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J-GLOBAL ID：201401052506561394   Update date: Apr. 11, 2024

Seno Shigeto

セノオ シゲト | Seno Shigeto
Affiliation and department：
Osaka University Graduate School of Information Science and Technology Department of Bioinformatic Engineering

About Osaka University Graduate School of Information Science and Technology Department of Bioinformatic Engineering


Homepage URL  (1)： http://www.ist.osaka-u.ac.jp/japanese/introduction/professors/bioinformatic-engineering/genome-information-engineering/shigeto-seno.html
Research field  (2)： Biological, health, and medical informatics ,  Systems genomics
Research keywords  (9)： 発現プロファイル ,  バイオインフォマティクス ,  類似構造探索 ,  遺伝子発現解析 ,  ゲノム ,  生物情報学 ,  トランスクリプトーム解析 ,  生体イメージング ,  細胞トラッキング
Research theme for competitive and other funds  (23)：
  • 2022 - 2025 骨イメージングではじめる動的多細胞コミュニティ学
  • 2022 - 2025 細胞動画像とオミクスデータの統合による細胞コミュニティの解析手法の開発
  • 2022 - 2025 Establishment of intraoperative surgical margin assessment using human live tissue in breast conserving surgery
  • 2022 - 2025 時空間情報を統合した1細胞発現解析手法の開発
  • 2022 - 2024 The study on the brown adipose tissue-derived novel factors which are related to the regulation of muscle regeneration
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Papers (124)：
  • Jotaro Tachino, Shigeto Seno, Hisatake Matsumoto, Tetsuhisa Kitamura, Atsushi Hirayama, Shunichiro Nakao, Yusuke Katayama, Hiroshi Ogura, Jun Oda. Association between tranexamic acid administration and mortality based on the trauma phenotype: a retrospective analysis of a nationwide trauma registry in Japan. Critical care (London, England). 2024. 28. 1. 89-89
  • Tomonori Tanei, Shigeto Seno, Yoshiaki Sota, Takaaki Hatano, Yuri Kitahara, Kaori Abe, nanae masunaga, Masami Tsukabe, Tetsuhiro Yoshinami, Tomohiro Miyake, et al. High HER2 Intratumoral Heterogeneity Is a Predictive Factor for Poor Prognosis in Early-Stage and Locally Advanced HER2-Positive Breast Cancer. Cancers. 2024
  • Kazufumi Hosoda, Shigeto Seno, Rikuto Kamiura, Naomi Murakami, Michio Kondoh. Biodiversity and Constrained Information Dynamics in Ecosystems: A Framework for Living Systems. Entropy. 2023
  • Kazufumi Hosoda, Shigeto Seno, Naomi Murakami, Hideo Matsuda, Yutaka Osada, Rikuto Kamiura, Michio Kondoh. Synthetic model ecosystem of 12 cryopreservable microbial species allowing for a noninvasive approach. Bio Systems. 2023. 235. 105087-105087
  • Toru Nagamura, Shigeto Seno, Hironori Shigeta, Tomohiro Mashita, Hideo Matsuda. Cell Tracking via Reinforcement Learning with Microscopic Image Simulator. Proceedings of the 2023 13th International Conference on Biomedical Engineering and Technology. 2023
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MISC (21)：
  • 舘野 丈太郎, 松本 寿健, 戸上 由貴, 松原 庸博, 瀬尾 茂人, 小倉 裕司, 織田 順. 血漿プロテオミクスプロファイルによる体幹部外傷と外傷性脳損傷の比較 前向きコホート研究. 日本救急医学会雑誌. 2023. 34. 12. 641-641
  • 川原崎 聡子, 瀬尾 茂人, 鄭 惠芬, 高橋 春弥, 野村 亘, 神戸 大朋, 松田 秀雄, 井上 和生, 河田 照雄, 後藤 剛. レポーター前駆脂肪細胞株を用いた新規UCP1発現調節遺伝子の探索. 肥満研究. 2022. 27. Suppl. 338-338
  • 藤原奈央子, 藤田賢一, 藤田賢一, 瀬尾茂人, 増田誠司, 増田誠司. Activity and substrate preference of the human nuclear exosome complex is modulated via association with specific cofactors. 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web). 2022. 2022
  • 戸上由貴, 松本寿健, 松原庸博, 蛯原健, 石川昌和, 杉原文徳, 瀬尾茂人, 奥崎大介, 平田陽彦, 小倉裕司. Pathogenesis of severe COVID-19 by whole blood mRNA/miRNA network analysis. 日本集中治療医学会学術集会(Web). 2022. 49th
  • 杉元啓悟, 藤原奈央子, 瀬尾茂人, 増田誠司. The analysis of polyA+RNA targeted for degradation of nuclear exosome. 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web). 2021. 2021
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Patents (2)：
  • 評価方法、評価装置およびプログラム
  • マルチプレックス大腸がんマーカーパネル
Books (2)：
  • 医学のあゆみ 生体イメージングの最前線-絶え間ない技術革新と生命医科学の新展開
    医歯薬出版 2023
  • 骨格筋の維持機構を暴き、サルコペニアに挑む!
    羊土社 2020
Lectures and oral presentations  (200)：
  • 細胞動画像とオミクスデータの統合的情報解析方法の開発への取り組み
    (第46回 日本基礎老化学会大会 2023)
  • バイオインフォマティクスツールのエコシステム
    (NGS EXPO 2022 2022)
  • 細胞動画像とオミクスデータの統合による細胞コミュニティの解析手法の開発
    (学術変革(B)「セルコミュニティ」キックオフミーティング 2022)
  • 1細胞発現解析と細胞画像処理,またその共同研究について
    (大阪大学医学系研究科 第3回バイオインフォマティクスセミナー 2022)
  • 生命科学データの情報処理について
    (化学工学会 第52回秋季大会 2021)
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Education (3)：
  • 2003 - 2006 Osaka University Graduate School of Information Science and Technology Department of Bioinformatic Engineering
  • 2001 - 2003 Osaka University Graduate School of Engineering Science
  • 1997 - 2001 Osaka University School of Engineering Science Direct Affiliates Department of Information and Computer Sciences
Professional career (1)：
  • 博士(情報科学) (大阪大学)
Work history (8)：
  • 2023/07 - 現在 大阪大学蛋白質研究所 蛋白質先端データ科学研究センター(兼任)
  • 2023/07 - 現在 大阪大学微生物病研究所 バイオインフォマティクスセンター(兼任)
  • 2023/04 - 現在 脳情報通信融合研究センター(兼任)
  • 2018/04 - 現在 大阪大学データビリティフロンティア機構(兼任)
  • 2017/11 - 現在 Osaka University Graduate School of Information Science and Technology
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Committee career (12)：
  • 2024/04 - 現在 情報処理学会, バイオ情報学(BIO)研究会 運営委員
  • 2024/04 - 現在 情報処理学会, 数理モデル化と問題解決(MPS)研究会 編集委員
  • 2022/03 - 現在 NGS EXPO ファシリテーター
  • 2020 - 現在 ICBBE Technical Program Comittee
  • 2014/07 - 現在 Mathematical Modeling and Problem Solving”Satellite Workshop; International Conference on Parallel & Distributed Processing Techniques & Applications プログラム委員
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Awards (9)：
  • 2023/10 - Chem-Bio Informatics Society Excellent Poster Award A Graph Based Method of Pattern Mining for Spatial Transcriptome Data
  • 2022/11 - KICSS2022 Best Crowd Award Simulating reaction time for Eureka effect in visual object recognition using artificial neural network
  • 2021/03 - Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry The Excellent Paper Award Published in Bioscience, Biotechnology, & Biochemistry Long non-coding RNA 2310069B03Rik functions as a suppressor of Ucp1 expression under prolonged cold exposure in murine beige adipocytes
  • 2014/07 - 大阪大学 大阪大学総長奨励賞(研究部門)
  • 2014/06 - 情報処理学会 情報処理学会論文賞(IPSJ Outstanding Paper Award)
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Association Membership(s) (2)：
JAPANESE SOCIETY FOR BIOINFORMATICS ,  INFORMATION PROCESSING SOCIETY OF JAPAN
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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