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J-GLOBAL ID:201001094430855895
Update date: Oct. 09, 2024
CHIBA SHINOBU
チバ シノブ | CHIBA SHINOBU
Affiliation and department:
Job title:
Professor
Research field (3):
Cell biology
, Molecular biology
, Structural biochemistry
Research keywords (5):
Cell biology
, Cell biology
, structual biology
, 分子生物学
, molecular biology
Research theme for competitive and other funds (17):
- 2020 - 2025 Functions and mechanisms of reguratory nascent chains
- 2020 - 2025 拡大し変容するタンパク質の世界(総括班)
- 2021 - 2024 非チャネル型タンパク質膜組込装置YidCの分子機構
- 2016 - 2020 Molecular mechanism of channel-independent protein translocation machinery
- 2014 - 2019 Functions and mechanisms of functional nascent chains
- 2014 - 2019 Nascent-Chain Biology
- 2013 - 2016 Studies of nascent chains that monitors protein localization machineries
- 2012 - 2014 Structural basis of membrane protein insertion
- 2012 - 2014 Identification of nascent polypeptides with novel functions
- 2008 - 2012 Nascent chain biology
- 2010 - 2011 翻訳途上鎖のタンパク質社会における意義と役割
- 2010 - 2011 Nascent polypeptide chain that monitors membrane protein biogenesis in Bacullus subtilis.
- 2009 - 2010 膜内切断(RIP)プロテアーゼの細胞機能
- 2008 - 2009 Sec膜透過・組込みシステムの制御
- 2002 - 2004 FtsHプロテアーゼによる膜蛋白質基質の認識、分解の開始および方向性決定の機構
- 1999 - タンパク質合成、成熟、局在化、品質管理に関する研究
- Study on the proteolysis of Membrane protein.
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Papers (40):
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Hiraku Takada, Keigo Fujiwara, Gemma C Atkinson, Shinobu Chiba, Vasili Hauryliuk. Resolution of ribosomal stalling by EF-P and ABCF ATPases YfmR and YkpA/YbiT. Nucleic Acids Research. 2024
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Hiraku Takada, Helge Paternoga, Keigo Fujiwara, Jose A Nakamoto, Esther N Park, Lyudmila Dimitrova-Paternoga, Bertrand Beckert, Merilin Saarma, Tanel Tenson, Allen R Buskirk, et al. A role for the S4-domain containing protein YlmH in ribosome-associated quality control in Bacillus subtilis. Nucleic acids research. 2024
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Gersteuer Felix, Morici Martino, Gabrielli Sara, Fujiwara Keigo, Safdari Haaris A, Paternoga Helge, Bock Lars V, Chiba Shinobu, Wilson Daniel N. The SecM arrest peptide traps a pre-peptide bond formation state of the ribosome. Nature communications. 2024. 15. 1. 2431
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Morici Martino, Gabrielli Sara, Fujiwara Keigo, Paternoga Helge, Beckert Bertrand, Bock Lars V, Chiba Shinobu, Wilson Daniel N. RAPP-containing arrest peptides induce translational stalling by short circuiting the ribosomal peptidyltransferase activity. Nature communications. 2024. 15. 1. 2432
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Nozomi Ugajin, Koshi Imami, Hiraku Takada, Yasushi Ishihama, Shinobu Chiba, Yuichiro Mishima. Znf598-mediated Rps10/eS10 ubiquitination contributes to the ribosome ubiquitination dynamics during zebrafish development. RNA. 2023. 29. 12. 1910-1927
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MISC (9):
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Koreaki Ito, Naomi Shimokawa-Chiba, Shinobu Chiba. Sec translocon has an insertase-like function in addition to polypeptide conduction through the channel. F1000Research. 2019. 8
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石井英治, 千葉志信, 橋本成祐, 小嶋誠司, 本間道夫, 伊藤維昭, 秋山芳展, 森博幸. ビブリオ属細菌の低食塩環境への適応:アレストペプチドVemPによるSecDF発現制御の役割. 日本生化学会大会(Web). 2015. 88th. 2P0786 (WEB ONLY)-[2P0786]
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塚崎智也, 塚崎智也, 熊崎薫, 千葉志信, 武本瑞貴, 古川新, 伊藤維昭, 石谷隆一郎, 濡木理. タンパク質膜組込みinsertase YidCの立体構造と分子機構. 日本化学会講演予稿集. 2015. 95th. 1
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千葉志信, 熊崎薫, 塚崎智也, 濡木理, 伊藤維昭. 働く新生鎖MifMを利用した蛋白質膜組込装置YidCの機能解析. 日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集. 2014. 14th
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熊崎薫, 千葉志信, 武本瑞貴, 古川新, 菅野泰功, 森貴治, 田中良樹, 杉田有治, 伊藤維昭, 石谷隆一郎, et al. 膜タンパク質YidCによるタンパク質膜組み込み機構の構造基盤. 日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集. 2014. 14th
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Books (2):
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セントラルドグマの新常識 : 転写・翻訳の驚きの新機構と再定義されるDNA・RNA・タンパク質の世界
羊土社 2022 ISBN:9784758104043
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Regulatory Nascent Polypeptides" Springer.
Springer 2014
Lectures and oral presentations (7):
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YidCによるタンパク質膜組込機構の解明
(第37回日本分子生物学会年会 2014)
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YidCによるチャネルに依存しない蛋白質膜組込機構
(第87回日本生化学会大会 2014)
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蛋白質局在化装置の活性をモニターする新生鎖
(新学術領域「新生鎖の生物学」公開キックオフミーティング 2014)
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チャネルに依存しない蛋白質膜組込機構:アレスト因子MifMを利用したYidCの機能解析
(2014年度グラム陽性菌ゲノム機能会議 2014)
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働く新生鎖MifMを利用した蛋白質膜組込装置YidCの機能解析-Functional analysis of membrane protein insertase YidC using a regulatory nascent chain MifM.
(第14回日本蛋白質科学会年会 2014)
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Education (3):
- - 2002 京都大学大学院 理学研究科 化学専攻
- - 1999 Hokkaido University Graduate School, Division of Pharmaceutical Sciences
- - 1997 Hokkaido University Faculty of Pharmaceutical Sciences
Professional career (1):
- Master of Pharmaceutical Science
Work history (3):
- 2019/04 - 現在 Kyoto Sangyo University Faculty of Life Sciences Department of Frontier Life Sciences Professor
- 2014/04 - 2019/03 Kyoto Sangyo University Faculty of Life Sciences Department of Molecular Biosciences Associate Professor
- Kyoto Sangyo University Faculty of Life Sciences, Department of Molecular Biosciences
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