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J-GLOBAL ID：201203092545457604

系統発生分析のための方法およびシステム

Inventor：
ガーリー・エル・アンデルセン

About ガーリー・エル・アンデルセン

, 
トッド・ゼッド・デサンティス

About トッド・ゼッド・デサンティス

, 
エオイン・ブロディー

About エオイン・ブロディー


Applicant, Patent owner：
ザ リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ カリフォルニア

About ザ リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ カリフォルニア


Agent (4)： 村山 靖彦 ,  志賀 正武 ,  渡邊 隆 ,  実広 信哉
Gazette classification：公表公報
Application number (International application number)：2012517804
Publication number (International publication number)：2012531211
Application date： Jun. 25, 2010
Publication date： Dec. 10, 2012
Summary：
本発明は、生物特異的および/または操作的分類単位(OTU)特異的プローブを設計および使用するための方法およびシステムを開示する。本方法およびシステムは、プローブとの試料中の標的分子のハイブリダイゼーションまたは結合に基づいて、試料中の複数の生体分子または微生物を検出、同定、および定量化することを可能にする。いくつかの実施形態は、クラスタリングツリー上のノードに特異的なオリゴヌクレオチドプローブを選択する方法を提供する。他の実施形態は、高い信頼度を伴って、試料中の複数の生物を正確に検出することにおいて使用するための生物特異的またはOTU特異的オリゴヌクレオチドプローブを選択する方法を提供する。いくつかの実施形態は、試料中の希有なOTUの存在を検出するための方法およびシステムを提供する。
Claim (excerpt)：
1つのアッセイで、少なくとも10,000の異なる操作的分類単位(OTU)の存在、非存在、相対存在量、および/または量を判定することができる複数のプローブを備えるシステム。
IPC (7)：
C12M 1/00 ,  C12N 15/09 ,  C12Q 1/68 ,  C12Q 1/06 ,  G01N 33/53 ,  G01N 37/00 ,  G01N 33/569
FI (9)：
C12M1/00 A ,  C12N15/00 F ,  C12N15/00 A ,  C12Q1/68 A ,  C12Q1/06 ,  G01N33/53 M ,  G01N37/00 102 ,  G01N33/569 A ,  G01N33/569 B
F-Term (22)：
4B024AA11 ,  4B024CA04 ,  4B024CA09 ,  4B024CA20 ,  4B024HA14 ,  4B029AA07 ,  4B029BB20 ,  4B029CC08 ,  4B029FA01 ,  4B029FA15 ,  4B063QA01 ,  4B063QA18 ,  4B063QQ05 ,  4B063QQ06 ,  4B063QQ42 ,  4B063QQ52 ,  4B063QR32 ,  4B063QR56 ,  4B063QR62 ,  4B063QS25 ,  4B063QS34 ,  4B063QX02
Patent cited by the Patent：
Cited by examiner (4)
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