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J-GLOBAL ID:200903096922039332

非ウイルス生物の検出及び/又は定量用核酸プローブ

Inventor:
Applicant, Patent owner:
Agent (1): 川口 義雄
Gazette classification:公開公報
Application number (International application number):2000114281
Publication number (International publication number):2000308496
Application date: Nov. 24, 1987
Publication date: Nov. 07, 2000
Summary:
【要約】【課題】 標的非ウイルス生物又は生物と非標的非ウイスル生物又は生物群から区別するためのハイブリダイゼーションアッセイプローブを及びアッセイ手段を提供する。【解決手段】 プローブとして、標的非ウイルス生物又は生物群のヌクレオチド配列の可変領域の少なくとも約10連続ヌクレオチドとハイブリッドし、該可変領域がE. coliの5SrRNA、16SRNA若しくは23SRNA又はS. cerevisiaeの18SRNAもしくは23SRNAのある領域に対応するものである。
Claim (excerpt):
標的生物又は生物群の標的ヌクレオチド配列を非標的生物又は生物群の非標的ヌクレオチド配列から区別するためのハイブリダイゼーションアッセイプローブであって、前記プローブは、前記標的生物がMycobacterium aviumである、ACCGCAAAAGCTTTCCACCAGAAGACATGCGTCTTGAG又はその相補配列、前記標的生物がMycobacterium intracellulareである、ACCGCAAAAGCTTTCCACCTAAAGACATGCGCCTAAAG又はその相補配列、前記標的生物がMycobacterium tuberculosis複合細菌群に属する、TAAAGCGCTTTCCACCACAAGACATGCATCCCGTG又はその相補配列、前記標的生物がMycobacterium tuberculosis複合細菌群に属する、TGCCCTACCCACACCCACCACAAGGTGATGT 又はその相補配列、前記標的生物がMycobacterium tuberculosis複合細菌群に属する、CCATCACCACCCTCCTCCGGAGAGGAAAAGG 又はその相補配列、前記標的生物がMycobacterium tuberculosis複合細菌群に属する、CTGTCCCTAAACCCGATTCAGGGTTCGAGGTTAGATGC又はその相補配列、前記標的生物がMycobacterium tuberculosis複合細菌群に属する、AGGCACTGTCCCTAAACCCGATTCAGGGTTC又はその相補配列、前記標的生物がMycobacterium tuberculosis複合細菌群に属する、CCGCTAAAGCGCTTTCCACCACAAGACATGCATCCCG 又はその相補配列、前記標的生物がMycobacterium tuberculosis複合細菌群に属する、ACACCGCTAAAGCGCTTTCCACCACAAGACATGCATC 又はその相補配列、前記標的生物がMycobacterium属に属する、CCATGCACCACCTGCACACAGGCCACAAGG又はその相補配列、前記標的生物がMycobacterium属に属する、GGCTTGCCCCAGTATTACCACTGACTGGTACGG又はその相補配列、前記標的生物がMycobacterium属に属する、CACCGAATTCGCCTCAACCGGCTATGCGTCACCTC又はその相補配列、前記標的生物がMycobacterium属に属する、GGGGTACGGCCCGTGTGTGTGCTCGCTAGAGGC又はその相補配列、前記非標的生物がMycoplasma pneumoniaeである、GCTTGGTGCTTTCCTATTCTCACTGAAACAGCTACATTCGGC又はその相補配列、前記非標的生物がMycoplasma pneumoniaeである、AATAACGAACCCTTGCAGGTCCTTTCAACTTTGAT又はその相補配列、前記非標的生物がMycoplasma pneumoniaeである、CAGTCAAACTCTAGCCATTACCTGCTAAAGTCATT又はその相補配列、前記非標的生物がMycoplasma pneumoniaeである、TACCGAGGGGATCGCCCCGACAGCTAGTAT又はその相補配列、前記非標的生物がMycoplasma pneumoniaeである、CTTTACAGATTTGCTCACTTTTACAAGCTGGCGAC又はその相補配列、前記標的生物がLegionella属に属する、TACCCTCTCCCATACTCGAGTCAACCAGTATTATCTGACC又はその相補配列、前記標的生物がLegionella属に属する、GGATTTCACGTGTCCCGGCCTACTTGTTCGGGTGCGTAGTTC又はその相補配列、前記標的生物がLegionella属に属する、CATCTCTGCAAAATTCACTGTATGTCAAGGGTAGGTAAGG又はその相補配列、前記標的生物がLegionella属に属する、GCGGTACGGTTCTCTATAAGTTATGGCTAGC又はその相補配列、前記標的生物がLegionella属に属する、GTACCGAGGGTACCTTTGTGCT又はその相補配列、前記標的生物がLegionella属である、CACTCTTGGTACGATGTCCGAC又はその相補配列、前記標的生物がChlamydia trachomatisである、CCGACTCGGGGTTGAGCCCATCTTTGACAA又はその相補配列、前記標的生物がChlamydia trachomatisである、TTACGTCCGACACGGATGGGGTTGAGACCATC又はその相補配列、前記標的生物がChlamydia trachomatisである、CCGCCACTAAACAATCGTCGAAACAATTGCTCCGTTCGA又はその相補配列、前記標的生物がChlamydia trachomatisである、CGTTACTCGGATGCCCAAATATCGCCACATTCG又はその相補配列、前記標的生物がChlamydia trachomatisである、CATCCATCTTTCCAGATGTGTTCAACTAGGAGTCCTGATCC又はその相補配列、前記標的生物がChlamydia trachomatisである、GAGGTCGGTCTTTCTCTCCTTTCGTCTACG又はその相補配列、前記標的生物がChlamydia trachomatisである、CCGTTCTCATCGCTCTACGGACTCTTCCAATCG 又はその相補配列、前記標的生物がChlamydia trachomatisである、CGAAGATTCCCCTTGATCGCGACCTGATCT又はその相補配列、前記標的生物がChlamydia trachomatisである、CCGGGGCTCCTATCGTTCCATAGTCACCCTAAAAG又はその相補配列、前記標的生物がChlamydia trachomatisである、TACCGCGTGTCTTATCGACACACCCGCG又はその相補配列、前記標的生物がCampylobacter属に属する、CGCTCCGAAAAGTGTCATCCTCC又はその相補配列、前記標的生物がCampylobacter属に属する、CCTTAGGTACCGTCAGAATTCTTCC又はその相補配列、前記標的生物がCampylobacter属に属する、GCCTTCGCAATGGGTATTCTTGGTG又はその相補配列、前記標的生物がCampylobacter属に属する、GGTTCTTAGGATATCAAGCCCAGG又はその相補配列、前記標的生物がEnterococciとして知られているStreptococciの亜属群に属する、TGCAGCACTGAAGGGCGGAAACCCTCCAACACTTA又はその相補配列、前記標的生物が群I Pseudomonasとして知られている亜属群に属する、CAGACAAAGTTTCTCGTGCTCCGTCCTACTCGATT又はその相補配列、前記標的生物がEnterobacter cloacaeである、GTGTGTTTTCGTGTACGGGACTTTCACCC又はその相補配列、前記標的生物がProteus mirabilisである、CCGTTCTCCTGACACTGCTATTGATTAAGACTC又はその相補配列、前記標的生物がSalmonella属に属する、CTCCTTTGAGTTCCCGACCTAATCGCTGGC又はその相補配列、前記標的生物がSalmonella属に属する、CTCATCGAGCTCACAGCACATGCGCTTTTGTGTA又はその相補配列、前記標的生物がEscherichia coliである、GCACATTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGG又はその相補配列、前記標的生物が細菌である、CCACTGCTGCCTCCCGTAGGAGTCTGGGCC又はその相補配列、前記標的生物が細菌である、CCAGATCTCTACGCATTTCACCGCTACACGTGG又はその相補配列、前記標的生物が細菌である、GCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACAT又はその相補配列、前記標的生物が細菌である、GGGGTTCTTTTCGCCTTTCCCTCACGG又はその相補配列、前記標的生物が細菌である、GGCTGCTTCTAAGCCAACATCCTG又はその相補配列、前記標的生物が細菌である、GGACCGTTATAGTTACGGCCGCC又はその相補配列、前記標的生物が細菌である、GGTCGGAACTTACCCGACAAGGAATTTCGCTACC又はその相補配列、前記標的生物が菌類である、CCCGACCGTCCCTATTAATCATTACGATGG又はその相補配列、前記標的生物が菌類である、CCCGACCGTCCCTATTAATCATTACGATGGTCCTAGAAAC又はその相補配列、前記標的生物が菌類である、CGACTTGGCATGAAAACTATTCCTTCCTGTGG又はその相補配列、前記標的生物が菌類である、GCTCTTCATTCAATTGTCCACGTTCAATTAAGCAACAAGG又はその相補配列、前記標的生物が菌類である、GCTCTGCATTCAAACGTCCGCGTTCAATAAAGAAACAGGG又はその相補配列、前記標的生物がNeisseria gonorrhoeaeである、CCGCCGCTACCCGGTAC又はその相補配列、前記標的生物がNeisseria gonorrhoeaeである、TCATCGGCCGCCGATATTGGC又はその相補配列、前記標的生物がNeisseria gonorrhoeaeである、GAGCATTCCGCACATGTCAAAACCAGGTA又はその相補配列、前記標的生物がNeisseria gonorrhoeaeである、GAGGATTCCGCACATGTCAAAACCAGG又はその相補配列、前記標的生物がNeisseria gonorrhoeaeである、GAGGATTCCGCACATGTCAAAACCAGGTAA又はその相補配列、前記標的生物がNeisseria gonorrhoeaeである、CCCGCTACCCGGTACGTTC又はその相補配列、および前記標的生物がNeisseria gonorrhoeaeである、CCGCTACCCGGTACGTTC又はその相補配列、からなる群から選ばれ、前記プローブは、ハイブリダイゼーション条件下で、前記標的生物または生物群からの核酸中に存在するヌクレオチド配列と、またはそれに相補的なヌクレオチド配列と、検出可能なハイブリッドを形成することができ、および前記プローブは、上記ハイブリダイゼーション条件下で、非標的生物または生物群からの核酸中に存在するヌクレオチド配列と、またはそれに相補的ヌクレオチド配列と、検出可能なハイブリッドを形成することができない、前記プローブ。
IPC (2):
C12N 15/09 ZNA ,  C12Q 1/68
FI (2):
C12N 15/00 ZNA A ,  C12Q 1/68 A

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