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J-GLOBAL ID：200903094692999630

SDF-1結合核酸

Inventor： プルシュケ,ヴェルナー ,  ヤロシュ,フロリアン ,  クルースマン,スヴェン ,  オイルベルク,ディルク ,  ブッフナー,クラウス ,  マーシュ,クリスティアン ,  ディンゼ,ニコーレ
Applicant, Patent owner： ノクソン・ファルマ・アクチエンゲゼルシャフト
Agent (9)： 奥山 尚一 ,  有原 幸一 ,  松島 鉄男 ,  河村 英文 ,  吉田 尚美 ,  中村 綾子 ,  岡本 正之 ,  深川 英里 ,  森本 聡二
Gazette classification：公表公報
Application number (International application number)：2009519869
Publication number (International publication number)：2009543567
Application date： Jul. 18, 2007
Publication date： Dec. 10, 2009
Summary：

A型核酸分子、B型核酸分子、C型核酸分子、ならびに配列番号142、配列番号143、および配列番号144のいずれかの核酸配列を有する核酸分子を含む群から選択され、好ましくはSDF-1に結合する核酸分子。 前記A型核酸分子が下記のコアヌクレオチド配列、 5’AAAGYRACAHGUMAAXAUGAAAGGUARC3’(配列番号19) (式中、XAは不在またはAである)を含む、請求項1に記載の核酸分子。 前記A型核酸分子が、 5’AAAGYRACAHGUMAAUGAAAGGUARC3’(配列番号20) 5’AAAGYRACAHGUMAAAUGAAAGGUARC3’(配列番号21)、および、 5’AAAGYAACAHGUCAAUGAAAGGUARC3’(配列番号22) を含む群から選択されるコアヌクレオチド配列を含み、好ましくは前記コアヌクレオチド配列が5’AAAGYAACAHGUCAAUGAAAGGUARC3’(配列番号22)を含む、請求項2に記載の核酸分子。 前記核酸分子が、5’→3’の方向に、ヌクレオチドの第1のストレッチ、前記コアヌクレオチド配列、およびヌクレオチドの第2のストレッチを含む、請求項2および3のいずれかに記載の核酸分子。 前記核酸分子が、5’→3’の方向に、ヌクレオチドの第2のストレッチ、前記コアヌクレオチド配列、およびヌクレオチドの第1のストレッチを含む、請求項2および3のいずれかに記載の核酸分子。 前記核酸分子が前記ヌクレオチドの第1のストレッチおよび前記ヌクレオチドの第2のストレッチを含み、前記ヌクレオチドの第1のストレッチおよび前記ヌクレオチドの第2のストレッチが任意選択的に相互にハイブリダイズし、これによりハイブリダイゼーションのときに2本鎖構造が形成される、請求項4または5に記載の核酸分子。 前記2本鎖構造が4〜6塩基対、好ましくは5塩基対からなる、請求項4〜6のいずれかに記載の核酸分子。 前記ヌクレオチドの第1のストレッチが5’X1X2NNBV3’(配列番号44)のヌクレオチド配列を含み、前記ヌクレオチドの第2のストレッチが5’BNBNX3X43’(配列番号45)のヌクレオチド配列を含む、請求項4〜7のいずれかに記載の核酸分子 (式中、X1は不在もしくはRであり、X2はSであり、X3はSであり、X4は不在もしくはYであるか、 または、 X1は不在であり、X2は不在もしくはSであり、X3は不在もしくはSであり、X4は不在である)。 前記ヌクレオチドの第1のストレッチが5’RSHRYR3’(配列番号23)のヌクレオチド配列を含み、前記ヌクレオチドの第2のストレッチが5’YRYDSY3’(配列番号24)のヌクレオチド配列を含み、 好ましくは前記ヌクレオチドの第1のストレッチが5’GCUGUG3’のヌクレオチド配列を含み、前記ヌクレオチドの第2のストレッチが5’CGCAGC3’のヌクレオチド配列を含む、請求項4〜8のいずれかに記載の核酸分子。 前記ヌクレオチドの第1のストレッチが5’X2BBBS3’(配列番号42)のヌクレオチド配列を含み、前記ヌクレオチドの第2のストレッチが5’SBBVX33’(配列番号43)のヌクレオチド配列を含み(式中、X2は不在またはSであり、X3は不在またはSである)、 好ましくは、前記ヌクレオチドの第1のストレッチは5’CUGUG3’のヌクレオチド配列を含み、前記ヌクレオチドの第2のストレッチは5’CGCAG3’のヌクレオチド配列を含むか、または前記ヌクレオチドの第1のストレッチは5’GCGUG3’のヌクレオチド配列を含み、前記ヌクレオチドの第2のストレッチは5’CGCGC3’のヌクレオチド配列を含む、請求項4〜8のいずれかに記載の核酸分子。 前記核酸分子が配列番号5〜18、25〜41、133、137、139〜141のいずれかの核酸配列を有する、請求項2〜10のいずれかに記載の核酸分子。 前記B型核酸分子が下記のコアヌクレオチド配列、 5’GUGUGAUCUAGAUGUADWGGCUGWUCCUAGUYAGG3’(配列番号57) を含む、請求項1に記載の核酸分子。 前記B型核酸分子が、 5’GUGUGAUCUAGAUGUADUGGCUGAUCCUAGUCAGG3’(配列番号58) のコアヌクレオチド配列を含む、請求項12に記載の核酸分子。 前記核酸分子が、5’→3’の方向に、ヌクレオチドの第1のストレッチ、前記コアヌクレオチド配列、およびヌクレオチドの第2のストレッチを含む、請求項12および13のいずれかに記載の核酸分子。 前記核酸分子が、5’→3’の方向に、ヌクレオチドの第2のストレッチ、前記コアヌクレオチド配列、およびヌクレオチドの第1のストレッチを含む、請求項12および13のいずれかに記載の核酸分子。 前記核酸分子が前記ヌクレオチドの第1のストレッチおよび前記ヌクレオチドの第2のストレッチを含み、前記ヌクレオチドの第1のストレッチおよび前記ヌクレオチドの第2のストレッチが任意選択的に相互にハイブリダイズし、これによりハイブリダイゼーションのときに2本鎖構造が形成される、請求項14または15に記載の核酸分子。 前記2本鎖構造が4〜6塩基対、好ましくは5塩基対からなる、請求項14〜16のいずれかに記載の核酸分子。 前記ヌクレオチドの第1のストレッチが5’X1X2SVNS3’(配列番号77)のヌクレオチド配列を含み、前記ヌクレオチドの第2のストレッチが5’BVBSX3X43’(配列番号78)のヌクレオチド配列を含み (式中、X1は不在もしくはAであり、X2はGであり、X3はCであり、X4は不在もしくはUであるか、 または、 X1は不在であり、X2は不在もしくはGであり、X3は不在もしくはCであり、X4は不在である)、請求項14〜17のいずれかに記載の核酸分子。 前記ヌクレオチドの第1のストレッチが5’X1GCRWG3’(配列番号59)のヌクレオチド配列を含み、前記ヌクレオチドの第2のストレッチが5’KRYSCX43’(配列番号60)のヌクレオチド配列を含む(式中、X1は不在またはAであり、X4は不在またはUである)、請求項14〜18のいずれかに記載の核酸分子。 前記ヌクレオチドの第1のストレッチが5’X1GCGUG3’(配列番号75)のヌクレオチド配列を含み、前記ヌクレオチドの第2のストレッチが5’UACGCX43’(配列番号76)のヌクレオチド配列を含み(式中、X1は不在またはAであり、X4は不在またはUである)、 好ましくは、前記ヌクレオチドの第1のストレッチは5’AGCGUG3’のヌクレオチド配列を含み、前記ヌクレオチドの第2のストレッチは5’UACGCU3’のヌクレオチド配列を含む、請求項14〜19のいずれかに記載の核酸分子。 前記ヌクレオチドの第1のストレッチが5’X2SSBS3’(配列番号73)のヌクレオチド配列を含み、前記ヌクレオチドの第2のストレッチが5’BVSSX33’(配列番号74)のヌクレオチド配列を含み(式中、X2は不在またはGであり、X3は不在またはCである)、 好ましくは、前記ヌクレオチドの第1のストレッチは5’GCGUG3’のヌクレオチド配列を含み、前記ヌクレオチドの第2のストレッチは5’UACGC3’のヌクレオチド配列を含む、請求項14〜18のいずれかに記載の核酸分子。 前記核酸分子が配列番号46〜56、61〜72、および132のいずれかの核酸配列を有する、請求項12〜21のいずれかに記載の核酸分子。 前記C型核酸分子が、 GGUYAGGGCUHRXAAGUCGG(配列番号90) (式中、XAは不在またはAである)のコアヌクレオチド配列を含む、請求項1に記載の核酸分子。 前記C型核酸分子が、 5’GGUYAGGGCUHRAAGUCGG3’(配列番号91)、 5’GGUYAGGGCUHRAGUCGG3’(配列番号92)、および、 5’GGUUAGGGCUHGAAGUCGG3’(配列番号93) を含む群から選択されるコアヌクレオチド配列を含み、好ましくは前記コアヌクレオチド配列が5’GGUUAGGGCUHGAAGUCGG3’(配列番号93)を含む、請求項23に記載の核酸分子。 前記核酸分子が、5’→3’の方向に、ヌクレオチドの第1のストレッチ、前記コアヌクレオチド配列、およびヌクレオチドの第2のストレッチを含む、請求項23および24のいずれかに記載の核酸分子。 前記核酸分子が、5’→3’の方向に、ヌクレオチドの第2のストレッチ、前記コアヌクレオチド配列、およびヌクレオチドの第1のストレッチを含む、請求項23および24のいずれかに記載の核酸分子。 前記核酸分子が前記ヌクレオチドの第1のストレッチおよび前記ヌクレオチドの第2のストレッチを含み、前記ヌクレオチドの第1のストレッチの少なくとも一部分および前記ヌクレオチドの第2のストレッチの少なくとも一部分が任意選択的に相互にハイブリダイズし、これによりハイブリダイゼーションのときに2本鎖構造が形成される、請求項25または26に記載の核酸分子。 前記第1のストレッチの長さおよび前記第2のストレッチの長さが個別に独立して0〜17ヌクレオチド、好ましくは4〜10ヌクレオチド、より好ましくは4〜6ヌクレオチドである、請求項25〜27のいずれかに記載の核酸分子。 前記2本鎖構造が、4〜10塩基対、好ましくは4〜6塩基対、より好ましくは5塩基対を含む、請求項27および28のいずれかに記載の核酸分子。 前記2本鎖構造が、連続する4〜10塩基対、好ましくは連続する4〜6塩基対、より好ましくは連続する5塩基対を含む、請求項29に記載の核酸分子。 前記ヌクレオチドの第1のストレッチが5’RKSBUSNVGR3’(配列番号120)のヌクレオチド配列を含み、前記ヌクレオチドの第2のストレッチが5’YYNRCASSMY3’(配列番号121)のヌクレオチド配列を含み、 好ましくは前記ヌクレオチドの第1のストレッチが5’RKSBUGSVGR3’(配列番号122)のヌクレオチド配列を含み、前記ヌクレオチドの第2のストレッチが5’YCNRCASSMY3’(配列番号123)のヌクレオチド配列を含む、請求項25〜30のいずれかに記載の核酸分子。 前記ヌクレオチドの第1のストレッチが5’XSSSSV3’(配列番号124)のヌクレオチド配列を含み、前記ヌクレオチドの第2のストレッチが5’BSSSXS3’(配列番号125)のヌクレオチド配列を含む(式中、XSは不在またはSである)、請求項25〜30のいずれかに記載の核酸分子。 前記ヌクレオチドの第1のストレッチが5’SSSSR3’(配列番号130)のヌクレオチド配列を含み、前記ヌクレオチドの第2のストレッチが5’YSBSS3’(配列番号131)のヌクレオチド配列を含み、 好ましくは前記ヌクレオチドの第1のストレッチが5’SGGSR3’(配列番号126)のヌクレオチド配列を含み、前記ヌクレオチドの第2のストレッチが5’YSCCS3’(配列番号127)のヌクレオチド配列を含む、請求項25〜30および32のいずれかに記載の核酸分子。 前記ヌクレオチドの第1のストレッチが5’GCSGG3’(配列番号128)のヌクレオチド配列を含み、前記ヌクレオチドの第2のストレッチが5’CCKGC3’(配列番号129)のヌクレオチド配列を含み、 好ましくは、前記ヌクレオチドの第1のストレッチが5’GCCGG3’のヌクレオチド配列を含み、前記ヌクレオチドの第2のストレッチが5’CCGGC3’のヌクレオチド配列を含む、請求項25〜30、32および33のいずれかに記載の核酸分子。 前記ヌクレオチドの第1のストレッチが5’CGUGCGCUUGAGAUAGG3’のヌクレオチド配列を含み、前記ヌクレオチドの第2のストレッチが5’CUGAUUCUCACG3’のヌクレオチド配列を含む、請求項25〜30のいずれかに記載の核酸分子。 前記ヌクレオチドの第1のストレッチが5’UGAGAUAGG3’のヌクレオチド配列を含み、前記ヌクレオチドの第2のストレッチが5’CUGAUUCUCA3’のヌクレオチド配列を含む、請求項25〜30のいずれかに記載の核酸分子。 前記ヌクレオチドの第1のストレッチが5’GAGAUAGG3’のヌクレオチド配列を含み、ヌクレオチドの第2のストレッチが5’CUGAUUCUC3’のヌクレオチド配列を含む、請求項25〜30のいずれかに記載の核酸分子。 前記核酸分子が配列番号79〜89、94〜119、および134〜136のいずれかの核酸配列を有する、請求項23〜37のいずれかに記載の核酸分子。 前記核酸分子が配列番号142〜144のいずれかの核酸配列を有する、請求項1に記載の核酸分子。 前記核酸分子がSDF-1に対するアンタゴニストである、請求項1〜39のいずれかに記載の核酸分子。 前記核酸分子がSDF-1受容体系のアンタゴニストであり、好ましくはSDF-1受容体系のSDF-1受容体がCXCR4受容体である、請求項1〜39のいずれかに記載の核酸分子。 前記SDF-1がヒトSDF-1であり、および/または前記SDF-1受容体系の前記SDF-1受容体がヒトSDF-1受容体である、請求項1または41のいずれかに記載の核酸分子。 前記SDF-1が配列番号1のアミノ酸配列を含む、請求項1〜42のいずれかに記載の核酸分子。 前記核酸分子が修飾を含む、請求項1〜43のいずれかに記載の核酸分子。 前記修飾がHES部分およびPEG部分を含む群から選択される、請求項44に記載の核酸分子。 前記修飾が直鎖または分枝鎖のPEGからなるPEG部分であり、前記PEG部分の分子量は好ましくは約2〜180kDであり、より好ましくは約60〜140kDであり、最も好ましくは約40kDである、請求項45に記載の核酸分子。 前記修飾がHES部分であり、好ましくは前記HES部分の分子量が約10〜130kDであり、より好ましくは約30〜130kDであり、最も好ましくは約100kDである、請求項45に記載の核酸分子。 前記核酸の前記ヌクレオチドがL-ヌクレオチドであり、好ましくは配列番号19、20、21、22、57、58、90、91、92および93のいずれかの配列のヌクレオチドである、請求項1〜47のいずれかに記載の核酸分子。 請求項1〜48のいずれかに記載の核酸と任意選択的にさらなる構成成分とを含む医薬組成物であって、前記構成成分が、薬学的に許容可能な賦形剤と薬学的活性剤とを含む群から選択される医薬組成物。 薬物の製造のための請求項1〜48のいずれかに記載の核酸の使用。 前記薬物が疾患または障害の治療および/または予防のためのものであり、該疾患または障害がSDF-1により媒介され、好ましくは該疾患または障害は眼底の疾患、例えば糖尿病性網膜症および加齢性黄斑変性;乳房、卵巣、前立腺、膵臓、甲状腺、鼻咽頭、結腸、肺および胃の癌;骨肉腫;黒色腫;神経膠腫;髄芽腫および神経芽腫;白血病;WHIM症候群;免疫不全症候群;病的血管形成;炎症;多発性硬化症;慢性関節リウマチ/変形性関節症および腎炎を含む群から選択される、請求項50に記載の使用。 前記薬物が血管新生、血管形成、炎症および転移を抑制するためのものである、請求項50に記載の使用。 診断手段の製造のための請求項1〜48のいずれかに記載の核酸の使用。 前記診断手段が疾患の診断のためのものであり、該疾患がSDF-1により媒介され、好ましくは該疾患は眼底の疾患、例えば糖尿病性網膜症および加齢性黄斑変性;乳房、卵巣、前立腺、膵臓、甲状腺、鼻咽頭、結腸、肺および胃の癌;骨肉腫;黒色腫;神経膠腫;髄芽腫および神経芽腫;白血病;WHIM症候群;免疫不全症候群;病的血管新生;炎症;多発性硬化症;慢性関節リウマチ/変形性関節症および腎炎を含む群から選択される、請求項53に記載の使用。 前記診断手段が血管新生、血管形成、炎症および/または転移の診断のためのものである、請求項53に記載の使用。 SDF-1と、請求項1〜48のいずれかに記載の核酸とを含む複合体であって、好ましくは前記複合体が結晶性の複合体である複合体。 SDF-1の検出のための請求項1〜48のいずれかに記載の核酸の使用。 候補SDF-1アンタゴニストおよび/または候補SDF-1アゴニストを提供するステップと、 請求項1〜48のいずれかに記載の核酸を提供するステップと、 SDF-1アンタゴニストおよび/またはSDF-1アゴニストの存在下でシグナルを与える試験系を提供するステップと、 前記候補SDF-1アンタゴニストがSDF-1アンタゴニストであるかどうか、および/または前記候補SDF-1アゴニストがSDF-1アゴニストであるかどうかを決定するステップと を含む、SDF-1アンタゴニストまたはSDF-1アゴニストをスクリーニングするための方法。 相、好ましくは固相に固定化されたSDF-1を提供するステップと、 請求項1〜48のいずれかに記載の核酸、好ましくは標識された請求項1〜48のいずれかに記載の核酸を提供するステップと、 候補SDF-1アゴニストおよび/または候補SDF-1アンタゴニストを添加するステップと、 前記候補SDF-1アゴニストがSDF-1アゴニストであるかどうか、および/または前記候補SDF-1アンタゴニストがSDF-1アンタゴニストであるかどうかを決定するステップと を含む、SDF-1アゴニストおよび/またはSDF-1アンタゴニストをスクリーニングするための方法。 前記核酸が前記候補SDF-1アゴニストにより、または候補SDF-1アンタゴニストにより置き換えられているかどうかが評価されるように前記決定を実施することを特徴とする、請求項59に記載の方法。 請求項1〜48のいずれかに記載の核酸を含むSDF-1の検出のためのキット。 請求項58〜60のいずれかに記載の方法により得られるSDF-1アンタゴニスト。

Claim (excerpt)：

A型核酸分子、B型核酸分子、C型核酸分子、ならびに配列番号142、配列番号143、および配列番号144のいずれかの核酸配列を有する核酸分子を含む群から選択され、好ましくはSDF-1に結合する核酸分子。

IPC (17)：

C12N 15/09 ,  C07K 14/52 ,  C12Q 1/68 ,  A61K 31/713 ,  A61K 31/708 ,  A61P 27/02 ,  A61P 35/00 ,  A61P 35/02 ,  A61P 37/02 ,  A61P 25/00 ,  A61P 29/00 ,  A61P 19/02 ,  A61P 13/12 ,  A61P 35/04 ,  G01N 33/15 ,  G01N 33/50 ,  G01N 33/53

FI (18)：

C12N15/00 A ,  C07K14/52 ,  C12Q1/68 A ,  A61K31/713 ,  A61K31/7088 ,  A61P27/02 ,  A61P35/00 ,  A61P35/02 ,  A61P37/02 ,  A61P25/00 ,  A61P29/00 101 ,  A61P19/02 ,  A61P13/12 ,  A61P29/00 ,  A61P35/04 ,  G01N33/15 Z ,  G01N33/50 Z ,  G01N33/53 P

F-Term (46)：

2G045CA26 ,  2G045DA36 ,  2G045FB01 ,  2G045FB03 ,  2G045FB13 ,  4B024AA01 ,  4B024AA11 ,  4B024BA80 ,  4B024CA05 ,  4B024CA09 ,  4B024HA12 ,  4B024HA17 ,  4B063QA01 ,  4B063QA18 ,  4B063QQ61 ,  4B063QQ79 ,  4B063QR32 ,  4B063QR55 ,  4B063QR82 ,  4B063QS32 ,  4C086AA01 ,  4C086AA02 ,  4C086AA03 ,  4C086EA16 ,  4C086MA01 ,  4C086MA04 ,  4C086NA14 ,  4C086ZA02 ,  4C086ZA33 ,  4C086ZA81 ,  4C086ZA96 ,  4C086ZB07 ,  4C086ZB11 ,  4C086ZB15 ,  4C086ZB26 ,  4C086ZB27 ,  4C086ZC78 ,  4H045AA10 ,  4H045AA20 ,  4H045AA30 ,  4H045BA50 ,  4H045CA40 ,  4H045DA01 ,  4H045EA23 ,  4H045EA50 ,  4H045FA74

Patent cited by the Patent：

Cited by examiner (2)

• 特許第6670149号
  
• 細胞移動アッセイ
  Gazette classification：公表公報   Application number：特願2003-504063   Applicant：ケモセントリックス

Article cited by the Patent：

Cited by examiner (1)

• Invest. Ophthalmol. Vis. Sci., 2005, 46: E-Abstract 3247