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J-GLOBAL ID：201103002837558600
タンパク質の分析方法、装置およびプログラム
Inventor：
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Applicant, Patent owner：
Gazette classification：特許公報
Application number (International application number)：2007512784
Patent number：4512751
Application date： Mar. 29, 2006
Claim (excerpt)：
【請求項1】タンパク質のモノアイソトピック質量を求める方法であって、
(a)目的タンパク質について第1の質量分析を行う工程、
(b)前記(a)工程で得られたタンパク質イオンの複数の同位体ピークから、1つの同位体ピークに対応するタンパク質プレカーサーイオンを選択する工程、
(c)前記(b)工程で選択されたタンパク質プレカーサーイオンを断片化したタンパク質プロダクトイオンについて第2の質量分析を行い、マススペクトルパターン1を得る工程、
(d)特定の分子量のアベラジンについて仮想的な第1の質量分析を行う工程、
(e)前記(d)工程で得られたアベラジンイオンの複数の同位体ピークに対応するアベラジンプレカーサーイオンをそれぞれ選択する工程、
(f)前記(e)工程で選択された複数のアベラジンプレカーサーイオンを仮想的に断片化したアベラジンプロダクトイオンについて仮想的な第2の質量分析を行い、複数のマススペクトルパターン2を得る工程、
(g)前記マススペクトルパターン1と前記複数のマススペクトルパターン2それぞれとの類似度を求める工程、
(h)前記(g)工程で得られた類似度のうち、最も高い類似度を有するマススペクトルパターン2に対応するアベラジンプレカーサーイオンを選択する工程、
(i)前記(h)工程で選択されたアベラジンプレカーサーイオンの質量から、前記アベラジンのモノアイソトピック質量を差し引いた質量差を求める工程、
(j)前記(b)工程で選択されたタンパク質プレカーサーイオンの質量から、前記(i)工程で得られた質量差を差し引いた質量を、前記タンパク質のモノアイソトピック質量として出力する工程、
を含む、方法。
IPC (1)：
FI (4)：
G01N 27/62 D
, G01N 27/62 V
, G01N 27/62 G
, G01N 27/62 K
Cited by applicant (1)
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質量スペクトルピークの同定
Gazette classification：公表公報
Application number：特願2001-566161
Applicant：アメルシャム・バイオサイエンシーズ・アクチボラグ
Article cited by the Patent：
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