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J-GLOBAL ID：201102251302892906   Reference number：11A0295145

A Web Server for Multi-objective Pairwise RNA Sequence Alignment with an Index for Selecting Accurate Alignments

精確整列選別のための指標を備えた複数オブジェクト対合RNA配列整列のためのウェブサーバー

Author (1)： TANEDA Akito (Graduate School of Sci. and Technol., Hirosaki Univ.)
Material： IPSJ Transactions on Bioinformatics (Web)  (情報処理学会論文誌トランザクション Bioinformatics(Web))
Volume： 4  Page： 2-8 (J-STAGE)  Publication year： 2011 
JST Material Number： U0111A  ISSN： 1882-6679  Document type： Article
Article type： 原著論文  Country of issue： Japan (JPN)  Language： ENGLISH (EN)

Thesaurus term： *RNA ,...
Semi thesaurus term： *Cofolga2mo ,...

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JST classification (1)： Molecular and genetic information processing  (JE15040B)

Reference (25)：

• 1) Griffiths-Jones, S., Saini, H.K., van Dongen, S. and Enright, A.J.: miRBase: Tools for microRNA genomics, Nucleic Acids Res., Vol.36, pp.D154-158 (2008).
• 2) Rogers, J. and Wall, R.: A mechanism for RNA splicing, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., Vol.77, pp.1877-1879 (1980).
• 3) Brown, J.W.: The Ribonuclease P Database, Nucleic Acids Res., Vol.27, p.314 (1999).
• 4) Sankoff, D.: Simultaneous solution of the RNA folding, alignment and protosequence problems, SIAM J. Appl. Math., Vol.45, pp.810-825 (1985).
• 5) Tabei, Y., Tsuda, K., Kin, T. and Asai, K.: SCARNA: Fast and accurate structural alignment of RNA sequences by matching fixed-length stem fragments, Bioinformatics, Vol.22, pp.1723-1729 (2006).

Terms in the title (9)： 精確 ,  整列 ,  選別 ,  指標 ,  オブジェクト ,  対合 ,  RNA ,  配列整列 ,  ウェブサーバー