Shiomi Daisuke

シオミダイスケ | Shiomi Daisuke

Affiliation and department：
Homepage URL (1)： https://sites.google.com/rikkyo.ac.jp/shiomi-lab

Research field (3)： Bacteriology , Cell biology , Molecular biology

Research keywords (25)： L-form , タンパク質間相互作用 , 細胞形態 , 形態 , Bacterial two-hybrid , 細胞極性 , 好熱菌 , 極性 , 細胞長 , 細胞幅 , 再構成系 , ペプチドグリカン , 大腸菌 , 形態形成 , 蛍光タンパク質 , 抑圧変異体 , 免疫染色 , 微生物 , 細胞膜 , 細胞骨格タンパク質 , 低温感受性 , 細胞分裂 , 次世代ゲノムシークエンス , 細胞骨格 , 細胞生物学

Research theme for competitive and other funds (8)：

2024 - 2027 ペプチドグリカンを失った大腸菌L-formの増殖機構の解明
2019 - 2025 合成細菌JCVI syn3.0B とゲノム操作を用いた細胞進化モデルの構築
2015 - 2017 Regulatory mechanisms of bacterial morphology by cytoskeletal proteins.
2015 - 2016 バクテリア形態形成を制御する複合体の動態と機能解析
2013 - 2014 バクテリア細胞骨格タンパク質複合体の構築と制御機構の解析

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Papers (69)：

Masafumi Hayashi, Chigusa Takaoka, Koichi Higashi, Ken Kurokawa, William Margolin, Taku Oshima, Daisuke Shiomi. Septal wall synthesis is sufficient to change ameba-like cells into uniform oval-shaped cells in Escherichia coli L-forms. Communications biology. 2024. 7. 1. 1569
Taishi Kasai, Yohei O Tahara, Makoto Miyata, Daisuke Shiomi. FtsZ of wall-less bacteria forms ring-like structures. bioRxiv. 2024
塩見大輔, 林匡史, 大島拓. 細菌の新奇生存戦略:L-form 細胞壁が有っても無くても細菌は生きられる. 化学と生物. 2024. 62. 1
Risa Ago, Yuhei O. Tahara, Honoka Yamaguchi, Motoya Saito, Wakana Ito, Kaito Yamasaki, Taishi Kasai, Sho Okamoto, Taiki Chikada, Taku Oshima, et al. Relationship between the Rod complex and peptidoglycan structure in Escherichia coli. MicrobiologyOpen. 2023. 12. 5
Satoko Umeda, Tomohisa Sujino, Kentaro Miyamoto, Yusuke Yoshimatsu, Yosuke Harada, Keita Nishiyama, Yoshimasa Aoto, Keika Adachi, Naoki Hayashi, Kimiko Amafuji, et al. D-amino Acids Ameliorate Experimental Colitis and Cholangitis by Inhibiting Growth of Proteobacteria: Potential Therapeutic Role in Inflammatory Bowel Disease. Cellular and molecular gastroenterology and hepatology. 2023

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MISC (2)：

SHIOMI Daisuke, OKUMURA Hisashi, HOMMA Michio, KAWAGISHI Ikuro. Mutational analysis of the methyltransferase-binding sequence of the bacterial chemoreceptor, which is critical for chemotactic adaptation. The Japanese journal of taste and smell research. 1998. 5. 3. 527-528
Shiomi D., Okumura H., Homma M., Kawagishi I. Mutational analysis of the carboxy-terminal sequence of the chemoreceptor that serves as the binding site for methyltransferase CheR. Biophysics. 1998. 38. 2. S185

Lectures and oral presentations (114)：

Biochemical Analysis of Cell Division Protein FtsZ of Haloplasma contractile
(2024)
Analysis of subcellular localization of FtsZ in bacteria with the minimum genome
(2024)
Reconstitution of Haloplasma contractile cell wall in JCVI-syn3.0
(2024)
大腸菌の L-form への変換及び桿菌復帰時におけるゲノム DNA の動態
(第20回21世紀大腸菌研究会 2024)
Septal cell wall synthesis is sufficient to change amoeba-like morphology to oval cell shape in Escherichia coli L-form cells.
(EMBO workshop "Archaeal and bacterial cell division, Beyond the Z-ring" 2024)

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Education (3)：

2000 - 2002 名古屋大学大学院理学研究科生命理学専攻博士課程後期
1998 - 2000 名古屋大学大学院理学研究科生命理学専攻博士課程前期
1994 - 1998 Nagoya University School of Science

Professional career (1)：

博士(理学) (名古屋大学大学院理学研究科)

Work history (6)：

2020/04 - 現在立教大学理学部生命理学科教授
2013/04 - 現在 Rikkyo University Department of Life Science, College of Science
2008/01 - 2013/03 National Institute of Genetics
2004/04 - 2007/12 University of Texas Houston
2002/10 - 2004/03 Nagoya University School of Science

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Committee career (4)：

2024/01 - 現在日本ゲノム微生物学会評議員
2018/01 - 2020/12 日本ゲノム微生物学会会計監査
2018/01 - 2020/12 日本細菌学会シンポジウム企画調整委員
2015/01 - 2017/12 日本細菌学会広報委員

Awards (11)：

2023/06 - 第19回21世紀大腸菌研究会口頭発表賞大腸菌の桿菌-L-form 変換時におけるゲノム DNA の動態解析
2022/06 - 第18回21世紀大腸菌研究会口頭部門発表賞
2021/08 - 第17回21世紀大腸菌研究会優秀発表賞(ポスター発表部門)
2021/03 - 第15回日本ゲノム微生物学会年会ポスター賞(優秀賞)
2021/03 - 第15回日本ゲノム微生物学会年会ポスター賞(優秀賞)

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Association Membership(s) (2)：

日本ゲノム微生物学会 , JAPANESE SOCIETY FOR BACTERIOLOGY

※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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