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J-GLOBAL ID：201401042418932689
Update date: Nov. 11, 2024
Daichi Morimoto
モリモト ダイチ | Daichi Morimoto
Affiliation and department：
Job title：
Assistant Professor
Homepage URL (1)：
http://www.moleng.kyoto-u.ac.jp/~moleng_01/
Research field (5)：
Structural biochemistry
, Biophysics
, Molecular biology
, Bio-, chemical, and soft-matter physics
, Cell biology
Research keywords (4)：
Rheo-NMR
, Ubiquitin
, Biophysics
, Structural Biology
Research theme for competitive and other funds (22)：
- 2023 - 2030 生体内の流れによるタンパク質の構造破壊の理解
- 2022 - 2026 Development of analytical platform for proteins in electric field and its application
- 2024 - 2025 タンパク質の細胞内再利用の絶対定量による新規細胞診断技術の開発
- 2022 - 2025 ユビキチン鎖の形状とストレス顆粒に関わる物性との関係の解明
- 2021 - 2024 Elucidation of the mechanism of amyloid fibrillation of alpha-synuclein starting from liquid-liquid phase separation
- 2022 - 2023 可逆的酵素反応によるユビキチンの細胞内再利用の定量的分析
- 2022 - 2023 血漿タンパク質フォン・ヴィレブランド因子の食塩濃度に依存した力学応答の原子レベル解析
- 2020 - 2022 Elucidation of physical properties and intracellular functions of unanchored atypical ubiquitin chains
- 2021 - 2022 止血タンパク質フォン・ヴィレブランド因子の流体力学的ストレスによる構造変化の解析
- 2018 - 2021 Velocity imaging of turbulence flow using Rheo-NMR
- 2020 - 2021 神経変性疾患に関与する異常タンパク質凝集体の形成を制御する天然化合物の探索
- 2016 - 2020 Analysis of structure and formation mechanism of polyubiquitin fibrils
- 2018 - 2019 筋萎縮性側索硬化症原因タンパク質SOD1のアミロイド形成機序の解明
- 2018 - 2019 世界高感度バイオレオロジーNMRの開発と応用
- 2018 - 2019 細胞内環境下におけるタンパク質の薬剤認識機構の解明
- 2017 - 2019 世界最高感度レオロジーNMRの開発と応用
- 2017 - 2018 世界最高感度レオロジーNMRの開発と応用
- 2016 - 2017 Elucidation of formation mechanism of polyubiquitin fibrils by Rheo-NMR
- 2016 - 2017 神経変性疾患の脳内異常タンパク質凝集体形成機構解明
- 2016 - 2017 細胞内NMR測定によるタンパク質の構造安定性の解明
- 2014 - 2015 ユビキチン様タンパク質修飾に伴う構造不安定化の機構解明
- 2011 - 2013 新規ポリユビキチン鎖の構造および形成機構の解明
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Papers (47)：
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Daichi Morimoto, Erik Walinda. A fast and simple automated multi-step protein purification method for ÄKTA go systems. Protein Expression and Purification. 2024. 223. 106560-106560
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Tomoki Sorada, Erik Walinda, Daichi Morimoto. Cyclization of ubiquitin chains reinforces their recognition by ZNF216. FEBS Letters. 2024
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Tomoki Sorada, Erik Walinda, Masahiro Shirakawa, Kenji Sugase, Daichi Morimoto. An integrated approach of NMR experiments and MD simulations visualizes structural dynamics of a cyclic multi-domain protein. Protein Science. 2023
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Yusuke Shuto, Erik Walinda, Daichi Morimoto, Kenji Sugase. Conformational Fluctuations and Induced Orientation of a Protein, Its Solvation Shell, and Bulk Water in Weak Non-Unfolding External Electric Fields. The Journal of Physical Chemistry B. 2023
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Erik Walinda, Kenji Sugase, Naoki Ishii, Masahiro Shirakawa, Kazuhiro Iwai, Daichi Morimoto. Solution structure of the HOIL-1L NZF domain reveals a conformational switch regulating linear ubiquitin affinity. Journal of Biological Chemistry. 2023. 105165-105165
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MISC (6)：
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真鼻裕, 岩川直都, 尾野有菜, 大木出, ヴァリンダ エリック, 森本大智, 菅瀬謙治, 白川昌宏. シロイヌナズナ由来のタンパク質MBD6によるメチル化DNA認識の構造基盤. 日本細胞生物学会大会(Web). 2019. 71st
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真鼻裕, 岩川直都, 尾野有菜, 大木出, WALINDA Erik, 森本大智, 菅瀬謙治, 白川昌宏. シロイヌナズナのDNA結合タンパク質MBD6の構造解析. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2018. 41st
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森本 大智, ヴァリンダ・エリック, 深田 はるみ, 菅瀬 謙治, 蔭山 俊, 星野 大, 難波 啓一, 小松 雅明, 田中 啓二, 白川 昌宏. タンパク質の構造破綻とその関連疾患 物性化学から臨床まで 細胞内におけるユビキチン陽性タンパク質凝集体の形成機構の解明. 日本生化学会大会プログラム・講演要旨集. 2016. 89回. [1S07-3]
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森本大智, WALINDA Erik, 菅瀬謙治, 深田はるみ, 曽友深, 蔭山俊, 蔭山俊, 星野大, 藤井高志, 土屋光, et al. ユビキチン化に伴うタンパク質構造不安定化. Abstracts. Annual Meeting of the NMR Society of Japan. 2014. 53rd
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森本 大智, 磯貝 信, 阿部 翔吾, 有田 恭平, 雲財 悟, 天野 剛志, 有吉 眞理子, 杤尾 豪人, 小松 雅明, 田中 啓二, et al. p62 UBAドメインのユビキチン認識機構の構造学的研究. 日本生化学会大会プログラム・講演要旨集. 2009. 82回. 3P-449
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Patents (1)：
Books (8)：
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In situ observation of protein aggregation by Rheo-NMR spectroscopy
Low Temperature Materials Sciences 2024
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NMR によるアミロイド形成の原子レベル機構解明
日本核磁気共鳴学会 2023
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タンパク質の構造解析手法とIn silicoスクリーニングへの応用事例
技術情報協会 2023 ISBN:9784861049712
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NMRによる有機材料分析とその試料前処理、データ解釈
技術情報協会 2021 ISBN:9784861048609
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高感度Rheo-NMRによるアミロイド線維化過程のその場観察
北隆館 2019
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Lectures and oral presentations (25)：
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生体内の流れによるタンパク質の構造破壊
(第1回CCC講演会 2023)
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生体内環境がタンパク質凝集に与える影響
(第8回生体分子凝縮体勉強会 2023)
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Elucidation of structural dynamics of a cyclic multi-domain protein by an integrated approach of NMR relaxation experiments and coarse-grained MD simulations
(2023)
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Atomic-level elucidation of amyloid formation mechanism by NMR spectroscopy
(第61回NMR討論会 2022)
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レオロジーNMR法によるSOD1アミロイド形成の多状態その場観察
(第60回日本生物物理学会年会 2022)
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Education (3)：
- 2011 - 2015 Kyoto University Graduate School of Engineering Department of Molecular Engineering
- 2009 - 2011 Kyoto University Graduate School of Engineering Department of Molecular Engineering
- 2005 - 2009 Kyoto University Faculty of Engineering Industrial Chemistry
Professional career (1)：
- PhD in Engineering (Kyoto University)
Work history (2)：
- 2014/09 - 現在 Kyoto University Department of Engineering Assistant Professor
- 2014/04 - 2014/08 Graduate School of Engineering, Kyoto University Researcher
Committee career (5)：
- 2017/10 - 現在 蛋白質科学会アーカイブ編集委員会 編集委員
- 2016/08 - 現在 京都大学 環境安全保健機構 低温物質管理部門 寒剤供給専門小委員会
- 2021/09 - 2021/09 第21回若手NMR研究会 世話人
- 2020/12 - 2020/12 量子生命科学会・第2回大会 委員長
- 2015/12 - 2015/12 RRR workshop 2015 世話人
Awards (7)：
- 2022/11 - The Nuclear Magnetic Resonance Society of Japan Young Scientist Award
- 2022/06 - Protein Science Society of Japan Young Scientist Award
- 2015/09 - The Biophysical Society of Japan Early Career Presentation Award
- 2014/11 - The Nuclear Magnetic Resonance Society of Japan Young scientist travel award
- 2014/11 - The Nuclear Magnetic Resonance Society of Japan JEOL RESONANCE award at the 53rd Annual Meeting of the NMR Society of Japan
- 2013/12 - New aspect of ubiquitin system: its enormous roles in protein regulation Oral presentation award at the new aspect of the ubiquitin system conference
- 2011/08 - Graduate School of Engineering, Kyoto University Mazume Research Encouragement Prize
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Association Membership(s) (3)：
Protein Science Society of Japan
, The Biophysical Society of Japan
, The Nuclear Magnetic Resonance Society of Japan
