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J-GLOBAL ID：201401014621439668
Update date: Nov. 05, 2024
Ogasawara Osamu
Ogasawara Osamu
Affiliation and department：
Job title：
Project Associate Professor
Other affiliations (1)：
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Research Organization of Information and Systems
National Institute of Informatics
Project Associate Professor
Research field (1)：
Biological, health, and medical informatics
Research theme for competitive and other funds (4)：
- 2019 - 2021 Research and development studies to resolve issues related to international data sharing
- 2016 - 2021 Platform for Advanced Genome Science
- 2015 - 2020 インタークラウドを活用したアプリケーション中心型オーバーレイクラウド技術に関する研究
- 2009 - 2010 Development of a classification system for data analysis methods based on natural language processing and collective intelligence
Papers (38)：
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Yuichi Kodama, Takeshi Ara, Asami Fukuda, Toshiaki Tokimatsu, Jun Mashima, Takehide Kosuge, Yasuhiro Tanizawa, Tomoya Tanjo, Osamu Ogasawara, Takatomo Fujisawa, et al. DDBJ update in 2024: the DDBJ Group Cloud service for sharing pre-publication data. Nucleic acids research. 2024
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Takeshi Ara, Yuichi Kodama, Toshiaki Tokimatsu, Asami Fukuda, Takehide Kosuge, Jun Mashima, Yasuhiro Tanizawa, Tomoya Tanjo, Osamu Ogasawara, Takatomo Fujisawa, et al. DDBJ update in 2023: the MetaboBank for metabolomics data and associated metadata. Nucleic acids research. 2023
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Osamu Ogasawara. Building cloud computing environments for genome analysis in Japan. Human Genome Variation. 2022
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Yasuhiro Tanizawa, Takatomo Fujisawa, Yuichi Kodama, Takehide Kosuge, Jun Mashima, Tomoya Tanjo, Yasukazu Nakamura. DNA Data Bank of Japan (DDBJ) update report 2022. Nucleic acids research. 2022. 51. D1. 1
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Hirotaka Suetake, Tomoya Tanjo, Manabu Ishii, Bruno P. Kinoshita, Takeshi Fujino, Tsuyoshi Hachiya, Yuichi Kodama, Takatomo Fujisawa, Osamu Ogasawara, Atsushi Shimizu, et al. Sapporo: A workflow execution service that encourages the reuse of workflows in various languages in bioinformatics. F1000Research. 2022. 11. 889-889
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MISC (2)：
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神沼英里, 神沼英里, 藤澤貴智, 林史, 中村保一, 高木利久, 瀬々潤, 小笠原理. ディープラーニングを用いたDNA配列からの微生物生態属性値の予測. 日本ゲノム微生物学会年会要旨集. 2018. 12th
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神沼英里, 藤澤貴智, 林史, 西澤達也, 中村保一, 小笠原理. 機械学習によるDNA配列からのBioSample生態関連属性値の注釈予測. 日本微生物生態学会大会(Web). 2017. 2017
Books (2)：
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実験医学 2022年4月号 Vol.40 No.6 遺伝研スーパーコンピュータシステムの利用方法
羊土社 2022
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実験医学 2022年4月号 Vol.40 No.6 スパコン・クラウドを生命科学に使う〜ペタバイト時代を生き抜くためのシステム整備とデータ活用事例
羊土社 2022
Works (1)：
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