クラスタリング結果評価方法及びクラスタリング結果表示方法

Inventor： , , , ,
Applicant, Patent owner：
Agent (1)：平木祐輔 (外1名)
Gazette classification：公開公報
Application number (International application number)：2001181928
Publication number (International publication number)：2003028855
Application date： Jun. 15, 2001
Publication date： Jan. 29, 2003
Summary：

【要約】【課題】複数のクラスタリング結果から、各クラスタリング方法がどれくらい信頼できるか、どのような特徴をもっているかを評価する方法、及び、機能が未知の遺伝子を推測する際に、その遺伝子が指定された生物学的機能を持つ度合いを評価する方法及び表示方法を提供する。【解決手段】生物学的機能が既知の遺伝子の分類のされ方、例えば該当する生物学的機能であると正しく判別した割合をみることで、各クラスタリング方法がうまくいっているかどうかを判断する。また、機能が未知の遺伝子が、複数のクラスタリング結果でどのようなクラスタに属しているのかをみることによって、指定された生物学的機能を持つ度合いを評価する。

Claim (excerpt)：

複数の遺伝子を、その発現パターンに基づいて所定のクラスタリング方法によってクラスタリングした結果を評価する、遺伝子のクラスタリング結果評価方法において、クラスタリングの結果、所定の生物学的機能を持つと判別された遺伝子群について、当該遺伝子群に属する生物学的機能が既知の遺伝子のうち前記所定の生物学的機能を持つことが既知の遺伝子の割合に基づいてクラスタリングの結果を評価することを特徴とする遺伝子のクラスタリング結果評価方法。

IPC (2)：

G01N 33/50 , C12Q 1/68

FI (2)：

G01N 33/50 P , C12Q 1/68 A

F-Term (14)：

2G045DA12 , 2G045DA13 , 4B063QA08 , 4B063QA18 , 4B063QQ42 , 4B063QQ52 , 4B063QR08 , 4B063QR42 , 4B063QR55 , 4B063QR62 , 4B063QS25 , 4B063QS34 , 4B063QS39 , 4B063QX01

Patent cited by the Patent：

Cited by examiner (1)

遺伝子発現パターン表示方法および装置
Gazette classification：公開公報 Application number：特願平11-277918 Applicant：日立ソフトウエアエンジニアリング株式会社

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