で簡便に菌種推定を行うことができるシステムを提供する。【解決手段】被検菌由来の塩基配列と既知微生物由来の塩基配列との間に見られる相同性から、該被検菌の菌種を推定する菌種推定システムにおいて、既知微生物の保存性の高い遺伝子について、少なくともその塩基配列及び由来生物種名を含む配列データを記載した配列データベースと、被検菌の保存性の高い遺伝子の塩基配列と、上記配列データベースに記載された塩基配列とを比較し、該配列データベースの中から被検菌の塩基配列と相同性の高い配列データを検索する相同性検索手段とを設ける。【選択図】図1

Claim (excerpt)：

被検菌由来の塩基配列と既知微生物由来の塩基配列との間に見られる相同性から、該被検菌の菌種を推定する菌種推定システムであって、 a)既知微生物の保存性の高い遺伝子について、少なくともその塩基配列及び由来生物種名を含む配列データを記載した配列データベースと、 b)被検菌の保存性の高い遺伝子の塩基配列と、上記配列データベースに記載された塩基配列とを比較し、該配列データベースの中から被検菌の塩基配列と相同性の高い配列データを検索する相同性検索手段と、を備えることを特徴とする菌種推定システム。

IPC (2)：

C12Q 1/68 , C12N 15/09

FI (2)：

C12Q1/68 Z , C12N15/00 A

F-Term (18)：

4B024AA11 , 4B024CA01 , 4B024CA04 , 4B024CA11 , 4B024GA27 , 4B024HA11 , 4B063QA18 , 4B063QQ05 , 4B063QQ43 , 4B063QQ44 , 4B063QQ54 , 4B063QR32 , 4B063QR35 , 4B063QR39 , 4B063QR40 , 4B063QR62 , 4B063QR74 , 4B063QS25

Patent cited by the Patent：

Cited by examiner (4)

抗菌処理方法および抗菌効果のモニタリング方法
Gazette classification：公開公報 Application number：特願2001-001427 Applicant：栗田工業株式会社
DNA断片増幅方法、DNA断片増幅装置、微生物群測定方法、微生物群分析方法および汚染物質測定方法
Gazette classification：公開公報 Application number：特願平11-069694 Applicant：三洋電機株式会社, 社団法人農林水産先端技術産業振興センター
微生物分析システム及び方法並びにデータベース
Gazette classification：公開公報 Application number：特願2000-194331 Applicant：三洋電機株式会社

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Article cited by the Patent：

Cited by examiner (2)

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