特異的プライマー及びプローブセットを使用するHLA-Bタイピングの方法

Inventor： , , ,
Applicant, Patent owner：
Agent (1)：津国肇 (外2名)
Gazette classification：公表公報
Application number (International application number)：1994520580
Publication number (International publication number)：1996507690
Application date： Mar. 07, 1994
Publication date： Aug. 20, 1996
Summary：

【要約】本発明は、試料中に存在するかもしれない、エクソン2の30〜33位(番号付けは、ZemmourとParham,1992による)のGCCA配列により特徴付けられる1つ以上のHLA-B対立遺伝子をタイピング又はサブタイピングする方法に関し、この方法は、少なくとも下記:はその配列変異体より選択される少なくとも1つの5’末端増幅プライマーを、上記で定義した5’末端プライマーと同一の対立遺伝子から選択される適切な3’末端プライマーと組合せて(5’及び3’末端プライマーは、場合により標識されている)、HLA-B対立遺伝子を増幅し;そして(ii)増幅中又は増幅後に標識された増幅産物を、適切な条件で、HLA-Bエクソン2領域の15〜261領域(番号付けは、ZemmourとParham,1992による)から選択される1つ以上の適切なプローブとハイブリダイズさせて;(iii)適切な洗浄条件で洗浄し;(iv)形成されたハイブリッドを検出し;そして(v)観察されるハイブリダイゼーションパターンから存在する対立遺伝子を推定する工程よりなる。

Claim (excerpt)：

HLA-B対立遺伝子のエクソン2の30〜33位(番号付けは、ZemmourとParham,1992による)の5’-GCCA-3’配列により特徴づけられる試料中の1つ以上のHLA-B対立遺伝子をタイピング又はサブタイピングするための方法であって、更に詳しくは、例えばB54(22)、B52(5)、B7801、B62(15)、B75(15)、B71(70)、B72(70)、B46、B79、B53、B5102、B5103及びB58(17)のような、血清学的には識別が困難であるHLA-Bタイプを識別する方法であって、少なくとも下記の工程: (i)場合により試料中の核酸を抽出し、 (ii)HLA-B対立遺伝子のエクソン2の30〜33位の5’-GCCA-3’配列により特徴づけられるHLA-B対立遺伝子の核酸を、下記のリスト:又は次のようなこれの配列変異体、又は他の配列変異体(これらの配列変異体は、1つ以上のヌクレオチドの欠失、及び/又は挿入、及び/又は置換を含むが、3’末端に5’-GCCA-3’配列が保存されており、かつこれらの配列変異体が上記のB25Pプライマー又はその変異体と同一のHLA-B対立遺伝子を特異的に増幅させることができる)から選択される少なくとも1つの5’末端増幅プライマーと一緒に、上記で定義された5’末端プライマーと同一の対立遺伝子から選択される適切な3’末端プライマー(5’及び3’末端プライマーは、場合により標識されている)と組合せて増幅し;そして (iii)場合により増幅中又は増幅後に標識された増幅産物を、適切な条件で、HLA-Bエクソン2領域の15〜261領域(番号付けは、ZemmourとParham,1992による)から選択される1つ以上の適切なプローブとハイブリダイズさせて、 (iv)適切な洗浄条件で洗浄し、 (v)形成されたハイブリッドを検出し;そして (vi)観察されるハイブリダイゼーションパターンから存在する対立遺伝子を推定する、よりなることを特徴とする方法。

IPC (3)：

C12Q 1/68 , C07H 21/04 , C12N 15/09 ZNA

Patent cited by the Patent：

Cited by examiner (1)

HLAクラスI DNAタイプの決定方法及びそのためのキット
Gazette classification：公開公報 Application number：特願平4-295646 Applicant：エフ.ホフマン-ラロシュアクチェンゲゼルシャフト

Article cited by the Patent：

Cited by examiner (5)

Hum.Immunol.,Vol.34,No.4(1992)p.257-266
Immunogenetics,Vol.36,No.5(1992)p.277-282
Lancet,Vol.337,No.8742(1991)p.640-642

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