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J-GLOBAL ID：201101039854221418   Update date: Sep. 24, 2025

Oku Makito

オク マキト | Oku Makito
Affiliation and department：
University of Toyama Research Center for Pre-disease Science

About University of Toyama Research Center for Pre-disease Science


Job title： Specially Appointed Associate Professor
Homepage URL  (2)： https://okumakito.github.io/jp/ ,  https://okumakito.github.io/en/
Research field  (1)： Biological, health, and medical informatics
Research theme for competitive and other funds  (4)：
  • 2017 - 2021 漢方医薬学と複雑系数理科学の挑戦 ~未病の検出から始まる新たな医療戦略の構築へ~
  • 2015 - 2020 生命病態システムの数理モデリングとその個別化医療への応用のための数理的基盤の確立
  • 2012 - 2014 認識系と意志決定系を統合した脳型情報処理モデルの基礎研究
  • 2009 - 2012 中間的スケールにおける脳情報処理の一般ネットワーク数理モデルの構築及びその解析
Papers (60)：
  • Masataka Shikata, Makito Oku, Shion Fukuhara, Ryo Ito, Takayuki Haruki, Keiichi Ueda, Iwao Kimura, Tsuyoshi Teramoto, Daisuke Chujo, Minoru Iwata, et al. Characterization of individuals in whom body weight loss precedes diabetes onset: a retrospective, observational, longitudinal cohort study based on health checkup in Japan. Endocrine Journal. 2025
  • Ryo Ito, Makito Oku, Iwao Kimura, Takayuki Haruki, Masataka Shikata, Tsuyoshi Teramoto, Daisuke Chujo, Minoru Iwata, Shiho Fujisaka, Yoshiki Nagata, et al. Energy landscape analysis of health checkup data clarified multiple pathways to diabetes development in obese and non-obese subjects. Frontiers in endocrinology. 2025. 16. 1576431-1576431
  • Xun Shen, Hampei Sasahara, Jun-ichi Imura, Makito Oku, Kazuyuki Aihara. Re-Stabilizing Large-Scale Network Systems Using High-Dimension Low-Sample-Size Data Analysis. IEEE Transactions on Emerging Topics in Computational Intelligence. 2025. 9. 2. 1638-1649
  • Kazutaka Akagi, Ying-Jie Jin, Keiichi Koizumi, Makito Oku, Kaisei Ito, Xun Shen, Jun-ichi Imura, Kazuyuki Aihara, Shigeru Saito. Integration of Dynamical Network Biomarkers, Control Theory and Drosophila Model Identifies Vasa/DDX4 as the Potential Therapeutic Targets for Metabolic Syndrome. Cells. 2025. 14. 6. 415
  • Makito Oku. Clarinet Plots: Alternative to Violin Plots to Display Zero-inflated Distribution of scRNA-seq Data. IPSJ Transactions on Bioinformatics. 2024. 17. 48-54
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MISC (20)：
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Patents (7)：
  • 動的ネットワークバイオマーカーとしてのトリプトファニルtRNA合成酵素様タンパク質を有効成分として含む、炎症性腸疾患の治療、再燃予防、又は寛解維持のための医薬組成物
  • 介入装置、介入方法およびプログラム
  • 動的ネットワークバイオマーカーとしてのトリプトファニルtRNA合成酵素様タンパク質を有効成分として含む、炎症性腸疾患の治療、再燃予防、又は寛解維持のための医薬組成物
  • 妊娠高血圧または妊娠高血圧腎症の発症予測方法、発症予測プログラムおよび発症予測装置
  • 画像認識装置、画像認識方法、および、プログラム
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Lectures and oral presentations  (60)：
  • 場の変形に基づく2次元離散分布間の最適輸送
    (第27回 情報論的学習理論ワークショップ 2024)
  • 特定健診データに対するエネルギー地形解析
    (第27回 情報論的学習理論ワークショップ 2024)
  • DNB解析によって検出された未病遺伝子の炎症性腸疾患における病態生理学的役割
    (第45回 日本炎症・再生医学会 2024)
  • Decrease in natural frequency as an overlooked early warning signal
    (ISNSM'24 2024)
  • Theory of restabilisation of high-dimensional data-driven network systems in very early treatment
    (ISNSM'24 2024)
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Education (2)：
  • 2008 - 2011 The University of Tokyo Graduate School of Information Science and Technology Doctoral Course, Department of Mathematical Informatics
  • 2006 - 2008 The University of Tokyo Graduate School of Information Science and Technology Mater Course, Department of Mathematical Informatics
Professional career (1)：
  • Ph. D. in Information Science and Technology (The University of Tokyo)
Work history (6)：
  • 2023/10 - 現在 University of Toyama Research Center for Pre-disease Science Specially Appointed Associate Professor
  • 2017/10 - 2023/09 University of Toyama Institute of Natural Medicine Specially Appointed Associate Professor
  • 2012/11 - 2017/09 Institute of Industrial Science, The University of Tokyo Research Associate
  • 2012/04 - 2012/10 Institute of Industrial Science, The University of Tokyo Project Research Associate
  • 2011/10 - 2012/03 The University of Tokyo JSPS Research Fellow (PD)
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Awards (7)：
  • 2024/05 - 情報処理学会バイオ情報学研究会 SIGBIO優秀プレゼンテーション賞 クラリネットプロット:バイオリンプロットに代わるscRNA-seqデータのゼロ過剰分布の表示法
  • 2021/03 - 情報処理学会 山下記念研究賞 フローサイトメトリーデータ解析ための方向制限付きアースムーバー距離の効率的な計算法
  • 2020/04 - 情報処理学会バイオ情報学研究会 SIGBIO優秀プレゼンテーション賞 フローサイトメトリーデータ解析ための方向制限付きアースムーバー距離の効率的な計算法
  • 2019/01 - 情報処理学会バイオ情報学研究会 SIGBIO優秀プレゼンテーション賞 同期性揺らぎ遺伝子の二つの新規抽出法
  • 2013/09 - NOLTA Best Paper Award
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Association Membership(s) (2)：
INFORMATION PROCESSING SOCIETY OF JAPAN ,  IEICE
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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