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J-GLOBAL ID：201301041797877840   Update date: Apr. 01, 2024

Sakaguchi Shota

Sakaguchi Shota
Affiliation and department：
Kyoto University Graduate School of Human and Environmental Studies

About Kyoto University Graduate School of Human and Environmental Studies


Homepage URL  (1)： https://sites.google.com/site/shota0060/
Research field  (3)： Biodiversity and systematics ,  Biological resource conservation ,  Forest science
Research keywords  (6)： Population genetics ,  Environmental adaptation ,  Plant evolution ,  Forest ecology ,  Forest genetics ,  Phylogeography
Research theme for competitive and other funds  (10)：
  • 2021 - 2024 生態ゲノミクスによる野生植物の平行進化機構の解明
  • 2019 - 2024 シカがもたらす葉サイズの進化と可塑性の変化ー葉サイズ制御の分子機構の解明
  • 2018 - 2021 Identification of genomic regions associated with prezygotic reproductive isolation in Asteraceae species
  • 2016 - 2020 Study on chromosome number reduction in genus Brachyscome along an arid gradient in Australia.
  • 2016 - 2019 Studies on ecotypic speciation mechanism in plants: Comparative genomic analysis in Solidago virgaurea group
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Papers (122)：
  • Seikan Kurata, Shota Sakaguchi, Shun K. Hirota, Osamu Kurashima, Yoshihisa Suyama, Motomi Ito. Phylogeographic incongruence between two related Geranium species with divergent habitat preferences in East Asia. Ecological Research. 2024
  • Kazutoshi Masuda, Hiroaki Setoguchi, Koki Nagasawa, Shun K. Hirota, Yoshihisa Suyama, Kazuhiro Sawa, Shigeru Fukumoto, Masae I. Ishihara, Harue Abe, Hayato Tsuboi, et al. Genetic consequences of Last Glacial-Holocene changes in snowfall regime in Arnica mallotopus populations: A plant confined to heavy-snow areas of Japan. American Journal of Botany. 2024
  • Seikan Kurata, Shota Sakaguchi, Osamu Kurashima, Risa Ogawa, Yoshihisa Suyama, Sachiko Nishida, Motomi Ito. Refugia within refugium of Geranium yesoense varieties: a follow-up study using chloroplast genome sequencing data of specimens from Mt. Asama, Japan. Biological Journal of the Linnean Society. 2024
  • Kohmei Kadowaki, Mie N. Honjo, Naoto Nakamura, Yoichiro Kitagawa, Masae I. Ishihara, Shunsuke Matsuoka, Yuuya Tachiki, Keitaro Fukushima, Shota Sakaguchi, Inoue Mizuki, et al. eDNA metabarcoding analysis reveals the consequence of creating ecosystem-scale refugia from deer grazing for the soil microbial communities. Environmental DNA. 2023
  • K. Nagasawa, K. Fukushima, H. Setoguchi, M. Katsuyama, S. Sakaguchi. Extreme low pH, not Al3+, is a key abiotic stressor for the extremophyte Carex angustisquama (Cyperaceae) in highly acidic solfatara fields. Plant Biology. 2023. 25. 4. 551-562
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MISC (145)：
  • 増田和俊, 瀬戸口浩彰, 長澤耕樹, 鈴木節子, 久保田渉誠, 佐藤真, 阪口翔太. Identification of the sex-determination region in Callicarpa subpubescens, a plant species acquired a dioecious breeding system in oceanic islands. 日本生態学会大会講演要旨(Web). 2023. 70th
  • 増田和俊, 瀬戸口浩彰, 長澤耕樹, 鈴木節子, 久保田渉誠, 佐藤真, 阪口翔太. 海洋島における雌雄異株化のゲノム基盤:小笠原産ムラサキシキブ属での検証. 日本植物分類学会大会研究発表要旨集. 2023. 22nd
  • 大塚裕斗, 井上みずき, 山崎理正, 高柳敦, 福島慶太郎, 阪口翔太, 藤木大介, 境優, 高橋大樹, 長澤耕樹, et al. Prediction of deer (Cervus nippon) sightings using LightGBM machine learning. 日本生態学会大会講演要旨(Web). 2023. 70th
  • 門脇浩明, 本庄三恵, 中村直人, 北川陽一郎, 石原正恵, 松岡俊将, 立木佑弥, 福島慶太郎, 阪口翔太, 井上みずき, et al. Effects of overbrowsing by sika deer on soil microbial communities: a case study using large-scale deer exclusion fences. 日本生態学会大会講演要旨(Web). 2023. 70th
  • 増田和俊, 瀬戸口浩彰, 長澤耕樹, 沢和浩, 丹後亜興, 坪井勇人, 福本繁, 堀江健二, 平塚健一, 石原正恵, et al. ゼンテイカの分布末端集団における保全遺伝学的研究. 日本植物分類学会大会研究発表要旨集. 2022. 21st (CD-ROM)
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Books (5)：
  • 芦生原生林を歩きつくす:フィールドワーク20年の調査と発見
    ナカニシヤ出版 2021 ISBN:9784779516108
  • 日本における森林樹木の遺伝的多様性と地理的遺伝構造
    2021 ISBN:9784944005321
  • 「中尾佐助 照葉樹林文化論」の展開 - 多角的視座からの位置づけ
    北海道大学出版会 2016 ISBN:9784832968202
  • 地図でわかる 樹木の種苗移動ガイドライン
    2015 ISBN:9784829965245
  • 系統地理学 DNAで解き明かす生きものの自然史
    文一総合出版 2013
Lectures and oral presentations  (4)：
  • 後氷期に起きた系統混合が北方地域におけるハリギリ集団の高い遺伝的多様性を説明する
    (日本森林学会大会学術講演集(CD-ROM) 2013)
  • 針葉樹の集団デモグラフィから探るオーストラリアの最終間氷期最盛期以降の景観変化
    (日本森林学会大会学術講演集(CD-ROM) 2013)
  • 系統進化に伴うニッチの変化は日本におけるツツジ属ミツバツツジ節の多様化を促進したのか?
    (日本生態学会大会講演要旨集 2013)
  • 豪州ヒノキにおける集団デモグラフィの地理的変異はどのように形成されたのか?
    (日本生態学会大会講演要旨集 2013)
Education (3)：
  • 2013 - 現在 Postdoctoral Fellow of JSPS (The University of Tokyo)
  • 2008 - 2013 Kyoto University Graduate School of Agriculture
  • 2004 - 2008 Kyoto University Graduate School of Agriculature
Professional career (1)：
  • PhD. (Kyoto University)
Work history (6)：
  • 2015/11 - 現在 京都大学大学院 人間・環境学研究科 助教
  • 2013/04 - 現在 Postdoctoral Fellow of JSPS (The University of Tokyo)
  • 2010/04 - 2013/03 Research Fellow of JSPS (Kyoto University)
  • 2008/04 - 2013/03 Kyoto University Graduate School of Agriculture
  • 2004/04 - 2008/03 Kyoto University Faculty of Agriculture
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Awards (8)：
  • 2022/08 - (公財)クリタ・水環境科学振興財団 クリタ・水環境科学研究優秀賞 ダムに沈んだ絶滅危惧植物(新種ヤンバルアオヤギバナ)の保全個体群の遺伝的評価
  • 2022/03 - The Japanese Society for Plant Systematics Paper award of Acta Phytotaxonomica et Geobotanica Functional Traits Divergence in Parallelly Evolved Rheophytic Populations of Solidago virgaurea L. Complex (Asteraceae) in Japan
  • 2018/03 - 日本植物分類学会 奨励賞
  • 2013/03 - The Japanese Forest Society 2013 Student Award
  • 2012/03 - Ecological Society of Japan / EAFES 2012 Best Poster Award
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Association Membership(s) (4)：
JAPANESE SOCIETY FOR PLANT SYSTEMATICS ,  THE JAPANESE FORESTRY SOCIETY ,  ECOLOGICAL SOCIETY OF JAPAN ,  Japanese Society of Forest Genetics and Tree Breeding
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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