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J-GLOBAL ID:201201096332128290
Update date: Oct. 28, 2024
Monden Yuki
モンデン ユキ | Monden Yuki
Affiliation and department:
Job title:
Associate Professor
Research field (1):
Plant genetics and breeding
Research keywords (7):
品種識別
, DNAマーカー
, NGS
, 高次倍数体
, トランスポゾン
, 植物遺伝学
, 植物育種学
Research theme for competitive and other funds (28):
- 2024 - 2027 マルチオミクス解析による接木を介した開花誘導メカニズムの解明と新規育種法の開発
- 2023 - 2027 サツマイモネコブセンチュウに対するレース横断的抵抗性機構の解明と育種基盤の構築
- 2023 - 2026 Identification of candidate genes for quantitative traits and evaluation of genetic resource diversity of a novel model plant, Setaria, using NGS
- 2020 - 2025 品種識別技術の開発
- 2023 - 2024 高次倍数体作物種の農業形質に関するゲノム・遺伝学的解析
- 2019 - 2024 Genetic control of long term storage in melons
- 2020 - 2023 Development of genome editing technology to accelerate gene function analysis in the hexaploid sweet potato
- 2019 - 2022 Biological sustainability of double-cropping supported by seasonal change in root microbiome
- 2019 - 2022 Identification and utilization of QTLs for the regulation of rice juvenile-adult phase transition
- 2020 - 2021 サツマイモネコブセンチュウ抵抗性品種育成に向けた遺伝子機能解析
- 2019 - 2020 倍数性作物種における対立遺伝子の構造予測システムの開発
- 2019 - 2020 サツマイモネコブセンチュウ抵抗性に関する実用的な選抜DNAマーカーの開発
- 2019 - 2020 赤潮原因藻ヘテロシグマの系統地理学的マーカーの確立を目指した研究
- 2019 - 2020 品種判別マーカー開発のためのレトロトランスポゾン挿入多型情報の収集と情報解析
- 2016 - 2019 16S metagenomics analysis of microbiome communities in soils infected with root-knot nematode (Meloidogyne incognita) and Streptomyces ipomoea
- 2016 - 2019 Iso-Seq and RNA-seq based transcriptome analyses associated with root-knot nematode resistance in sweetpotato
- 2016 - 2019 Induced disease resistance by cyclic lipopeptide derived from Bacillus sp. on Arabidopsis thaliana
- 2016 - 2019 Investigation of genetic locus associated with skin color in Vitis vinifera x V. labruscana tetraploid grapes
- 2016 - 2018 Comprehensive analysis of full length cDNA and alternative splicing for the genes related to fruit development and ripening
- 2015 - 2017 平成27年度若手研究者スタートアップ研究支援事業
- 2013 - 2017 次世代シーケンスを用いた活動型レトロトランスポゾンの挿入多型解析によるサツマイモ高密度連鎖地図の作成と立枯病およびネコブセンチュウ抵抗性マーカーの開発
- 2014 - 2016 Screening of novel active retrotransposon families with a potential for accelerating the genetic analysis in polyploid species
- 2015 - 2016 耐乾性育種に向けた、コムギ異種染色体添加系統におけるトランスポゾンMITEの遺伝解析
- 2015 - 2016 STHクロマトPASを利用した、加工食品における農作物の品種判定検査
- 2012 - 2015 現場での検査導入を実現する農作物品種DNA 判定法の開発に関する研究
- 2013 - 2014 シイタケ(Lentinula edodes)活性型レトロトランスポゾンを利用したHigh-throughput な品種判別マーカーの開発
- 2012 - 2014 テニュアトラック普及・定着事業
- 2011 - 2012 イネトランスポゾンmPingおよびPingの転移制御機構の解明
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Papers (46):
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Kenta Shirasawa, Tomoya Esumi, Akihiro Itai, Katsunori Hatakeyama, Tadashi Takashina, Takuji Yakuwa, Katsuhiko Sumitomo, Takeshi Kurokura, Eigo Fukai, Keiichi Sato, et al. Propagation path of a flowering cherry (Cerasus × yedoensis) cultivar ‘Somei-Yoshino’ traced by somatic mutations. DNA Research. 2024. 31. 5
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Gentaro Shigita, Koichiro Shimomura, Tran Phuong Dung, Naznin Pervin Haque, Thuy Thanh Duong, Odirich Nnennaya Imoh, Yuki Monden, Hidetaka Nishida, Katsunori Tanaka, Mitsuhiro Sugiyama, et al. Genetic characterization of cucumber genetic resources in the NARO Genebank indicates their multiple dispersal trajectories to the East. Theoretical and Applied Genetics. 2024. 137. 7
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Katsunori Tanaka, Gentaro Shigita, Tran Phuong Dung, Phan Thi Phuong Nhi, Mami Takahashi, Yuki Monden, Hidetaka Nishida, Ryuji Ishikawa, Kenji Kato. Polyphyletic domestication and inter-lineage hybridization magnified genetic diversity of cultivated melon,Cucumis meloL. 2024
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Pervin Mst Naznin, Odirichi Nnennaya Imoh, Katsunori Tanaka, Ouch Sreynech, Gentaro Shigita, Yon Sophea, Sakhan Sophany, Ouk Makara, Norihiko Tomooka, Yuki Monden, et al. Analysis of genetic diversity and population structure in Cambodian melon landraces using molecular markers. Genetic Resources and Crop Evolution. 2023
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Yuki Monden, Maho Kakigi, Emdadul Haque, Tomoyuki Takeuchi, Kazuto Takasaki, Masaru Tanaka. Chromatographic printed array strip (C-PAS) method for cultivar-specific identification of sweetpotato cultivars ‘Beniharuka’ and ‘Fukumurasaki’. Breeding Science. 2023. 73. 3. 313-321
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MISC (75):
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栗原未結, 田淵宏朗, 西村和紗, 西田英隆, 加藤鎌司, 門田有希. Exploration and comparative analysis of nematode resistance loci in hexaploid sweetpotato with GWAS, QTL mapping, and k-mer based bulk segregation analysis. 育種学研究. 2024. 26
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堀田望未, 岡田吉弘, 神崎浩, 栗原未結, 西村和紗, 西田英隆, 加藤鎌司, 門田有希. Identification of genetic region related to the anthocyanin accumulation in sweetpotato storage roots and sequence analysis of the candidate gene. 育種学研究. 2024. 26
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堀田望未, 岡田吉弘, 栗原未結, 西田英隆, 加藤鎌司, 門田有希. Identification and comparative analysis of QTLs related to sweetpotato yield using multiple reference genome sequences. 育種学研究. 2023. 25
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泉谷真, 大畑慎一郎, 田淵宏朗, 西田英隆, 加藤鎌司, 門田有希. Revealing the competition between sweetpotato and southern root knot nematode by transcriptome analysis. 育種学研究. 2023. 25
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栗原未結, 田淵宏朗, 加藤鎌司, 西田英隆, 門田有希. High-dense genetic linkage map using multiple-dose markers and random-effect multiple QTL mapping of root-knot nematode resistance in hexaploid sweetpotato. 育種学研究. 2023. 25
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Books (1):
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植物の遺伝と育種 第3版
朝倉書店 2023 ISBN:9784254420470
Lectures and oral presentations (252):
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NanoporeロングリードのWGSにより明らかとなったサツマイモ澱粉に低温糊化性をもたらすSSII遺伝子の変異型アレル
(日本育種学会第145回講演会 2024)
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六倍体サツマイモにおけるGWAS・QTL mapping・k-merベースのバルク分離分析による線虫抵抗性遺伝子座の探索と比較解析
(日本育種学会第145回講演会 2024)
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Identification of genetic region related to the anthocyanin accumulation of sweetpotato flesh and sequence analysis of the candidate gene
(2024)
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サツマイモ品種「ジェイレッド」のゲノム編集に向けた形質転換法の確立と培養条件の検討
(日本育種学会第145回講演会 2024)
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サツマイモにおいて未だ発見されていないネコブセンチュウ抵抗性遺伝子の機能証明に向けた形質転換体の作出
(日本育種学会第145回講演会 2024)
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Education (3):
- 2009 - 2012 Kyoto University
- 2007 - 2009 Kyoto University
- 2003 - 2007 Kyoto University Faculty of Agriculture
Professional career (2):
- 博士(農学) (京都大学)
- 修士(農学) (京都大学)
Work history (7):
- 2021/04 - 現在 Okayama University The Graduate School of Environmental and Life Science Associate Professor
- 2018/03 - 2021/03 Okayama University The Graduate School of Environmental and Life Science Associate Professor
- 2015/04 - 2018/02 Okayama University The Graduate School of Environmental and Life Science
- 2012/04 - 2015/03 岡山大学環境生命科学研究科 特任助教(WTT)
- 2009 - 2012 日本学術振興会 日本学術振興会特別研究員(DC1)
- 2010 - 2011 University of California, Riverside Visiting student
- 2009 - 2010 University of Georgia Visiting student
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Committee career (20):
- 2024/03 - 現在 日本育種学会 代議員
- 2023/10 - 現在 日本学術会議 第26期若手アカデミー
- 2023/10 - 現在 植物インフォマティクス研究会 監事
- 2023/10 - 現在 日本学術会議 第26期 連携会員
- 2023/04 - 現在 Breeding Science Editorial boad
- 2022/11 - 現在 一般財団法人 西澤育英基金 理事
- 2020/11 - 現在 日本DNA多型学会 キャリアパス委員会委員長
- 2020/11 - 現在 日本DNA多型学会 理事
- 2020/04 - 現在 日本育種学会 集会幹事
- 2018/12 - 現在 日本DNA多型学会 キャリアパス委員会
- 2018/12 - 現在 日本DNA多型学会 代議員
- 2018/10 - 現在 Trilateral Research Association of Sweetpotato Steering committee members
- 2018/04 - 現在 日本DNA多型学会 編集委員会
- 2018/09 - 2023/10 植物インフォマティクス学会 運営委員
- 2022/10 - 2023/03 公益社団法人農林水産・食品産業技術振興協会(JATAFF) DNA 品種識別技術の妥当性確認のためのガイドライン検討会委員
- 2018/10 - 2023/03 岡山大学農学部 学生生活委員会
- 2021/06 - 2022/03 国立研究開発法人科学技術振興機構(JST) 未来社会創造事業 外部専門委員
- 2021/04 - 2022/03 岡山大学農学部 学生生活委員会委員長
- 2018/04 - 2022/03 日本育種学会 男女共同参画推進委員会
- 2020/07 - 2020/11 国立研究開発法人科学技術振興機構(JST) 未来社会創造事業(探索加速化方)外部専門委員
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Awards (13):
- 2024/07 - 三島海雲記念財団 学術賞
- 2023/05 - 公益財団法人 山陽放送学術文化・スポーツ振興財団 学術奨励賞 バルク分離分析を活用した六倍体サツマイモの農業形質を制御する遺伝子座の同定
- 2020 - 公益財団法人農学会 日本農学進歩賞 高次倍数性作物種における遺伝育種学的解析と品種識別技術の開発
- 2020 - 農林水産省 「若手農林水産研究者表彰」農林水産技術会議会長賞 高速シーケンサーを利用した遺伝育種学的解析と品種識別技術の開発
- 2019 - 公益財団法人両備檉園財団 生物学研究奨励賞 倍数性作物種における対立遺伝子の構造予測システムの開発
- 2018 - 日本育種学会奨励賞 高速シーケンサーによるレトロトランスポゾン遺伝解析技術の開発とその活用
- 2016 - 日本育種学会論文賞 Construction of a linkage map based on retrotransposon insertion polymorphisms in sweetpotato via high-throughput sequencing
- 2014 - 第125回日本育種学会講演会 優秀発表賞 On-site検査を実現するSTHクロマトPAS法を利用した品種識別技術の開発
- 2013 - 第124回講演会日本育種学会講演会 優秀発表賞 Benchtop型シーケンサーを利用した、非モデル作物種における効率的なGenotyping
- 2013 - 第123回日本育種学会講演会 優秀発表賞 次世代シーケンスを利用した活動型レトロトランスポゾンファミリーの新規同定方法の確立
- 2012 - 日本DNA多型学会 優秀研究賞 活性型レトロトランスポゾンを利用したアントシアニン含有紫サツマイモ品種識別用DNAマーカーの開発
- 2012 - 5th Korea China Japan Sweetpotato Workshop BEST PRESENTATION AWARD Cultivar identification DNA markers for purple sweet potato using active retrotranposon Rtsp-1 and LIb insertion polymorphisms
- 2010 - 第118回日本育種学会講演会 優秀発表賞 イネトランスポゾンmPingの転移制御機構解明に向けて
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Association Membership(s) (5):
日本DNA多型学会
, 日本育種学会
, Trilateral Research Association of Sweetpotato
, 植物インフォマティクス研究会
, 園芸学会
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