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J-GLOBAL ID：200903098685140301

微生物識別方法、微生物識別装置、微生物識別用データベースの作成方法および微生物識別プログラムを記録した記録媒体

Inventor：
井上 高一

About 井上 高一


Applicant, Patent owner：
三洋電機株式会社

About 三洋電機株式会社

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社団法人農林水産先端技術産業振興センター

About 社団法人農林水産先端技術産業振興センター


Agent (1)： 福島 祥人
Gazette classification：公開公報
Application number (International application number)：2000099482
Publication number (International publication number)：2001275700
Application date： Mar. 31, 2000
Publication date： Oct. 09, 2001
Summary：
【要約】【課題】 微生物群を構成する複数の微生物を同時にかつ容易に識別することが可能な微生物識別方法、微生物識別装置および微生物識別用データベースの作成方法および微生物識別プログラムを記録した記録媒体を提供することである。【解決手段】 微生物識別方法は、SSC-PCR法により微生物の解析実験を行うステップS1と、解析実験により得られた電気泳動像を取り込むステップS2と、画像データからバンドを検出するステップS3と、画像補正を行うステップS4と、バンドの位置および強度を測定するステップS5と、測定結果をまとめてバンドデータの一欄を作成するステップS6と、これを用いてデータベース検索を行うステップS7と、結果を表示するステップS8とから構成される。
Claim (excerpt)：
識別対象となる微生物を識別する微生物識別方法であって、増幅確率の異なる複数のプライマーを準備し、前記複数のプライマーの各々を用いて、識別対象となる微生物のDNAに対し、熱変成工程、プライマーのアニーリング工程およびポリメラーゼによる伸長反応工程をこの順序で繰り返し行うポリメラーゼ連鎖反応法を一度に適用することにより、前記識別対象となる微生物のDNAのDNA断片を増幅するステップと、前記複数のプライマーの各々を用いて増幅されたDNA断片に対して電気泳動法を適用し、各プライマーに対応する電気泳動像を得るステップと、各プライマーに対応する前記電気泳動像を画像データに変換するステップと、前記画像データに基づいて各プライマーに対応する前記電気泳動像のバンドを検出するステップと、前記画像データに基づいて各プライマーに対応する前記電気泳動像における前記検出されたバンドの位置および強度に関する情報を求めるステップと、前記複数のプライマーと前記バンドの位置および強度に関する情報との対応関係を求めるステップと、照合対象となる微生物についての前記対応関係が予め記憶されたデータベースを検索し、前記識別対象となる微生物について求められた前記対応関係と前記照合対象となる微生物についての前記対応関係との相関関係を求めるステップと、前記相関関係に基づいて前記識別対象となる微生物を識別するステップとを備えたことを特徴とする微生物識別方法。
IPC (5)：
C12Q 1/68 ,  C12M 1/00 ,  C12M 1/34 ,  C12N 15/09 ZNA ,  G06F 17/30 170
FI (5)：
C12Q 1/68 A ,  C12M 1/00 A ,  C12M 1/34 B ,  G06F 17/30 170 F ,  C12N 15/00 ZNA A
F-Term (21)：
4B024AA11 ,  4B024AA17 ,  4B024CA01 ,  4B024CA09 ,  4B024HA12 ,  4B029AA07 ,  4B029AA23 ,  4B029FA03 ,  4B063QA01 ,  4B063QA18 ,  4B063QQ05 ,  4B063QQ42 ,  4B063QR32 ,  4B063QR62 ,  4B063QS16 ,  4B063QS25 ,  4B063QS36 ,  4B063QX02 ,  5B075PQ02 ,  5B075PQ46 ,  5B075UU19
Patent cited by the Patent：
Cited by examiner (5)
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