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J-GLOBAL ID：201101032925418574   Update date: Oct. 02, 2024

Nakaya Akihiro

ナカヤ アキヒロ | Nakaya Akihiro
Affiliation and department：
The University of Tokyo Graduate School of Frontier Sciences

About The University of Tokyo Graduate School of Frontier Sciences


Homepage URL  (1)： https://kaken.nii.ac.jp/ja/search/?qm=60301149
Research field  (25)： Systems genomics ,  Genetics ,  Genomics ,  Molecular biology ,  Genomics ,  Cell biology ,  Morphology, anatomy ,  Medical biochemistry ,  Clinical pharmacy ,  Medical systems ,  Tumor biology ,  Otorhinolaryngology ,  Psychiatry ,  Cardiovascular surgery ,  Neuropathology ,  Developmental dentistry ,  Crop production science ,  Plant genetics and breeding ,  Biological, health, and medical informatics ,  Statistical science ,  Information security ,  Intelligent informatics ,  Perceptual information processing ,  Mathematical informatics ,  Software
Research theme for competitive and other funds  (44)：
  • 2024 - 2029 多層的生体情報の統合による疾患予防システムの構築
  • 2022 - 2028 Platform for Advanced Genome Science
  • 2024 - 2027 完全大血管転位症の責任遺伝子の同定
  • 2024 - 2027 AI補助による統合失調症の分子脳病理診断技術の開発
  • 2022 - 2025 脳発達期の栄養恒常性破綻による統合失調症病態形成メカニズムの解明
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Papers (75)：
  • Masataka Kikuchi, Akinori Miyashita, Norikazu Hara, Kensaku Kasuga, Yuko Saito, Shigeo Murayama, Akiyoshi Kakita, Hiroyasu Akatsu, Kouichi Ozaki, Shumpei Niida, et al. Polygenic effects on the risk of Alzheimer’s disease in the Japanese population. Alzheimer's Research & Therapy. 2024. 16. 1. 45
  • Hisako Ichihara, Manabu Yamada, Mitsuyo Kohara, Hideki Hirakawa, Andrea Ghelfi, Takuro Tamura, Akihiro Nakaya, Yasukazu Nakamura, Sachiko Shirasawa, Samatchaya Yamashita, et al. Plant GARDEN: a portal website for cross-searching between different types of genomic and genetic resources in a wide variety of plant species. BMC Plant Biology. 2023. 23. 1. 391
  • Jun-Ya Kaimori, Yamato Kikkawa, Daisuke Motooka, Tomoko Namba-Hamano, Ayako Takuwa, Atsuko Imai-Okazaki, Kaori Kobayashi, Arisa Tanigawa, Yuko Kotani, Yoshihiro Uno, et al. A heterozygous LAMA5 variant may contribute to slowly progressive, vinculin-enhanced familial FSGS and pulmonary defects. JCI Insight. 2022. 7. 23. e158378
  • Masataka Kikuchi, Kaori Kobayashi, Sakiko Itoh, Kensaku Kasuga, Akinori Miyashita, Takeshi Ikeuchi, Eiji Yumoto, Yuki Kosaka, Yasuto Fushimi, Toshihiro Takeda, et al. Identification of mild cognitive impairment subtypes predicting conversion to Alzheimer’s disease using multimodal data. Computational and Structural Biotechnology Journal. 2022. 20. 5296-5308
  • Andi Madihah Manggabarani, Takuyu Hashiguchi, Masatsugu Hashiguchi, Atsushi Hayashi, Masataka Kikuchi, Yusdar Mustamin, Masaru Bamba, Kunihiro Kodama, Takanari Tanabata, Sachiko Isobe, et al. Construction of prediction models for growth traits of soybean cultivars based on phenotyping in diverse genotype and environment combinations. DNA Research. 2022. 29. 4. dsac024
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MISC (7)：
  • 市原寿子, 山田学, 戸田陽介, 中谷明弘, 山下サマッチャヤー, 清水武彦, 白澤沙知子, 小原光代, 平川英樹, 中村保一, et al. Improvement of Plant GARDEN, a portal site for plant genome information (FY2023, Q4 ver): Development of tools to use evolutionary information. 育種学研究. 2024. 26
  • 貝森 淳哉, 森 龍彦, 難波 倫子, 朝比奈 悠太, 梶本 幸男, 坂口 悠介, 小林 香織, 岡崎 敦子, 中谷 明弘, 守山 敏樹, et al. MAF-B遺伝子異常は、pure FSGSとして発症し、サイクロスポリンが有効な可能性がある. 日本腎臓学会誌. 2020. 62. 4. 293-293
  • 佐伯 真弓, 後藤 穣, 大久保 公裕, 中谷 明弘, 北村 紀子, 西村 友枝, 神沼 修, 廣井 隆親. 舌下免疫療法における味覚受容体を介した奏功メカニズム. アレルギー. 2019. 68. 8. 973-973
  • 市原寿子, 原田大士朗, FAWCETT Jeffrey, 白澤沙知子, 小原光代, 菊地正隆, 長谷川舞衣, 平川英樹, 磯部祥子, 田畑哲之, et al. 種を超えた植物ゲノム情報統合のためのデータリンク基盤の構築. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2018. 41st. 1
  • 平川英樹, 原田大士朗, GHELFI Andrea, FAWCETT Jeffrey, 白澤沙知子, 市原寿子, 中谷明弘, 磯部祥子, 田畑哲之. 植物ゲノム情報統合ポータルサイトPlant GARDENの構築. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2018. 41st. 1
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Patents (12)：
  • 集積集合データの製造装置、製造方法、プログラム、および記録媒体
  • 遺伝子変異の評価装置、評価方法、プログラム、および記録媒体
  • 遺伝子変異の評価装置、評価方法、プログラム、および記録媒体
  • 家系図描画装置、家系図描画方法、および、プログラム
  • DNA配列変異の評価方法
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Books (35)：
  • 東大式 生命データサイエンス即戦力講座 ゲノム、エピゲノム、トランスクリプトームからシングルセルまで、大規模データ解析で論文を書くためのR&Pythonツールボックス
    羊土社 2021
  • Effect of EGGS Analysis for MAGIC Population of Everbearing Strawberry on Increasing Fruit Firmness
    2020
  • Apolipoprotein E4, a Genetic Risk Factor for Alzheimer’s Disease
    2019
  • Mechanisms of allergen immunotherapy elucidated through integrated comparative analysis
    2019
  • 【遺伝統計学と疾患ゲノムデータ解析 病態解明から個別化医療、ゲノム創薬まで】 (第4章)開発者によるゲノムデータ解析手法紹介 ゲノム・エピゲノム解析 HDR法 ハミング距離に基づく疾患感受性染色体領域の推定
    (株)メディカルドゥ 2018
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Lectures and oral presentations  (148)：
  • 量的形質の経時変化のモデル化と予測
    (東京大学医科学研究所ゲノム予防医学社会連携研究部門2023年度シンポジウム 2024)
  • 精神疾患の発症機序と新規遺伝子発現調節系「LDB2-EGR軸」の関連性
    (日本神経化学会大会抄録集(Web) 2022)
  • Improvement of a plant genome information portal site, Plant GARDEN (2021・Q4 ver)
    (育種学研究 2022)
  • 植物ゲノム情報ポータルサイト「Plant GARDEN」の改訂(2021年度・第2四半期版)
    (トーゴーの日2021 2021)
  • 大規模データ時代のDBの役割は?~Plant GARDENの開発現場から~
    (日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM) 2021)
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Professional career (3)：
  • 博士(理学) (東京大学 大学院理学系研究科)
  • 修士(理学) (東京大学 大学院理学系研究科情報科学専攻)
  • 学士(理学) (東京大学 理学部情報科学科)
Work history (22)：
  • 2020/04 - 現在 The University of Tokyo Graduate School of Frontier Sciences
  • 2020 - 現在 (一社)柏の葉オーミクスゲート 技術顧問(兼任)
  • 2019/04 - 現在 Juntendo University Graduate School of Medicine
  • 2018/07 - 現在 国立精神・神経医療研究センター 精神保健研究所 客員研究員(兼任)
  • 2013/05 - 2022/03 東京都医学総合研究所 花粉症プロジェクト 客員研究員(兼任)
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※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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