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J-GLOBAL ID：201301021943203731
Update date: Jun. 26, 2024
NAGASAKI Hideki
ナガサキ ヒデキ | NAGASAKI Hideki
Affiliation and department：
Homepage URL (1)：
http://kaken.nii.ac.jp/d/r/70624451.ja.html
Research field (1)：
Genomics
Research theme for competitive and other funds (2)：
- 2012 - 2015 Integration of plant strain SNPs using NGS Sequence Read Archive and diversity statistics analysis
- 2012 - 2015 クラウド型高速シーケンシングアノテーションシステムの開発研究
Papers (45)：
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Hideki Nagasaki, Kenta Shirasawa, Ken Hoshikawa, Sachiko Isobe, Hiroshi Ezura, Koh Aoki, Hideki Hirakawa. Genomic variation across distribution of Micro-Tom, a model cultivar of tomato (Solanum lycopersicum). DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes. 2024
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Kenta Shirasawa, Roger Moraga, Andrea Ghelfi, Hideki Hirakawa, Hideki Nagasaki, Kioumars Ghamkhar, Brent A Barrett, Andrew G Griffiths, Sachiko N Isobe. An improved reference genome for Trifolium subterraneum L. provides insight into molecular diversity and intra-specific phylogeny. Frontiers in plant science. 2023. 14. 1103857-1103857
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Ung-Han Yoon, Qinghe Cao, Kenta Shirasawa, Hong Zhai, Tae-Ho Lee, Masaru Tanaka, Hideki Hirakawa, Jang-Ho Hahn, Xiangfeng Wang, Ho Soo Kim, et al. Haploid-resolved and chromosome-scale genome assembly in hexa-autoploid sweetpotato (Ipomoea batatas(L.) Lam). 2022
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Atsushi Fukushima, Mikiko Takahashi, Hideki Nagasaki, Yusuke Aono, Makoto Kobayashi, Miyako Kusano, Kazuki Saito, Norio Kobayashi, Masanori Arita. Development of RIKEN Plant Metabolome MetaDatabase. Plant and Cell Physiology. 2021
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Amit Rai, Hideki Hirakawa, Ryo Nakabayashi, Shinji Kikuchi, Koki Hayashi, Megha Rai, Hiroshi Tsugawa, Taiki Nakaya, Tetsuya Mori, Hideki Nagasaki, et al. Chromosome-level genome assembly of Ophiorrhiza pumila reveals the evolution of camptothecin biosynthesis. Nature Communications. 2021. 12. 1
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MISC (43)：
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平川 英樹, 藤澤 貴智, 守屋 勇樹, 信定 知江, 長崎 英樹, 森 宙史, 福島 敦史, Ghelfi Andrea, 市原 寿子, 中村 保一, et al. 植物ゲノム統合データベースPlant GARDEN、微生物、メタボローム統合データベース間の連携検索システムの開発. トーゴーの日2022. 2022. 1
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赤木剛士, 赤木剛士, 白澤健太, 長崎英樹, 平川英樹, 田尾龍太郎, COMAI Luca, HENRY Isabelle M. カキ属の全ゲノム情報が明らかにする性の多様性を駆動した古倍化. 園芸学研究 別冊. 2018. 17. 1
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赤木剛士, 赤木剛士, 白澤健太, 長崎英樹, 平川英樹, COMAI Luca, 田尾龍太郎, HENRY Isabelle M. カキ属の全ゲノム配列解読(第1報):系統特異的なゲノム進化. 園芸学研究 別冊. 2017. 16. 2
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清水徳朗, 谷澤靖洋, 望月孝子, 長崎英樹, 長崎英樹, 吉岡照高, 豊田敦, 藤山秋佐夫, 神沼英里, 中村保一. ウンシュウミカンの全配列解読と遺伝子機能の予測. 農研機構果樹茶業研究部門成果情報(Web). 2017. 2017
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望月孝子, 谷澤靖洋, 藤澤貴智, 二河成男, 清水徳朗, 豊田敦, 豊田敦, 藤山秋佐夫, 藤山秋佐夫, 藤山秋佐夫, et al. DNApod:NGS公共データ由来のDNA多型と形質データとの統合に向けて. 育種学研究. 2016. 18. 234
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Books (7)：
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遺伝学の百科事典 : 継承と多様性の源 = Encyclopedia of genetics : origin of inheritance and diversity
丸善出版 2022 ISBN:9784621306604
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細胞工学別冊 次世代シーケンサー DRY解析教本
学研メディカル秀潤社 2015
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バイオインフォマティクス入門
慶應義塾大学出版会 2015
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実験医学別冊 次世代シークエンス解析スタンダード
羊土社 2014
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実験医学増刊 今日から使える! データベース・ウェブツール
羊土社 2014
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Lectures and oral presentations (6)：
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メタボローム統合データベースMetaboBank
(トーゴーの日シンポジウム2022 2022)
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Reanalysis of Metabolome Raw Data from Plants and Construction of MetaboBank, an Integrated Metabolome Database
(2022)
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メタボローム統合データベース MetaboBank 構築と測定生データの再解析
(第15回メタボロームシンポジウム 2021)
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メタボローム統合データベースMetaboBankの開発
(トーゴーの日シンポジウム2021 2021)
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RDF Conversion of Plant Metabolome Metadata and Raw Data Reanalysis Toward Built of MetaboBank, the Metabolome Integrated Database
(2021)
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Professional career (1)：
Work history (1)：
- 2012 - National Institute of Genetics
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