Shiomi Daisuke

シオミダイスケ | Shiomi Daisuke

Affiliation and department：
Homepage URL (1)： https://sites.google.com/rikkyo.ac.jp/shiomi-lab

Research field (3)： Bacteriology , Cell biology , Molecular biology

Research keywords (25)： L-form , タンパク質間相互作用 , 細胞形態 , 形態 , Bacterial two-hybrid , 細胞極性 , 好熱菌 , 極性 , 細胞長 , 細胞幅 , 再構成系 , ペプチドグリカン , 大腸菌 , 形態形成 , 蛍光タンパク質 , 抑圧変異体 , 免疫染色 , 微生物 , 細胞膜 , 細胞骨格タンパク質 , 低温感受性 , 細胞分裂 , 次世代ゲノムシークエンス , 細胞骨格 , 細胞生物学

Research theme for competitive and other funds (7)：

2019 - 2025 合成細菌JCVI syn3.0B とゲノム操作を用いた細胞進化モデルの構築
2015 - 2017 Regulatory mechanisms of bacterial morphology by cytoskeletal proteins.
2015 - 2016 バクテリア形態形成を制御する複合体の動態と機能解析
2013 - 2014 バクテリア細胞骨格タンパク質複合体の構築と制御機構の解析
2012 - 2013 Analyses of molecular mechanisms of regulation of bacterial shape by cytoskeletal protein complex.

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Papers (65)：

Risa Ago, Yuhei O. Tahara, Honoka Yamaguchi, Motoya Saito, Wakana Ito, Kaito Yamasaki, Taishi Kasai, Sho Okamoto, Taiki Chikada, Taku Oshima, et al. Relationship between the Rod complex and peptidoglycan structure in Escherichia coli. MicrobiologyOpen. 2023. 12. 5
Satoko Umeda, Tomohisa Sujino, Kentaro Miyamoto, Yusuke Yoshimatsu, Yosuke Harada, Keita Nishiyama, Yoshimasa Aoto, Keika Adachi, Naoki Hayashi, Kimiko Amafuji, et al. D-amino Acids Ameliorate Experimental Colitis and Cholangitis by Inhibiting Growth of Proteobacteria: Potential Therapeutic Role in Inflammatory Bowel Disease. Cellular and molecular gastroenterology and hepatology. 2023
Daisuke SHIOMI, Taku OSHIMA. Outer Membrane is Critical for Viability of Cell Wall-deficient Bacterial Cells, L-form. Seibutsu Butsuri. 2023. 63. 1. 27-29
大島拓, 塩見大輔. 壁をなくしてみたところ. 生物工学会誌. 2022. 100. 3. 137-137
Taiki Chikada, Tomomi Kanai, Masafumi Hayashi, Taishi Kasai, Taku Oshima, Daisuke Shiomi. Direct Observation of Conversion From Walled Cells to Wall-Deficient L-Form and Vice Versa in Escherichia coli Indicates the Essentiality of the Outer Membrane for Proliferation of L-Form Cells. Frontiers in microbiology. 2021. 12. 645965-645965

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MISC (2)：

SHIOMI Daisuke, OKUMURA Hisashi, HOMMA Michio, KAWAGISHI Ikuro. Mutational analysis of the methyltransferase-binding sequence of the bacterial chemoreceptor, which is critical for chemotactic adaptation. The Japanese journal of taste and smell research. 1998. 5. 3. 527-528
Shiomi D., Okumura H., Homma M., Kawagishi I. Mutational analysis of the carboxy-terminal sequence of the chemoreceptor that serves as the binding site for methyltransferase CheR. Biophysics. 1998. 38. 2. S185

Lectures and oral presentations (108)：

人工細菌を用いたハロプラズマ細胞壁の再構築
(2023年度国立遺伝学研究所研究会「微生物の細胞複製システムから紐解く生命のデザイン」 2024)
バクテリアの未知の生存形態:L-form
(生物の基礎探究会 2024)
ハロプラズマのDCWクラスターを中心とした細胞壁合成遺伝子の解析
(第18回日本ゲノム微生物学会年会 2024)
大腸菌の桿菌-L-form 変換時におけるゲノム DNA の動態解析
(第19回21世紀大腸菌研究会 2023)
機能未知遺伝子yobHのL-form増殖への影響
(第19回21世紀大腸菌研究会 2023)

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Education (3)：

2000 - 2002 名古屋大学大学院理学研究科生命理学専攻博士課程後期
1998 - 2000 名古屋大学大学院理学研究科生命理学専攻博士課程前期
1994 - 1998 Nagoya University School of Science

Professional career (1)：

博士(理学) (名古屋大学大学院理学研究科)

Work history (6)：

2020/04 - 現在立教大学理学部生命理学科教授
2013/04 - 現在 Rikkyo University Department of Life Science, College of Science
2008/01 - 2013/03 National Institute of Genetics
2004/04 - 2007/12 University of Texas Houston
2002/10 - 2004/03 Nagoya University School of Science

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Committee career (4)：

2024/01 - 現在日本ゲノム微生物学会評議員
2018/01 - 2020/12 日本ゲノム微生物学会会計監査
2018/01 - 2020/12 日本細菌学会シンポジウム企画調整委員
2015/01 - 2017/12 日本細菌学会広報委員

Awards (11)：

2023/06 - 第19回21世紀大腸菌研究会口頭発表賞大腸菌の桿菌-L-form 変換時におけるゲノム DNA の動態解析
2022/06 - 第18回21世紀大腸菌研究会口頭部門発表賞
2021/08 - 第17回21世紀大腸菌研究会優秀発表賞(ポスター発表部門)
2021/03 - 第15回日本ゲノム微生物学会年会ポスター賞(優秀賞)
2021/03 - 第15回日本ゲノム微生物学会年会ポスター賞(優秀賞)

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Association Membership(s) (2)：

日本ゲノム微生物学会 , JAPANESE SOCIETY FOR BACTERIOLOGY

※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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