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J-GLOBAL ID:201201086911673008
Update date: Oct. 08, 2024
Osakabe Akihisa
オサカベ アキヒサ | Osakabe Akihisa
Affiliation and department:
Research field (3):
Genetics
, Structural biochemistry
, Molecular biology
Research keywords (7):
クロマチンリモデリング
, トランスポゾン
, ヌクレオソーム
, ヒストンバリアント
, エピジェネティクス
, クロマチン
, 染色体
Research theme for competitive and other funds (13):
- 2024 - 2028 植物のクロマチン調節因子CDCA7の発現調節による適応進化プロセスの探索
- 2024 - 2027 クロマチンリモデリングを介したトランスポゾン自己同一性確立と喪失機構の解明
- 2024 - 2026 トランスポゾン由来非ドメイン型バイオポリマーによるトランスポゾン脱抑制機構の解明
- 2020 - 2025 異種ゲノム制御による光合成作動細胞の創製
- 2022 - 2024 両性花の可塑性を支える受精分子群の破壊と再構築
- 2022 - 2024 Genomic dynamics underlying the plastic hermaphroditism in plants: the basis of exploratory reproductive adaptations
- 2020 - 2024 エピゲノム確立の再構成による動作原理解明
- 2021 - 2023 クロマチンリモデリング因子DDM1複合体の同定およびトランスポゾン標的機構の解明
- 2018 - 2020 A mechanism of histone exchange involved in heterochromatin
- 2014 - 2016 Structural analysis of nucleosome containing methylated DNA
- 2013 - 2015 ヌクレオソームにおける紫外線DNA損傷の収納と認識の分子機構
- 2012 - 2014 高次クロマチン形成の構造生物学的解析
- 2009 - 2012 Analysis of chromatin formation mechanism by histone H3 variants and their interacting factors
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Papers (50):
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Akihisa Osakabe, Yoshimasa Takizawa, Naoki Horikoshi, Suguru Hatazawa, Lumi Negishi, Shoko Sato, Frédéric Berger, Tetsuji Kakutani, Hitoshi Kurumizaka. Molecular and structural basis of the chromatin remodeling activity by Arabidopsis DDM1. Nature communications. 2024. 15. 1. 5187-5187
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Daniela Quiroz, Satoyo Oya, Diego Lopez-Mateos, Kehan Zhao, Alice Pierce, Lissandro Ortega, Alissza Ali, Pablo Carbonell-Bejerano, Vladimir Yarov-Yarovoy, Sae Suzuki, et al. H3K4me1 recruits DNA repair proteins in plants. The Plant Cell. 2024
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Bhagyshree Jamge, Zdravko J Lorković, Elin Axelsson, Akihisa Osakabe, Vikas Shukla, Ramesh Yelagandula, Svetlana Akimcheva, Annika Luisa Kuehn, Frédéric Berger. Histone variants shape chromatin states in Arabidopsis. eLife. 2023. 12
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Sae Suzuki, Yuya Nakajima, Naoki Kamo, Akihisa Osakabe, Akimitsu Okamoto, Gosuke Hayashi, Hiroshi Murakami. Thiocholine-Mediated One-Pot Peptide Ligation and Desulfurization. Molecules. 2023. 28. 9. 3655-3655
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Hanna Markusch, Philipp Michl-Holzinger, Simon Obermeyer, Claudia Thorbecke, Astrid Bruckmann, Sabrina Babl, Gernot Längst, Akihisa Osakabe, Frédéric Berger, Klaus D. Grasser. Elongation factor 1 is a component of the Arabidopsis RNA polymerase II elongation complex and associates with a subset of transcribed genes. New Phytologist. 2023. 238. 1. 113-124
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MISC (15):
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Nagpal Harsh, 堀 哲也, Furukawa Ayako, 菅瀬 謙治, 越阪部 晃永, 胡桃坂 仁志, 深川 竜郎. 細胞周期中のCCANの構成の動的な変化(Dynamic Change of CCAN organization during the cell cycle). 日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集. 2015. 88回・38回. [2T23-13(2P0113)]
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Structural Versatility of the Fundamental Unit of Chromatin. 2015. 13. 2. 93-97
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藤田理紗, 大竹興一郎, 有村泰宏, 宮優太, 越阪部晃永, 立和名博昭, 大関淳一郎, 舛本寛, 胡桃坂仁志. セントロメアタンパク質CENP-BとCENP-Aヌクレオソームの相互作用解析. 日本生化学会大会(Web). 2015. 88th
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西淵剛平, 町田晋一, 越阪部晃永, 村越大夢, 浜田京子, 中川れい子, WOLFGANG Fischle, 胡桃坂仁志, 田上英明, 中山潤一. HP1のリン酸化はH3K9me3nucleosomeに対する結合特異性を制御している. 日本生化学会大会(Web). 2014. 87th. 3T15P-12(2P-359) (WEB ONLY)
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越阪部 晃永, 堀越 直樹, 立和名 博昭, 香川 亘, 安田 武嗣, 花岡 文雄, 菅澤 薫, 岩井 成憲, 胡桃坂 仁志. 紫外線損傷DNAを含むヌクレオソームの生化学的および構造生物学的解析. 日本生化学会大会プログラム・講演要旨集. 2013. 86回. 2T14a-07
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Books (8):
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カレントトピックス-クロマチンリモデリング因子DDM1によるパラサイトDNAの鎮静化機構-
羊土社 2021 ISBN:9784758125475
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オーバーラッピングダイヌクレオソームの立体構造と形成機構
羊土社 2017
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ゲノムDNAを収納するクロマチンの構造基盤
近代科学社 2017 ISBN:9784764950283
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クロマチン構造基盤の多様性-古くて新しい動的構造体の不思議-
2015
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ヒストンバリアントと発がん
2014
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Lectures and oral presentations (20):
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エピゲノム変異と熱刺激によるトランスポゾンの脱抑制機構
(第41回染色体ワークショップ・第22回核ダイナミクス研究会 2024)
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The contribution of histone variants to regulate transposon silencing and expression.
(The 46th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan 2023)
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ヒストンバリアントを介した可動性DNAの調節機構
(第26回クロマチン代謝制御セミナー 2023)
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DDM1機能喪失変異によるトランスポゾン脱抑制の温度依存性
(遺伝学会第95回大会 2023)
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Structural and biochemical analyses for the chromatin remodeling activity of DDM1
(CHSA meeting on Integrative Epigenetics in Plants 2022)
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Education (3):
- 2009 - 2012 Waseda University
- 2007 - 2009 早稲田大学 大学院先進理工学研究科 電気・情報生命専攻
- 2003 - 2007 Waseda University School of Science and Engineering
Professional career (1):
Work history (9):
- 2024/04 - 現在 東京大学大学院理学系研究科生物科学専攻 特任助教
- 2020/11 - 2024/03 東京大学大学院理学系研究科生物科学専攻 特任助教/さきがけ専任研究員
- 2016/04 - 2020/11 Gregor Mendel Institute Postdoctoral Fellow
- 2018/08 - 2020/07 Gregor Mendel Institute FWF Lise Meitner Postdoctoral Fellow
- 2016/04 - 2018/03 Gregor Mendel Institute
- 2015/04 - 2016/03 Waseda University
- 2013/04 - 2015/03 Waseda University
- 2012/04 - 2013/03 早稲田大学 先進理工学部 電気・情報生命工学科 助手
- 2009/04 - 2012/03 早稲田大学 日本学術振興会特別研究員(DC1)
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Awards (6):
Association Membership(s) (4):
日本遺伝学会
, 日本エピジェネティクス研究会
, 日本分子生物学会
, 日本生化学会
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