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J-GLOBAL ID：201003029325688445

ヒト固形腫瘍における遺伝子欠失及び突然変異ALKキナーゼ

Inventor： クラリーシャ リコヴァ ,  ハーバート ハーク ,  ローラ サリヴァン ,  ティンレイ グ ,  アンソニー ポッセマート ,  アイラン グオ ,  ジョーン マクニール ,  ジャン ユ
Applicant, Patent owner： セル・シグナリング・テクノロジー・インコーポレイテツド
Agent (1)： 佐伯 憲生
Gazette classification：公表公報
Application number (International application number)：2009525538
Publication number (International publication number)：2010501175
Application date： Apr. 13, 2007
Publication date： Jan. 21, 2010
Summary：

本発明によると、未分化リンパ腫キナーゼ(ALK)のキナーゼ部分を第2タンパク質の部分と結合する融合タンパク質をもたらす、染色体2を含む新規な遺伝子欠失及び転座が、ヒト固形腫瘍、例えば非小細胞肺癌(NSCLC)中で同定された。第2タンパク質は微小管関連タンパク質様4(Echinoderm Microtubule-Associated Protein-Like 4;EML-4)及びTRK-融合遺伝子(TFG)を含有している。ALKチロシンキナーゼ活性を保持しているEML4-ALK融合タンパク質は、この突然変異によって特徴付けられるNSCLCの増殖及び生存を促進することが確認された。従って、本発明は、ある側面で、開示される突然変異ALKキナーゼポリペプチドをコードする単離されたポリヌクレオチド及びベクター、それを検出するプローブ、単離された突然変異ポリペプチド、組み換えポリペプチド、及び融合及び切断されたポリペプチドを検出する試薬を提供する。開示される、この新規な融合タンパク質の同定は、生体試料におけるこれら突然変異ALKキナーゼポリペプチドの存在を判定する新規な方法、このタンパク質を阻害する化合物をスクリーニングする方法、及び突然変異ポリヌクレオチド又はポリペプチドによって特徴付けられる癌の進行を阻害する方法を可能にして、これらもまた本発明により提供される。【選択図】図1A

Claim (excerpt)：

(a)配列番号1又は配列番号18のアミノ酸配列を含有している微小管結合タンパク質様4/未分化リンパ腫キナーゼ(Echinoderm Microtubule-Associated Protein-Like 4/Anaplastic Lymphoma Kinase; EML4-ALK)融合ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列; (b)EML4-ALK融合ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、そのヌクレオチド配列は配列番号2又は配列番号19のヌクレオチド配列を含有している; (c)EML-4のN-末端アミノ酸配列(配列番号3の残基1-233又は配列番号3の残基1-495)及びALKのキナーゼドメイン(配列番号5の残基1116-1383)を含有しているEML4-ALK融合ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列; (d)EML-4のN-末端ヌクレオチド配列(配列番号4の1-700ヌクレオチド又は配列番号4の1-1486ヌクレオチド)及びALKのキナーゼドメインヌクレオチド配列(配列番号6の3348-4149ヌクレオチド)を含有しているヌクレオチド配列; (e)EML4-ALK融合ポリヌクレオチドの融合接合部(配列番号2の700-701ヌクレオチド又は配列番号19の1486-1487ヌクレオチド)を包含するする少なくとも6つの隣接ヌクレオチドを含有しているヌクレオチド配列; (f)EML4-ALK融合ポリペプチドの融合接合部(配列番号1の残基233-234又は配列番号18の残基495-496)を包含する少なくとも6つの隣接アミノ酸を含有しているポリペプチドをコードするヌクレオチド配列;及び (g)(a)〜(f)のヌクレオチド配列の何れかと相同性があるヌクレオチド配列: よりなる群から選ばれる配列と少なくとも95%の相同性を有するヌクレオチド配列を含有している、単離されたポリヌクレオチド。

IPC (15)：

C12N 15/09 ,  C12N 1/15 ,  C12N 1/19 ,  C12N 1/21 ,  C12N 5/10 ,  C12N 9/12 ,  C12Q 1/68 ,  C12Q 1/48 ,  A61K 45/00 ,  A61P 35/00 ,  A61K 31/517 ,  G01N 33/53 ,  G01N 33/574 ,  G01N 33/50 ,  G01N 33/15

FI (15)：

C12N15/00 A ,  C12N1/15 ,  C12N1/19 ,  C12N1/21 ,  C12N5/00 A ,  C12N9/12 ,  C12Q1/68 A ,  C12Q1/48 Z ,  A61K45/00 ,  A61P35/00 ,  A61K31/517 ,  G01N33/53 M ,  G01N33/574 A ,  G01N33/50 Z ,  G01N33/15 Z

F-Term (79)：

2G045AA26 ,  2G045DA12 ,  2G045DA36 ,  2G045FB02 ,  2G045FB03 ,  4B024AA01 ,  4B024AA12 ,  4B024BA10 ,  4B024CA03 ,  4B024CA04 ,  4B024CA07 ,  4B024CA09 ,  4B024DA02 ,  4B024EA02 ,  4B024GA11 ,  4B024HA12 ,  4B050CC04 ,  4B050DD11 ,  4B050GG06 ,  4B050LL01 ,  4B050LL03 ,  4B063QA18 ,  4B063QA19 ,  4B063QQ02 ,  4B063QQ27 ,  4B063QQ42 ,  4B063QQ58 ,  4B063QR07 ,  4B063QR56 ,  4B063QR60 ,  4B063QR62 ,  4B063QR77 ,  4B063QR80 ,  4B063QS24 ,  4B063QS25 ,  4B063QS28 ,  4B063QS34 ,  4B063QS36 ,  4B065AA93Y ,  4B065AB01 ,  4B065AC14 ,  4B065BA02 ,  4B065CA46 ,  4C084AA17 ,  4C084MA13 ,  4C084MA17 ,  4C084MA23 ,  4C084MA24 ,  4C084MA35 ,  4C084MA37 ,  4C084MA41 ,  4C084MA43 ,  4C084MA52 ,  4C084MA56 ,  4C084MA60 ,  4C084MA63 ,  4C084MA66 ,  4C084NA14 ,  4C084ZB26 ,  4C086AA01 ,  4C086AA02 ,  4C086BC46 ,  4C086MA01 ,  4C086MA04 ,  4C086MA13 ,  4C086MA17 ,  4C086MA23 ,  4C086MA24 ,  4C086MA35 ,  4C086MA37 ,  4C086MA41 ,  4C086MA43 ,  4C086MA52 ,  4C086MA56 ,  4C086MA60 ,  4C086MA63 ,  4C086MA66 ,  4C086NA14 ,  4C086ZB26

Patent cited by the Patent：

Cited by examiner (1)

• EML4-ALK融合遺伝子
  Gazette classification：公開公報   Application number：特願2007-265917   Applicant：アステラス製薬株式会社, 株式会社CureGene

Article cited by the Patent：

Cited by examiner (2)

• Boyle M. B. 'Voltage-dependent sodium channel alpha subunit', Medline [online], 2006年10月31日, Medl
• Anticancer Res., 2005, vol.25, p.1193-6