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J-GLOBAL ID：201201004912271535   Update date: Apr. 17, 2024

Shimizu Atsushi

シミズ アツシ | Shimizu Atsushi
Affiliation and department：
Iwate Medical University Division of Biomedical Information Analysis, Institute for Biomedical Sciences

About Iwate Medical University Division of Biomedical Information Analysis, Institute for Biomedical Sciences


Job title： Professor
Other affiliations (5)：
  • Iwate Medical University  Iwate Tohoku Medical Megabank Organization 
  • Iwate Medical University  Center for Genome and Omics Analysis, Institute for Biomedical Sciences 
  • National Institute of Genetics  DNA Data Bank of Japan 
  • Keio University  School of Medicine, Department of Preventive Medicine and Public Health   Professor
  • Tohoku University  Tohoku Medical Megabank Organization 
Homepage URL  (2)： http://iwate-megabank.org ,  http://researchmap.jp/atsushi_ngs/
Research field  (4)： Genomics ,  Systems genomics ,  Medical biochemistry ,  Fetal medicine/Pediatrics
Research keywords  (6)： バイオインフォマティクス ,  次世代シークエンサー ,  疫学 ,  遺伝医学 ,  ゲノム医学 ,  Molecular genetics
Research theme for competitive and other funds  (27)：
  • 2023 - 2028 Usefulness of metabolite biomarker as a common pathway for the prevention of non-communicable diseases and frailty
  • 2022 - 2028 Platform of Supporting Cohort Study and Biospecimen Analysis
  • 2023 - 2026 Development and Validation of a Combined Risk Prediction Model for Childhood Obesity Using Cord Blood Genomics and Epigenomics
  • 2022 - 2026 A comprehensive Mendelian Randomization on the causal pathway from psychological traits to all-cause mortality
  • 2022 - 2026 ヒトの網羅的解析とその統合解析による新型たばこの疾患リスクの早期評価とその展開
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Papers (164)：
  • Asahi Hishida, Masahiro Nakatochi, Yoichi Sutoh, Shiori Nakano, Yukihide Momozawa, Akira Narita, Kozo Tanno, Atsushi Shimizu, Atsushi Hozawa, Kengo Kinoshita, et al. GWAS meta-analysis of kidney function traits in Japanese populations. Journal of epidemiology. 2024
  • Tomoharu Tokutomi, Akiko Yoshida, Akimune Fukushima, Kayono Yamamoto, Yasushi Ishigaki, HIROSHI KAWAME, Nobuo Fuse, Fuji Nagami, Yoichi Suzuki, Mika Sakurai-Yageta, et al. The Health History of First-Degree Relatives’ Dyslipidemia Can Affect Preferences and Intentions following the Return of Genomic Results for Monogenic Familial Hypercholesterolemia. Genes. 2024
  • Harutomo Numazaki, Takahito Nasu, Mamoru Satoh, Yuka Kotozaki, Kozo Tanno, Koichi Asahi, Hideki Ohmomo, Atsushi Shimizu, Shinichi Omama, Yoshihiro Morino, et al. Association between vascular endothelial dysfunction and stroke incidence in the general Japanese population: Results from the tohoku medical megabank community-based cohort study. International Journal of Cardiology Cardiovascular Risk and Prevention. 2023. 19. 200216-200216
  • Sei Harada, Hideki Ohmomo, Minako Matsumoto, Mizuki Sata, Miho Iida, Aya Hirata, Naoko Miyagawa, Kazuyo Kuwabara, Suzuka Kato, Ryota Toki, et al. Metabolomics profiles alterations in cigarette smokers and heated tobacco product users. Journal of epidemiology. 2023
  • Shu Tadaka, Junko Kawashima, Eiji Hishinuma, Sakae Saito, Yasunobu Okamura, Akihito Otsuki, Kaname Kojima, Shohei Komaki, Yuichi Aoki, Takanari Kanno, et al. jMorp: Japanese Multi-Omics Reference Panel update report 2023. Nucleic acids research. 2023
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MISC (198)：
  • Yunye He, Masaru Koido, Yoichi Sutoh, Mingyang Shi, Yayoi Otsuka-Yamasaki, Hans Markus Munter, Takayuki Morisaki, Akiko Nagai, Yoshinori Murakami, Chizu Tanikawa, et al. East Asian-specific and cross-ancestry genome-wide meta-analyses provide mechanistic insights into peptic ulcer disease. medRxiv. 2022
  • Complete Sequencing of the Human Genome --Why did it take 20 years from the declaration of completion of the Human Genome Project to the complete sequencing. Science Journal KAGAKU. 2022. 92. 8. 692-696
  • 清水 厚志. 出生コホート連携 ゲノムコホート研究におけるIPDメタ解析の取り組み. 日本衛生学雑誌. 2022. 77. Suppl. S117-S117
  • 八谷 剛史, 清水 厚志. 【最新臨床脳卒中学(第2版)上-最新の診断と治療-】危険因子 遺伝要因. 日本臨床. 2022. 80. 増刊1 最新臨床脳卒中学(上). 333-338
  • 小巻翔平, 清水厚志, 清水厚志. ゲノム医療におけるデータベース-使い方とコツ 1.一般集団・多因子疾患関連バリアントのデータベース 2)iMETHYL. 遺伝子医学. 2022. 12. 1. 20-23
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Patents (2)：
  • 腎細胞癌の診断マーカー及びそれを用いた診断方法
  • 脳梗塞発症リスクの予測モデル作成方法および予測方法
Books (7)：
  • がんゲノムデータ解析
    メディカルサイエンスインターナショナル 2022 ISBN:4815730520
  • 次世代シークエンサーDRY解析教本
    学研メディカル秀潤社 2019 ISBN:478090983X
  • 実験医学増刊 Vol.35 No.17 ヒト疾患のデータベースとバイオバンク〜情報をどう使い、どう活かすか?ゲノム医療をどう実現するか?
    羊土社 2017 ISBN:4758103666
  • 次世代シークエンサーDRY解析教本 (細胞工学別冊)
    学研メディカル秀潤社 2015 ISBN:4780909201
  • 実験医学別冊「次世代シークエンス解析スタンダード」ヒトゲノム・オミックス情報のコホート研究への応用.
    羊土社 2014
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Lectures and oral presentations  (125)：
  • 脳梗塞のゲノム疫学研究
    (第54回日本動脈硬化学会総会・学術集会 2022)
  • ポリジェニックリスクスコアのがん予防や治療への実装と課題
    (日本人類遺伝学会第66回大会 第28回日本遺伝子診療学会大会 合同開催 2021)
  • 大規模ゲノムコホート連携と遺伝情報を活用した疾患発症リスク予測モデルによる個別化予防の実現
    (第123回 慶應義塾大学医学部生涯教育研修セミナー 2021)
  • いわて東北メディカル・メガバンク機構(IMM)におけるコホート検体の複合オミックス解析
    (慶應義塾大学 システム医療研究開発センター セミナー 2016)
  • ヒトゲノム情報を活用した次世代型予防医療の実現に向けて
    (成育医療センター特別セミナー 2016)
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Education (2)：
  • 1994 - 1999 Aoyama Gakuin University Graduate School of Science and Engineering
  • 1900 - 1994 Aoyama Gakuin University College of Science and Engineering Department of Chemistry
Professional career (1)：
  • 博士(理学) (青山学院大学)
Work history (13)：
  • 2022/04 - 現在 National Institute of Genetics Bioinformation and DDBJ Center Professor
  • 2020/05 - 現在 Tohoku University Tohoku Medical Megabank Organization
  • 2020/01 - 現在 岩手医科大学 Division of Biomedical Information Analysis, Institute for Biomedical Sciences Professor
  • 2019/08 - 現在 Keio University School of Medicine, Department of Preventive Medicine and Public Health Professor
  • 2013/04 - 2024/03 Keio University School of Medicine, Department of Physiology
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Committee career (4)：
  • 2022/01 - 現在 日本疫学会疫学 リソース利用促進委員会リンケージ基盤推進ワーキンググループ委員
  • 2019/11 - 現在 日本人類遺伝学会 利益相反委員会委員
  • 2019/11 - 現在 日本人類遺伝学会 評議員
  • 2018/04 - 2020/03 日本バイオインフォマティクス学会 理事
Association Membership(s) (9)：
NGS現場の会 ,  日本オミックス医療学会 ,  日本エピジェネティクス研究会 ,  THE KEIO MEDICAL SOCIETY ,  THE MOLECULAR BIOLOGY SOCIETY OF JAPAN ,  American Society of Human Genetics ,  日本遺伝子診療学会 ,  THE JAPAN SOCIETY OF HUMAN GENETICS ,  THE JAPANESE SOCIETY FOR GENETIC COUNSELING
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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