細胞間の相互作用の解析方法

Inventor： , ,
Applicant, Patent owner：
Agent (5)：稲葉良幸 , 大貫敏史 , 江口昭彦 , 内藤和彦 , 小林綾子
Gazette classification：公開公報
Application number (International application number)：2012213559
Publication number (International publication number)：2013081457
Application date： Sep. 27, 2012
Publication date： May. 09, 2013
Summary：

【課題】本発明は、異なる個体に由来する細胞が共存する系で、細胞間のタンパク質相互作用を網羅的かつ定量的に評価し、重要な相互作用や相互依存性の強いシグナルを同定する解析方法を提供することを目的とする。【解決手段】本発明は、2以上の個体に由来する細胞が共存している微小環境における遺伝子の発現プロファイルを、個体ごとに分類して得る工程と、細胞間で相互作用しうる2つのタンパク質の組合せを選択する工程と、前記発現プロファイルに基づいて、前記タンパク質の組合せの中で、前記2以上の個体の1の個体において、前記タンパク質の一方をコードする遺伝子の発現量がその他の個体より高く、かつ、前記1の個体とは別の個体において、前記タンパク質の他方をコードする遺伝子の発現量がその他の個体より高くなっている場合に、該タンパク質の組合せによる相互作用が、前記2以上の個体に由来する細胞間においてより重要な相互作用であると推測する工程と、を含む、2以上の個体に由来する細胞間におけるタンパク質の相互作用の解析方法を提供する。【選択図】図1

Claim (excerpt)：

2以上の個体に由来する細胞が共存している微小環境における遺伝子の発現プロファイルを、個体ごとに分類して得る工程と、細胞間で相互作用しうる2つのタンパク質の組合せを選択する工程と、前記発現プロファイルに基づいて、前記タンパク質の組合せの中で、前記2以上の個体の1の個体において、前記タンパク質の一方をコードする遺伝子の発現量がその他の個体より高く、かつ、前記1の個体とは別の個体において、前記タンパク質の他方をコードする遺伝子の発現量がその他の個体より高くなっている場合に、該タンパク質の組合せによる相互作用が、前記2以上の個体に由来する細胞間においてより重要な相互作用であると推測する工程と、を含む、2以上の個体に由来する細胞間におけるタンパク質の相互作用の解析方法。

IPC (10)：

C12Q 1/68 , C12M 1/34 , G01N 33/15 , G01N 33/50 , A61K 45/00 , A61K 31/36 , A61K 31/519 , A61K 31/506 , A61P 35/00 , A61P 1/18

FI (10)：

C12Q1/68 Z , C12M1/34 Z , G01N33/15 Z , G01N33/50 Z , A61K45/00 , A61K31/36 , A61K31/519 , A61K31/506 , A61P35/00 , A61P1/18

F-Term (66)：

2G045AA29 , 2G045AA40 , 2G045BA13 , 2G045BB20 , 2G045CB01 , 2G045CB02 , 2G045CB17 , 2G045DA14 , 2G045DA36 , 2G045FB15 , 2G045JA01 , 4B024AA11 , 4B024CA11 , 4B024HA11 , 4B029AA07 , 4B029AA27 , 4B029BB01 , 4B029BB15 , 4B029BB20 , 4B029FA15 , 4B063QA05 , 4B063QA13 , 4B063QA20 , 4C063AA03 , 4C063BB09 , 4C063CC29 , 4C063DD06 , 4C063EE01 , 4C065AA04 , 4C065BB11 , 4C065CC01 , 4C065DD03 , 4C065EE02 , 4C065HH04 , 4C065JJ06 , 4C065KK01 , 4C065LL07 , 4C065PP03 , 4C071AA01 , 4C071AA08 , 4C071BB01 , 4C071BB06 , 4C071CC13 , 4C071DD40 , 4C071EE04 , 4C071FF15 , 4C071GG03 , 4C071HH05 , 4C071HH08 , 4C071JJ01 , 4C071LL01 , 4C084AA17 , 4C084NA14 , 4C084ZA66 , 4C084ZB26 , 4C086AA01 , 4C086AA02 , 4C086BC42 , 4C086CA01 , 4C086CB09 , 4C086GA07 , 4C086GA08 , 4C086MA01 , 4C086MA04 , 4C086ZA66 , 4C086ZB26

Article cited by the Patent：

Cited by examiner (2)

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